コフィン・シリス症候群はNIPTでわかる？いつわかるか・遺伝する確率と、インペリアルプランで調べられる原因遺伝子

「コフィン・シリス症候群は、妊娠中にわかるのだろうか」。上のお子さんが診断を受けた、ご家族にこの病気の方がいる、NIPTのプランを比べていて病名を目にした――そうした方が抱く疑問です。結論からいうと、コフィン・シリス症候群は妊娠中のエコーでは気づかれないことが多い病気で、出生前に手がかりになるのは遺伝子です。当院のインペリアルプランでは、原因遺伝子のうちARID1B・ARID1A・SMARCA4・SMARCB1・SMARCE1を調べられます。ただし、今わかっている原因遺伝子に変化が見つからない方も多く、対象の遺伝子でもすべての変化を見つけられるとは限りません。

東京・北青山の当院で受けられるNIPTのプランと、それぞれで調べられる範囲は、東京のNIPT（新型出生前診断）のページにまとめています。

コフィン・シリス症候群とは？ ― 妊娠中に知っておきたい基本

コフィン・シリス症候群とは、遺伝子の働きを調節するしくみ（BAF複合体）にかかわる遺伝子の変化で起こる、生まれつきの病気です[1][4]。発達の遅れや知的障害、顔つきの特徴、手足の小指（第5指）の爪や指先の骨が小さいことなどが主な特徴です[1]。おおまかな推定では10万出生に1人程度とされますが、診断がついていない方も多く、実際にはもっと多いと考えられています[1]。日本では指定難病（告示番号185）です[4]。

• ➤発達の遅れ・知的障害：ほとんどの方にみられ、程度には幅があります。知的な遅れが目立たない方の報告もあります[1]。
• ➤食べることの難しさ：哺乳や食事の難しさは多くの方にみられます[1]。
• ➤心臓の病気：約3分の1の方に報告されています[1]。
• ➤小指の爪や指先の骨が小さい：特徴の一つですが、遺伝子で診断された方の中には、ほとんど目立たない方もいます[1]。

症状・診断・治療・経過など病気そのものについては、コフィン・シリス症候群の解説と、いちばん多い型のコフィン・シリス症候群1型（ARID1B関連）の解説にまとめています。このページでは、妊娠中にわかるのか、どうやって調べるのかに絞ってお話しします。

知的障害や発達の遅れ、自閉スペクトラム症の特徴を伴うことがある

コフィン・シリス症候群では、知的障害や発達の遅れに加えて、自閉スペクトラム症（またはその特徴）がみられることがあります。報告によっては最大で44%の方にみられたとされ、年齢によっては実際より少なく見積もられている可能性も指摘されています[1]。注意欠如・多動症（ADHD）の特徴がみられることもあります[1]。

つまりこの病気は、自閉症・発達障害・知的障害の原因の一部として、NIPTのプラン選びにかかわる病気です。どのプランで何がわかるかは、後半の「自閉症・発達障害・知的障害もNIPTで一部わかる」の章で表にまとめました。

コフィン・シリス症候群はいつわかる？妊娠中のエコーで気づかれにくい理由

先に答えをいうと、コフィン・シリス症候群は妊娠中のエコーで気づかれないことが多く、多くは生まれたあとの症状をきっかけに、遺伝子検査で診断されます[1][2]。

多くの赤ちゃんは、エコーで目立つ所見がない

2025年に報告された文献のまとめでは、コフィン・シリス症候群の多くの方は、妊娠中のエコーで異常がなかったとされています[2]。報告されている所見は、主に横隔膜ヘルニア、先天性心疾患、胎児発育不全で、ARID1Bが原因の場合は、脳梁欠損などの脳の所見がいちばん多いとされています[2]。

エコーで気づかれにくい理由は、この病気の中心になる特徴が、エコーに写る「形」の変化ではないからだと考えています。発達の遅れや知的障害は、生まれてから時間をかけて明らかになるものです。小指の爪のような小さな特徴も、妊娠中のエコーで見て判断する項目ではありません。病名の診断は、症状のあるお子さんで遺伝子の変化を確かめて行います[1]。生まれたあとの遺伝子検査は、コフィン・シリス症候群NGS遺伝子パネル検査で解説しています。

妊娠中にわかった報告では、脳梁欠損が手がかりに

遺伝子検査でコフィン・シリス症候群と確かめられた胎児8例をまとめた2022年の報告では、2例は妊娠初期にNT（首の後ろのむくみ）が厚く、6例は妊娠中期のエコーで所見が見つかりました。妊娠中期にエコーを受けた7例のうち5例（71.4%）に脳梁欠損がみられ、そのうち4例は脳梁欠損だけが見つかっていました[3]。

ただし、これはエコーに所見があって遺伝子を調べた赤ちゃんを集めた報告で、コフィン・シリス症候群の赤ちゃん全体に当てはまる数字ではありません。脳梁欠損はほかの多くの病気でもみられ、脳梁欠損があってもコフィン・シリス症候群とは限りません。報告の著者は、妊娠中のエコーで脳梁欠損が見つかったときに、コフィン・シリス症候群も考える病気の一つに入れるよう述べています[3]。

「エコーで何も言われなかった」ことの意味

エコーで何も言われなかったことは安心材料の一つですが、コフィン・シリス症候群ではないという意味にはなりません。この病気は、多くの場合、遺伝子を調べなければ妊娠中にはわからない病気です。だからNIPTで原因遺伝子を調べるのは、まだエコーで何も言われていないけれど心配という方のための選択肢だと位置づけています。エコーで形の異常がすでに見つかっている場合は、NIPTではなく確定検査が基本です（後半の章）。

コフィン・シリス症候群はNIPTでわかる？ ― インペリアルプランで調べられる原因遺伝子

当院のNIPTでは、インペリアルプランで、コフィン・シリス症候群の原因遺伝子の多くを調べられます。ダイヤモンドプランと、単一遺伝子を調べないスタンダードプラン・プレミアムプラン・双子マックスプランでは調べません。型ごとの原因遺伝子と、当院のプランの対象を表にまとめました。

インペリアルプランが対象、ダイヤモンドプランは対象外

いちばん多い原因のARID1B（約37%）をはじめ、表の5つの遺伝子は、インペリアルプラン（最大155遺伝子・202疾患、低深度全ゲノムシーケンス＋ターゲット法）の遺伝子リストに入っています。一方、ダイヤモンドプラン（56遺伝子）には、コフィン・シリス症候群の原因遺伝子は入っていません。ダイヤモンドプランを選んでも、コフィン・シリス症候群は調べられないので、プランを選ぶときに確かめてください。2つのプランの違いはインペリアルプランとダイヤモンドプランの違い、155遺伝子の内容は155遺伝子de novo変異NIPTで確認できます。

エコーより早い時期に結果がわかる

当院のNIPTは妊娠9週から受けられます。インペリアルプランの単一遺伝子の結果は3〜4週間で出るので、妊娠9週に採血した場合は妊娠12〜13週ごろに結果がわかる計算です。妊娠中にコフィン・シリス症候群がわかった報告の多くが妊娠中期のエコーをきっかけにしていたこと[3]と比べると、早い時期に、エコーでは見えない遺伝子の変化を調べられる点がNIPTの役割です。

NIPTでわかること・わからないこと

当院のインペリアルプランの検証データ（遺伝的な病気のリスクが高い妊婦さん750例、155遺伝子・202疾患）では、新しく起こった遺伝子の変化（de novo変異）を調べるNIPTの成績は、陽性的中率96.9%・感度100%・特異度99.9%と報告されています[5]。リスクの高い妊婦さんでの数字で、一般の妊婦さんにそのまま当てはまるものではありません。精度の考え方はNIPTの精度（陽性的中率）で解説しています。

こうした単一遺伝子の病気は1つひとつはまれですが、わずか30遺伝子・25疾患を合わせただけでも約600人に1人（0.17%）の頻度になると報告されています[6][7]。これは30の遺伝子に絞って調べた研究での数字なので、実際にはこれより多いと考えています。ダウン症候群の出生頻度（米国の全国推計〔2004〜2006年の出生〕で約700人に1人）より多い頻度です[8]。

超音波検査で赤ちゃんの異常が疑われた妊婦さんを対象にした研究では、染色体の検査に加えて単一遺伝子の病気も調べると、見つかった病気の数が約1.6倍（61件→98件、60.7%増）に増えたと報告されています[9]。

自閉症・発達障害・知的障害もNIPTで一部わかる ― 当院で調べられること

お子さんの発達を心配するのは自然なことです。自閉症・発達障害・知的障害の原因はさまざまで、多くは一つに決められませんが、一部は染色体や遺伝子の変化が原因だとわかっています。コフィン・シリス症候群もその一つで、当院のNIPTは、こうした原因の一部をプランに応じて調べられます。

正直にお伝えしたい限界もあります。陰性でも、自閉症・発達障害・知的障害がないとは言えません。脆弱X症候群のようにNIPTで調べられない原因もあり、原因がわからないことも多いからです。微小欠失・重複の陽性的中率は、染色体の数の異常より低め（項目によって60〜70%程度）で、陽性なら必ず確定検査で確かめます。症状の出方や程度は、NIPTではわかりません。

どの病気がどのプランで調べられるかは、自閉症はNIPTでわかる？出生前診断でわかる発達障害の原因でもくわしく解説しています。微小欠失症候群については微小欠失症候群をご覧ください。

検査は「値段」ではなく「調べられる範囲」で選ぶ ― 1つの病気あたりで考えると

「ダウン症候群だけが心配」という方は少なくありません。けれども、出生前検査で調べる病気は、どれも赤ちゃんとご家族の暮らしに大きくかかわるものです。そして、ご家族の子育ての負担を最も大きく左右するのは、知的障害の程度よりも、攻撃的な行動や自傷、睡眠の問題といった「行動の問題」だと分かっています[12]。こうした行動の問題を伴いやすい病気には、ダウン症候群ではなく、微小欠失症候群や単一遺伝子疾患が多く含まれます[12][13]。三大トリソミーだけを調べる検査では、これらの病気は調べられません。

出生前検査は、その後の人生を左右するかもしれない検査です。『安さ』だけで選んで大丈夫でしょうか。

三大トリソミーだけを調べる検査を仮に10万円とすると、1つの病気あたりは約3万3千円です。

当院のインペリアルプランは、全常染色体と性染色体の数の異常、92種類の微小欠失・重複、202の単一遺伝子疾患を調べます。性染色体の数の異常も含めて、数えられる病気だけで320になり、1つの病気あたりは約1,719円です。さらに、5Mbを超える欠失・重複はすべての染色体が対象なので、数えきれないほどの変化を調べていることになります。数えられる分だけでも、これだけの範囲を調べられます。

※価格は事前学習動画を見て来院した場合の当日割引後の税込価格です。最新の料金は料金ページをご確認ください。※病気の数は、数の異常・微小欠失・重複・単一遺伝子疾患を1つずつ数えたものです。性染色体の数の異常は4種類（ターナー症候群・クラインフェルター症候群・トリプルX症候群・XYY症候群）として数えています（性染色体を調べるのはスタンダード・プレミアム・ダイヤモンド・インペリアル。双子マックスは調べません）。5Mbを超える構造異常は数に入れていないため、双子マックスとインペリアルは実際にはさらに多くの変化を調べています。※『三大トリソミーだけを調べる検査』は計算のための仮の例で、特定の施設の価格ではありません。

病気の数が多いほどよい検査、というわけではありません。調べる範囲が広がるほど、陽性になる可能性も、確定検査が必要になる場面も増えます。コフィン・シリス症候群まで調べたいならインペリアルプランが対象になりますが、どこまで調べたいかはご家族によって違うので、検査前の遺伝カウンセリングでプランを選ぶことが大切だと考えています。最新の料金はNIPTの費用・料金のページでご確認ください。

家族にいなくても起こる？コフィン・シリス症候群の遺伝と次の子の確率

コフィン・シリス症候群は常染色体顕性遺伝の病気ですが、ほとんどは赤ちゃんで新しく起こった遺伝子の変化によるものです[1]。親から受け継ぐ家系はまれだとされています[1]。

ほとんどは赤ちゃんに新しく起こる変化（de novo）

ご両親にはなく、赤ちゃんで新しく起こった変化をde novo変異といいます。家族に同じ病気の方がいなくても、どのご家族にも起こりうるものです。de novo変異は、一般にお父さんの年齢が上がるほど増えることが知られています[10]。ただし、コフィン・シリス症候群について、お父さんの年齢でどれだけ増えるかを示した数字は確かめられていません。父親の年齢とde novo変異の関係は単一遺伝子疾患とNIPTでまとめています。

上のお子さんがコフィン・シリス症候群のとき

上のお子さんの変化が新しく起こったものなら、次のお子さんの確率は低いとされています[4]。ただし、親の卵子や精子の一部にだけ同じ変化がある性腺モザイクの可能性があるため、0ではありません。上のお子さんの変化がわかっていれば、次の妊娠でその変化を目印に、絨毛検査や羊水検査で赤ちゃんを調べることができます[1]。NIPTを組み合わせるか、どの検査をいつ受けるかは、検査前の遺伝カウンセリングで、ご家族の状況に合わせて選びます。

親御さんがコフィン・シリス症候群のとき

親御さんがこの病気の場合、お子さんに伝わる確率は妊娠ごとに2分の1です[4]。

お父さんが当事者の場合、お父さん由来の変化はお母さんの血液にないため、NIPTで見つかれば赤ちゃんが受け継いだものと判断しやすくなります。ただしNIPTはスクリーニング検査なので、確定検査で確かめます。調べられるのは、プランの遺伝子リストに入っている遺伝子だけです。くわしくはお父さんが単一遺伝子疾患のときのNIPTをご覧ください。

お母さんが当事者の場合、お母さん自身が変化を持っているため、通常のNIPTでは、見つかった変化がお母さん由来か赤ちゃん由来かを区別できません。時間的な余裕があれば、まずお母さん本人の遺伝子検査で変化を特定します。妊娠週数などで余裕がないときは、NIPTで対象の変化があるかを確かめることがあります。このときのNIPTは、赤ちゃんが受け継いだかを判定するためではなく、確定検査で調べる目印を把握するためのものです。そのうえで、その変化を目印に、絨毛検査（妊娠11〜13週）か羊水検査（妊娠15週から）で赤ちゃんを調べます。

コフィン・シリス症候群は原因の遺伝子が多く、変化の種類もさまざまなので、NIPTでお母さんの変化を決められるとは限りません。基本は、妊娠前にお母さんの変化を特定しておくことです。それでも、親の病気とは別に、赤ちゃんに新しく起こる単一遺伝子の病気もあるので、NIPTは基本的に受けたほうがよいと考えています。流れは単一遺伝子疾患のあるお母さんへ｜NIPTと確定検査でわかることでくわしく解説しています。

エコーで脳梁欠損などを言われたら・NIPTで陽性だったら ― 確定検査と次の一歩

エコーで所見を言われた場合も、NIPTで陽性だった場合も、赤ちゃんに病気があるかを確かめるのは確定検査（絨毛検査・羊水検査）です。

エコーで形の異常が見つかったら、確定検査が基本

エコーで脳梁欠損などの形の異常がすでに見つかっている場合は、NIPTではなく確定検査が基本です。脳梁欠損が見つかった胎児の報告では、染色体のマイクロアレイ検査と、遺伝子を広く調べる解析の両方を選択肢にすることが勧められています[3]。羊水でマイクロアレイ検査をするなら、妊娠18週くらいが適していると考えています。当院では確定検査まで院内で受けられ、主要な検査項目は3日以内に、マイクロアレイ検査は2週間ほどで結果が出ます。どこまで調べるかは、検査前の遺伝カウンセリングで一緒に考えます。

インペリアルプランで陽性だったら

NIPTで陽性だった場合は、絨毛検査（妊娠11〜13週）か羊水検査（妊娠15週から）で確かめます。NIPTで見つかった変化を目印にした遺伝子の解析も、3日以内に結果が出る主要な検査項目に含まれます。当院の確定検査は基本的に日曜日（月曜日が祝日のときは月曜日）に行っています。陽性後の遺伝カウンセリングは何度でも無料で、確定検査の費用は互助会（カトレア会）で補助します。2つの検査の違いは絨毛検査と羊水検査の違い、他院で陽性になった方も含めた流れはNIPT陽性後の確定検査で解説しています。

遺伝カウンセリングで考えること

確定検査で診断がついたときに大切なのは、結果をどう生かすかです。心臓の病気や、生まれてすぐの哺乳の難しさに備えた出産施設の選び方など、生まれる前から準備できることもあります。結果の受け止め方や、その後の選択は、遺伝カウンセリングで臨床遺伝専門医とご家族の状況に合わせて考えます。

ミネルバクリニックでコフィン・シリス症候群まで調べるには ― 受ける時期と流れ

当院のNIPTは妊娠9週から受けられ、妊娠6〜8週は臨床研究として受けられます。受けられる時期の上限は設けていません。ただし、人工妊娠中絶ができるのは通常妊娠満22週未満です[11]。受ける時期と結果の生かし方は、検査前の遺伝カウンセリングで一緒に考えます。受けられる時期についてはNIPTはいつからいつまで受けられる？をご覧ください。

結果は基本10〜14日ですが、インペリアルプランの単一遺伝子の結果だけは3〜4週間かかります。料金はプランごとにNIPTの費用・料金のページでご確認ください。NIPTの料金には、臨床遺伝専門医の遺伝カウンセリング、NIPTでの性別判定、来院の場合の4Dエコーが含まれます。NIPTを受ける方は全員、2つの互助会（確定検査の費用を補助するカトレア会と、安心検査結果保障制度）に加入します。

来院が難しい方は、Zoomでの遺伝カウンセリングと全国110か所の提携施設での採血を組み合わせたオンラインNIPTも利用できます。オンラインの遺伝カウンセリングの料金は事前のお支払いです。

よくある質問（FAQ）

関連記事

参考文献

• [1] Coffin-Siris Syndrome. GeneReviews® [Internet]. Seattle (WA): University of Washington, Seattle. Initial Posting: 2013 Apr 4; Last Update: 2025 May 15. [NCBI Bookshelf NBK131811]
• [2] Prenatal Diagnosis of 6q Terminal Deletion Associated with Coffin–Siris Syndrome: Phenotypic Delineation and Review. Genes. 2025;16(11):1365. [DOI 10.3390/genes16111365]
• [3] Prenatal diagnosis of Coffin-Siris syndrome: What are the fetal features? Prenat Diagn. 2022. [PubMed 35801292]
• [4] 難病情報センター. コフィン・シリス症候群（指定難病185）. [難病情報センター]
• [5] Expanded noninvasive prenatal screening for dominant single-gene disorders: proof-of-concept, performance, and challenges. Am J Obstet Gynecol. 2025;233(6):673.e1-673.e21. [PubMed 40550458]
• [6] Ultrasound Obstet Gynecol. 2022;59(1):33-39. [DOI 10.1002/uog.23756]
• [7] Non-invasive prenatal sequencing for multiple Mendelian monogenic disorders using circulating cell-free fetal DNA. Nat Med. 2019;25(3):439-447. [DOI 10.1038/s41591-018-0334-x]
• [8] Birth Defects Res A Clin Mol Teratol. 2010;88(12):1008-1016.（米国の全国推計、2004〜2006年の出生） [PubMed 20878909]
• [9] Prospective prenatal cell-free DNA screening for genetic conditions of heterogenous etiologies. Nat Med. 2024;30(2):470-479. [DOI 10.1038/s41591-023-02774-x]
• [10] Rate of de novo mutations and the importance of father’s age to disease risk. Nature. 2012;488(7412):471-475.
• [11] 日本医師会. 医の倫理の基礎知識 2018年版【生殖医療】D-5. [日本医師会]
• [12] Parental stress and adjustment in the context of rare genetic syndromes: A scoping review. J Intellect Disabil. 2022;26(2):522-544. [PubMed 33866895]
• [13] The prevalence and phenomenology of self-injurious and aggressive behaviour in genetic syndromes. J Intellect Disabil Res. 2011;55(2):109-120. [DOI 10.1111/j.1365-2788.2010.01337.x]