【警告】NIPT検査における胎児分画(FF)の重要性 – 早期NIPT低FF値での検査結果は信頼できるのか？

近年、日本国内でNIPT（非侵襲的出生前検査）の需要が高まり、多くの医療機関で検査が提供されるようになりました。しかし、一部のクリニックでは研究用のシークエンサー（遺伝子解析装置）を使用し、胎児分画（FF）が臨床試験の基準を満たさない低い場合でも検査結果を出しているという問題があります。このような状況は検査の信頼性に関わる重大な問題です。

この記事では、NIPT検査における胎児DNA割合（胎児分画FF）の重要性について解説し、低いFFでも結果を出すことのリスクや問題点について詳しく説明します。これからNIPT検査を検討される方や医療従事者の方々に、正確で信頼性の高いNIPT検査を選ぶための参考にしていただければ幸いです。

胎児分画（FF）とは何か？NIPT検査における役割

胎児分画（Fetal Fraction, FF）とは、妊婦さんの血液中に含まれる胎児由来のDNA断片の割合を示す指標です。妊娠中は胎盤を通じて胎児のDNAが母体の血液中に放出されます。このDNAを分析することでNIPT検査は染色体異常の有無を調べます。

なぜ胎児分画（FF）が重要なのか？

胎児分画（FF）はNIPT検査の検出精度に直接影響する重要な因子です。FFが低すぎる場合、胎児由来のDNAシグナルが薄まり、染色体異常の検出が困難になります。多くのNIPT検査では、正確な結果を得るために約4%を最低必要FF値としています。

日本におけるNIPT検査の問題点：低FF検体の扱い

日本国内では、一部のクリニックが研究用のイルミナのシークエンサーを使用し、胎児分画が低い（4%未満）にもかかわらず検査結果を出しているという問題があります。これは検査の質と結果の信頼性に関わる重大な問題です。

研究用シークエンサーの使用と基準値の問題

本来、NIPT検査には厳格な品質管理と適切な基準値の設定が不可欠です。しかし、一部のクリニックでは以下のような問題が見られます：

イルミナVeriSeq NIPT Solution v2における胎児分画（FF）要件

イルミナ社のVeriSeq NIPT Solution v2は、世界的に広く使用されているNIPT検査プラットフォームです。このシステムにおける胎児分画（FF）の要件と精度について詳しく見ていきましょう。

最小許容胎児分画（FF）値

一般にNIPT検査では、約4%を下限値（最低必要FF）とすることが多く、これ未満では検出精度が保証できないとされています。VeriSeq NIPT Solution v2では、固定のカットオフ値を設ける代わりにiFACT（individualized Fetal Aneuploidy Confidence Test）という動的な閾値を導入しています。

VeriSeq NIPT v2自体は厳密な「4%カットオフ」を設定していないものの、実質的な目安として4%前後のFFが検査の精度保証に必要と考えられます。Illumina社の公式資料でも、他社NIPTでは4%が下限とされることに言及しつつ、VeriSeq NIPT v2はFF 4%以下でも検出可能であるとしています。

FF低下時の精度への影響

胎児分画が低下（4%未満）すると検査精度は低下します。Illumina社の臨床性能試験データによれば、FF≤4%のサンプルでは検出感度が低下していました。

このように胎児DNA量が十分確保できない場合、見逃し（偽陰性）のリスクが高まることが示唆されます。また、13,000件以上の大規模症例解析においても、FF <4%の「低リスク」判定例では陰性的中率（NPV）が98.1%とやや低く、1例の染色体異常が見逃されていました。一方、FFが4%以上の症例ではNPVが99.9%以上（実質的に偽陰性なし）であり、十分なFFが確保された場合の信頼性の高さが示されています。

検出対象別の必要FFと精度

NIPT検査で検出対象となる各染色体異常によって、必要とされる胎児分画（FF）の目安や検出精度は異なります。以下に詳細を示します。

常染色体の全数異常（T21/T18/T13）については、概ねFFが4%以上あれば高い精度で検出可能です。VeriSeq NIPT v2の臨床試験ではFF>4%のサンプルでT21/T13は100%、T18は93.3%の感度が報告されています。一方、FFが低い場合は特にT21/T18で検出漏れが発生しており、Illumina社も「低FFでは検出性能が低下しうる」ことを注意喚起しています。T13やT18では胎児由来DNAが少なくなりがちなため、FFが閾値付近（4%前後）の場合は慎重な評価が必要です。

部分的コピー数変異（CNV）検出への影響

部分的なコピー数変異（大規模な欠失・重複）の検出精度は、全染色体異常に比べてさらに厳しいFF要件があります。

信頼性の高いNIPT検査を選ぶための基準

NIPT検査を検討する際には、検査の信頼性と品質を確保するために以下のポイントに注意することが重要です。