目次
Q. NIPTの費用はいくらかかりますか？
A. NIPTの費用相場は約8〜20万円程度です。
NIPT（新型出生前診断）の費用は、検査項目の範囲や施設の種類（認証施設・非認証施設）、遺伝カウンセリングの有無などによって大きく異なります。保険適用外の自由診療のため全額自己負担となりますが、条件によっては医療費控除の対象になる場合もあります。
-
➤
費用相場 → 認証施設：約15〜20万円、非認証施設：約8〜20万円 -
➤
保険適用 → 適用外（自由診療）のため全額自己負担 -
➤
医療費控除 → 基本は対象外だが、陽性→確定検査→治療と進んだ場合は遡って対象になりうる -
➤
費用に含まれるもの → 検査料、遺伝カウンセリング料、結果説明料など施設により異なる -
➤
施設選びのポイント → 価格だけでなく検査精度・アフターフォロー・専門医の有無を重視
1. NIPTの費用相場｜いくらかかる？
【結論】 NIPTの費用相場は約8〜20万円程度です。認証施設では約15〜20万円、非認証施設では検査項目や施設によって約8〜20万円と幅があるのが現状です。
「NIPTっていくらかかるの？」「高いって聞くけど、どのくらい？」そんな不安を抱えてこのページをご覧になっている方も多いでしょう。妊娠中は何かと出費も増えますし、費用面は気になりますよね。
NIPT（新型出生前診断）は自由診療のため、施設によって費用が大きく異なります。まずは全体像を把握して、ご自身に合った選択ができるようにしていきましょう。
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•
認証施設（大学病院など）：約15〜20万円
-
•
非認証施設（クリニックなど）：約8〜20万円（検査項目により変動）
-
•
基本検査（3トリソミー）のみ：約8〜12万円
-
•
全染色体＋微細欠失＋遺伝子検査：約18〜25万円
💡 用語解説：NIPT（新型出生前診断）とは？
NIPTとは「Non-Invasive Prenatal Testing」の略で、妊婦さんの血液を採取するだけで、胎児の染色体異常の可能性を調べられる検査のことです。従来の羊水検査のように子宮に針を刺す必要がなく、流産リスクがないのが大きな特徴です。妊娠10週以降から検査可能で、ダウン症候群（21トリソミー）の検出率は99%以上と非常に高精度です。
検査項目による費用の違い
NIPTの費用は、どこまでの範囲を検査するかによって大きく変わります。基本的な3つのトリソミー（13番・18番・21番）だけを調べるプランから、微細欠失や単一遺伝子疾患まで調べる包括的なプランまで様々です。
| 検査プラン | 検査内容 | 費用目安 |
|---|---|---|
| 基本プラン | 13・18・21トリソミー | 約8〜12万円 |
| 全染色体プラン | 全染色体＋性染色体 | 約12〜18万円 |
| 微細欠失プラン | 全染色体＋微細欠失症候群 | 約15〜20万円 |
| 包括プラン | 全染色体＋微細欠失＋単一遺伝子 | 約18〜25万円 |
2. 認証施設と非認証施設の費用差
【結論】 認証施設は約15〜20万円で検査項目が限定的、非認証施設は約8〜20万円で検査項目の選択肢が広いのが特徴です。「非認証＝質が低い」は誤解であり、施設ごとの体制を確認することが重要です。
「認証施設と非認証施設って何が違うの？」「非認証だと不安…」という声をよく聞きます。実は、認証・非認証の違いは制度上の分類であり、必ずしも検査の質を表すものではありません。
💡 用語解説：認証施設・非認証施設とは？
認証施設とは、日本医学会連合が定めた認定制度の基準を満たした施設（主に大学病院など）のこと。非認証施設とは、この認定制度に参加していない施設のことです。認証施設は年齢制限などの条件がありますが、非認証施設は条件なく受検できることが多いです。
NIPTの値段（費用）が安いクリニックと高いクリニックの違い
非認証施設の中には、相場よりもかなり安い値段（5万円〜8万円程度）でNIPTを提供しているクリニックも存在します。しかし、医療における価格差には必ず理由があります。安いクリニックと高いクリニック（適正価格のクリニック）の主な違いは以下の3点です。
-
①
検査技術の世代と精度（第1世代 vs 第3世代）
安いクリニックでは、一昔前の古い検査技術（第1世代）を使用していることが多く、微細な染色体異常の検出精度（陽性的中率）が低い傾向にあります。適正価格の施設では、より高精度な第2・第3世代の技術（当院が採用するスーパーNIPTなど）を使用しています。 -
②
専門医・遺伝カウンセラーの有無
安価な施設は「採血するだけ」であり、結果の解釈や遺伝カウンセリングを行う専門家（臨床遺伝専門医など）が常駐していません。万が一陽性だった場合、自分で別の病院を探して相談し直す必要があります。 -
③
陽性後のアフターフォロー（確定検査の保証など）
結果だけを郵送やメールで送り、確定検査（羊水検査）の費用負担や施設紹介などのサポートが一切ない施設は、初期費用を安く抑えることができます。
このように、「安さ」の裏には検査精度の妥協やサポートの省略が隠れていることが多いため、費用だけで判断するのは非常に危険です。
認証施設の特徴
- •
費用：約15〜20万円
- •
検査項目：3トリソミー中心
- •
年齢制限：原則35歳以上など条件あり
- •
予約：数週間〜数ヶ月待ちの場合も
非認証施設の特徴
- •
費用：約8〜20万円（幅広い）
- •
検査項目：多様な選択肢
- •
年齢制限：制限なしの施設が多い
- •
予約：比較的取りやすい
⚠️ 重要：非認証施設でも、臨床遺伝専門医が在籍し、遺伝カウンセリングから確定検査まで一貫して対応できる施設は稀有な存在です。施設選びでは「認証か非認証か」だけでなく、専門医の有無やアフターフォロー体制を必ず確認してください。
3. NIPTは保険適用される？
【結論】 NIPTは保険適用外（自由診療）です。現時点では健康保険は使えず、全額自己負担となります。ただし、一部の自治体では助成金制度がある場合もあります。
「NIPTに保険は使えないの？」「どうして自費なの？」という疑問は当然のことです。出産に関わる費用は様々なものがあり、何が保険適用で何が適用外なのか、わかりにくいですよね。
NIPTを含む出生前診断は、「病気の治療」ではなく「検査・スクリーニング」という位置づけのため、健康保険の対象外となっています。これは日本だけでなく、多くの国で同様の扱いです。
-
✕
NIPT（新型出生前診断）：保険適用外
-
✕
羊水検査・絨毛検査：保険適用外（一部例外あり）
-
✕
クアトロテスト・コンバインド検査：保険適用外
-
○
通常の妊婦健診：公費補助あり（自治体により異なる）
💡 自治体の助成金制度
一部の自治体では、出生前診断に対する助成金制度を設けている場合があります。金額や条件は自治体によって異なりますので、お住まいの市区町村の窓口やホームページで確認してみてください。
4. NIPTは医療費控除の対象になる？
【結論】 NIPTは基本的には「予防・検診」扱いのため医療費控除の対象外です。ただし、NIPTで陽性→羊水検査→中絶手術と進んだ場合は、一連の流れが「治療」とみなされ、遡ってNIPT費用も控除対象になる可能性があります。
「NIPTの費用は確定申告で戻ってくる？」「医療費控除って使えるの？」という質問もよくいただきます。この点は少し複雑なので、詳しく解説しますね。
💡 用語解説：医療費控除とは？
医療費控除とは、1年間に支払った医療費が一定額（10万円または所得の5%のいずれか低い方）を超えた場合に、確定申告をすることで所得税が還付される制度です。ただし、すべての医療費が対象になるわけではなく、「治療」目的の費用に限られます。
-
✕
NIPTのみで陰性の場合
「予防・検診」扱いのため、対象外 -
○
NIPT陽性→羊水検査→中絶の場合
一連の流れが「治療」とみなされ、NIPT費用も遡って対象になる可能性あり -
△
個別のケース
最終的な判断は税務署によるため、領収書は必ず保管しておくこと
⚠️ 重要な補足：出生前診断の対象となる疾患は、基本的には「自立して生活することに支障が出るレベルの重篤な疾患」に限られています。これは医学的・倫理的な観点から定められた基準であり、検査を受ける前に理解しておくことが大切です。
確定申告でNIPTの値段（費用）を医療費控除として申請するには？
「NIPTの高い値段（費用）を少しでも取り戻したい」と、確定申告で医療費控除を申請したいと考える方は少なくありません。前述の通り、NIPTが「治療の一環」として税務署に認められた場合、以下の書類や記録を揃えて確定申告を行う必要があります。
-
①
医療費の領収書
NIPT、羊水検査、その後の処置など、一連の費用の領収書です（現在は確定申告時の提出は不要ですが、自宅で5年間保管する義務があります。代わりに「医療費控除の明細書」を作成します）。 -
②
医師の診断書（※求められた場合）
「検査の結果、治療（処置）が必要となった」という一連の流れを証明できるもの。必ずしも必要ではありませんが、税務署から確認された際にあるとスムーズです。 -
③
通院にかかった交通費の記録
電車やバスなど公共交通機関の運賃メモ（タクシーは原則不可ですが、公共交通機関が利用できない正当な理由がある場合は認められることがあります）。
※医療費控除の対象になるかどうかの最終的な判断は、管轄の税務署によって分かれるケースもあります。「自分の場合はどうなるか」と迷った場合は、確定申告の前に管轄の税務署へ直接確認することをお勧めします。
確定申告でNIPTの値段（費用）を医療費控除として申請するには？
「NIPTの高い値段（費用）を少しでも取り戻したい」と、確定申告で医療費控除を申請したいと考える方は少なくありません。前述の通り、NIPTが「治療の一環」として税務署に認められた場合、以下の書類や記録を揃えて確定申告を行う必要があります。
-
①
医療費の領収書
NIPT、羊水検査、その後の処置など、一連の費用の領収書です（現在は確定申告時の提出は不要ですが、自宅で5年間保管する義務があります。代わりに「医療費控除の明細書」を作成します）。 -
②
医師の診断書（※求められた場合）
「検査の結果、治療（処置）が必要となった」という一連の流れを証明できるもの。必ずしも必要ではありませんが、税務署から確認された際にあるとスムーズです。 -
③
通院にかかった交通費の記録
電車やバスなど公共交通機関の運賃メモ（タクシーは原則不可ですが、公共交通機関が利用できない正当な理由がある場合は認められることがあります）。
※医療費控除の対象になるかどうかの最終的な判断は、管轄の税務署によって分かれるケースもあります。「自分の場合はどうなるか」と迷った場合は、確定申告の前に管轄の税務署へ直接確認することをお勧めします。
🩺 院長コラム【費用だけで選ばないでほしい理由】
NIPTの費用を調べていると、「安い」ことを前面に出している施設も見かけます。もちろん費用は大切な判断材料ですが、「安さ」だけで施設を選ぶことは、私としてはお勧めしません。
なぜなら、NIPTは「検査して終わり」ではないからです。陽性が出たときにどうサポートしてもらえるか、専門的な説明を受けられるか、確定検査まで一貫して対応してもらえるかこれらが本当に大切なポイントです。
検査会社によって使用している技術やシーケンサーは異なりますし、それを解析するバイオインフォマティクスの専門家をきちんと置いているかどうかも価格に反映されます。安い検査には、それなりの理由があることを知っておいてください。
5. NIPT費用の内訳｜何にいくらかかる？
【結論】 NIPTの費用には、検査料だけでなく遺伝カウンセリング料、診察料、結果説明料などが含まれます。施設によって内訳が異なるため、「総額でいくらになるか」を事前に確認することが重要です。
「表示されている金額だけで受けられるの？」「追加料金はかかる？」そんな疑問をお持ちの方も多いでしょう。NIPT費用の内訳を理解しておくと、施設間の比較がしやすくなります。
| 費用項目 | 内容 | 相場 |
|---|---|---|
| 検査料 | 採血・検体輸送・解析費用 | 約8〜18万円 |
| 遺伝カウンセリング料 | 検査前後の説明・相談 | 約1〜3万円 |
| 診察料 | 医師の診察・問診 | 約0.5〜1万円 |
| 結果説明料 | 結果の詳細な説明 | 検査料に含まれることが多い |
| 陽性時フォロー | 追加カウンセリング・紹介状など | 施設により異なる |
💡 費用比較のポイント
施設によって「検査料のみ」の表示だったり、「すべて込み」の表示だったりと様々です。比較する際は以下の点を確認してください。
① 遺伝カウンセリング料は含まれているか
② 陽性時の追加カウンセリングは有料か無料か
③ 再検査が必要になった場合の費用は？
6. 費用だけじゃない！施設選びのポイント
【結論】 NIPT施設選びでは、費用だけでなく検査精度、専門医の有無、陽性時のフォロー体制を重視してください。「安さ」だけで選ぶと、いざという時に十分なサポートを受けられない可能性があります。
「どこで受けても同じでしょ？」「一番安いところでいいかな」そう思われるかもしれません。でも、NIPTは「検査して終わり」ではありません。結果が出た後のサポート体制こそが、本当に大切なポイントなのです。
-
①
臨床遺伝専門医が在籍しているか
遺伝子検査の専門知識を持つ医師がいるかどうかは非常に重要です -
②
陽性時のフォロー体制
確定検査（羊水検査など）まで対応できるか、紹介先があるか -
③
検査会社の信頼性
どこの検査会社を使っているか、精度のエビデンスはあるか -
④
遺伝カウンセリングの質
検査前後に十分な説明・相談の時間があるか -
⑤
費用の透明性
追加料金の有無、総額が明確になっているか
検査精度の違いを知っておこう
NIPTと一口に言っても、検査会社によって使用している技術は様々です。同じ「NIPT」でも、精度には差があることを知っておいてください。
従来の検査法
- •
3トリソミーの検出率：約99%
- •
微細欠失の陽性的中率：約70%台
- •
偽陽性・偽陰性のリスクあり
COATE法（高精度）
- •
3トリソミーの検出率：99%以上
- •
微細欠失の陽性的中率：>99.9%
- •
父親由来の遺伝子変異も検出可能
💡 用語解説：COATE法とは？
COATE法は、SNP法とターゲット法を融合した次世代のNIPT技術です。米国の大手遺伝子検査会社が開発し、従来法では難しかった微細欠失症候群や単一遺伝子疾患も高精度で検出できます。詳しくはCOATE法のエビデンスページをご覧ください。
7. ミネルバクリニックの費用体系
【結論】 ミネルバクリニックでは、遺伝カウンセリング料33,000円が検査費用に内包されています。これは検査当日の説明だけでなく、陽性時の追加カウンセリングや妊娠中のご相談も含まれた料金です。
当院の費用体系の特徴をご説明します。単に「検査料金」だけでなく、検査後のサポートまで含めた総合的な価値をご理解いただければと思います。
-
✓
遺伝カウンセリング料（33,000円相当）
検査前の説明から陽性時のフォローまで何度でも追加料金なし -
✓
妊娠中の相談対応
サイトメガロウイルス初感染など心配なことがあればいつでも相談可能 -
✓
結果説明
臨床遺伝専門医による詳細な結果説明 -
✓
再検査対応
胎児分画低値などで再検査が必要な場合の対応と返金制度
「お金がかかるから相談しにくい」ということを避け、いつでも相談できる環境を整えることで、なるべく安心して日常生活を送っていただきたいという配慮から、このような費用体系にしています。
検査プラン別の費用
当院では、検査範囲に応じた複数のプランをご用意しています。詳細な料金はNIPTトップページでご確認ください。
| プラン名 | 検査内容 | 特徴 |
|---|---|---|
| スーパーNIPT （ライト/スタンダード） |
基本3トリソミー〜全染色体 | 偽陰性ゼロのエビデンスあり |
| NEWプレミアムプラン （COATE法） |
6トリソミー＋性染色体＋12微細欠失 | 微細欠失の陽性的中率>99.9% |
| ダイヤモンドプラン （COATE法） |
6トリソミー＋性染色体＋12微細欠失＋56遺伝子 | 最も包括的な検査 |
🎯 ダイヤモンドプランで検出できる主な疾患
当院のダイヤモンドプランは、染色体異常の発症頻度ランキング1位：ダウン症候群、2位：ヌーナン症候群、3位：ディジョージ症候群をすべて網羅できる唯一のプランです。56遺伝子検査では、父親由来の精子の新生突然変異（症候性自閉症の原因となる疾患を含む）も検出可能です。
8. 陽性時の費用サポート｜互助会制度
【結論】 ミネルバクリニックでは、互助会（8,000円）に加入いただくと、陽性時の確定検査（羊水検査）費用を全額カバー（上限なし）。金銭的な心配なく、必要な検査を受けていただけます。
「もし陽性だったら、羊水検査の費用はどうなるの？」そんな不安を抱えている方も多いでしょう。当院では、そうした金銭的リスクをヘッジする仕組みをご用意しています。
- ①
- ②
-
③
心理的リスクヘッジ
院内完結で転院不要。患者様の不安時間を最小化し、トラウマを防ぐ医療的配慮を徹底
💡 互助会・安心結果保証制度について
互助会は強制加入とさせていただいています。これは、非加入者が陽性になった際に費用面で困るケースが続いたためです。海外旅行保険の義務化と同じ理念で、「万が一」に備えるための制度です。また、安心結果保証制度（6,000円）は、再検査が必要と分かったのに流産して検体を提出できなかった場合に適用されます。
🩺 院長コラム【「正確性」と「フォロー」が価格に反映される理由】
当院の医療哲学は、「2日など短期間で結果を出すこと」よりも、「生涯に関わる大切な検査だからこそ、最も重要なのは正確性である」という考え方に基づいています。
検査会社ごとに使用している技術やシーケンサーは異なりますし、それを解析するバイオインフォマティクスの専門家をきちんと置いているかどうかも価格に反映されます。当院が採用しているダイヤモンドプランの検査会社は、米国のトップ4の一角を占める大手です。
さらに、陽性後のフォロー（心理的・医学的ケア）が極めて重要であり、患者様のトラウマを防ぐことが最優先という医療理念を持っています。価格だけを見るのではなく、「その価格で何が得られるか」をぜひ考えていただきたいのです。
9. ミネルバクリニックのサポート体制
ミネルバクリニックは、臨床遺伝専門医が遺伝子検査のために開業した日本初のクリニックです。専門性を活かし、NIPTから確定検査、陽性時のフォローまで一貫した診療体制を整えています。
🏥 院内で確定検査まで対応
2025年6月より産婦人科を併設。羊水検査・絨毛検査も院内で実施可能。転院の必要がなく、心理的負担を軽減できます。
👩⚕️ 臨床遺伝専門医が常駐
臨床遺伝専門医が検査前後の遺伝カウンセリングを担当。結果の説明から今後の選択肢まで、専門家が寄り添います。
🌐 全国対応・オンライン診療
オンラインNIPTにより全国どこからでも受検可能。遠方の方も臨床遺伝専門医の診療を受けられます。
よくある質問（FAQ）
🏥 一人で悩まないでください
NIPTの費用や施設選びで迷っていること、検査を受けるかどうか迷っていること、
どんなことでもお気軽にご相談ください。
臨床遺伝専門医があなたとご家族に寄り添います。
参考文献
- [1] American College of Obstetricians and Gynecologists. Screening for Fetal Chromosomal Abnormalities: ACOG Practice Bulletin, Number 226. Obstet Gynecol. 2020;136(4):e48-e69. [PubMed]
- [2] Gil MM, et al. Analysis of cell-free DNA in maternal blood in screening for fetal aneuploidies: updated meta-analysis. Ultrasound Obstet Gynecol. 2017;50(3):302-314. [PubMed]
- [3] Gregg AR, et al. Noninvasive prenatal screening for fetal aneuploidy, 2016 update: a position statement of the American College of Medical Genetics and Genomics. Genet Med. 2016;18(10):1056-1065. [PubMed]
- [4] International Society for Prenatal Diagnosis. Position Statement from the Chromosome Abnormality Screening Committee on behalf of the Board of the ISPD. [ISPD]
- [5] National Institutes of Health. What is noninvasive prenatal testing (NIPT) and what disorders can it screen for? [NIH MedlinePlus]
- [6] 日本医学会連合. 出生前検査認証制度等運営委員会. [日本医学会連合]
- [7] 厚生労働省. 出生前検査に関する情報提供. [厚生労働省]
- [8] 国税庁. 医療費控除の対象となる医療費. [国税庁]
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- FMF（2）
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- 制度改善（2）
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- 口コミ（2）
- 羊水検査費用（2）
- 重症度（2）
- 無認可施設（2）
- コピー数変異（2）
- 患者ファースト（2）
- タイミング（2）
- WGS法（2）
- 胎児異常（2）
- ライフプラン（2）
- ワクチン（2）
- ヘパリン（2）
- アスピリン（2）
- 陽性後サポート（2）
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