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NIPT陰性でもダウン症?NIPTの偽陰性の症例報告

新型出生前検査NIPT)は、一般的な胎児異数性障害(トリソミー21、18、13)のリスクを評価するための出生前スクリーニングとして確立されています。NIPTは高感度と高特異性を持っていますが、偽陽性や偽陰性も発生します。NIPTの偽陰性結果、特にダウン症の場合はまれですが、家族や社会に重大な臨床的影響を与えるため、、重要です。
セルフリーDNA(cfDNA)ベースの出生前スクリーニングは、非侵襲的出生前検査(NIPT)としても知られており、他のスクリーニング方法と比較した場合、トリソミー21に対する感度と特異度は比類なき優れたものです。検出率は通常99%を超え、偽陽性(FP)率は0.1%未満です。まれに偽陰性の症例が大規模な臨床研究で報告されています。

ダウン症の出生前スクリーニングで偽陰性になる原因とは

ダウン症に関するセルフリーDNA(cfDNA)スクリーニング(NIPT)の結果が偽陰性であることはまれです。しかし、患者やその医療提供者に臨床的に大きな影響を与えるので、偽陰性の背景を理解するのは非常に重要です。

多いのは21qのアイソクロモソーム
cfDNAスクリーニングの文献からの報告をまとめると、新型出生前診断(NIPT)が偽陰性であったダウン症症例29例中8例(28%)が21q;21q再構成と関連していました。
これは、21番染色体の長腕どうしがくっついてできた同腕染色体です。
21q;21q再構成を伴うNIPT真陽性症例3例中3例に限局性胎盤モザイクまたは胎児モザイクの証拠があり、胎盤材料が研究可能であった偽陰性症例1例で確認されています。
21q染色体再構成は、ダウン症に関与するcfDNAスクリーニングの偽陰性結果において多いものです。
胎盤モザイクにつながる接合後アイソクロモソーム形成が、偽陰性症例におけるこれらの再配列の有病率の増加の生物学的原因となります。
接合後というのは、精子1個、卵子1個で受精卵を形成(接合といいます)したあとに、染色体再構成がおこることを意味しています。

臨床的には、胎児分画に対してトリソミー分画(zスコアまたは同等の指標)が低い場合は胎盤モザイクが示唆される一方、これらの症例は限局性胎盤モザイクではなく、正常細胞を含む胎盤の存在下での完全なトリソミーを反映している可能性があるので注意が必要です。
21q;21q染色体再構成の症例はすべて、新生突然変異でした。つまり、ご両親には異常がないが、赤ちゃんで突然変異により異常となるものです。

21q;21q再構成を原因とするダウン症候群は、ダウン症全体の2%未満でみられるものです。アイソクロモソームは2本の同じ染色体アームを持ち、受精後のセントロメアの分離不全や姉妹染色分体間のU型交換を伴う事象からde novo(新生突然変異)で生じてしまいます。この事象が胚のなかで起こる場所とタイミングによっては、最初の2倍体(正常)細胞株のモザイクが胎盤に残存する可能性があります。
絨毛膜絨毛サンプリング(CVS:絨毛検査)の文献には、de novo isochromosome 21qを伴うトリソミー21の偽陰性症例が報告されています。
胎盤の細胞栄養芽細胞は、胚とともに内側の細胞塊から派生した間葉系コアの細胞よりも、胚とより遠い関係にあります。もし内細胞塊前駆体においてde novoのアイソクロモソーム21q形成が起こるとすれば、間葉系コアと胎児はトリソミー21を持つことになるが、細胞栄養芽細胞は、正常のままとなります。そうすると、NIPTの結果は異常がないというものになってしまい、うまれたあとにダウン症とわかる偽陰性となってしまいます。

低胎児分画(FF)
胎児分画とは、母体血中の全セルフリーDNAのうち、胎児-胎盤ユニットに由来するものの割合をいいます。胎児-胎盤に由来するセルフリーDNAは、早ければ妊娠5週、ほとんど妊娠9週までに母体血中に検出されるようになります。
信頼できるcfDNAスクリーニング結果を得るためには、十分な量の胎児-胎盤cfDNAが存在する必要があります。一般に、検査を成功させるためには、循環セルフリーDNA全体の最低3~4%が胎児-胎盤由来である必要があります。胎児分画が少ないと「検査結果が出せない」というの報告になったり、偽陰性の結果につながったりします。
胎児率が低くても十分(3~5%)であれば、21番染色体断片の割合の期待値(正常基準)と観察値の差は非常に小さくなります。十分な数の断片の塩基配列が決定されないと、この差は識別できず、結果はスクリーン陰性と誤って報告されます。胎児分画は妊娠週数と共に増えるので、あまりに早い時期にNIPTを受けるのは避けたほうが良いでしょう。

低胎児分画は以下のような原因が考えられます。

妊娠早期
妊娠10週以前は胎児分画がかなり低くなるため、ほとんどの検査施設では、検査に十分な胎児分画を確保するために、患者に少なくとも妊娠10週まで待つよう求めています。
母親の肥満
母親の体重が増加するにつれて、胎児分画は減少します。この逆相関は、比較的一定量しかない胎児セルフリーDNAが、肥満状態の、より多い母体血漿量で希釈されること、母体体重の増加に伴って母体由来cfDNA量が増加することに起因しています。低胎児分画(3.5%未満)が全サンプルの1%程度に認められますが、体重が60kg未満では0.2%に対し、110kg以上では10.5%となっています。
胎児染色体核型
妊娠10~20週における平均胎児分画は、胎児トリソミー18では平均胎児分画9%となっており、正常核型の胎児の妊娠における平均胎児分画11~13%よりも低くなっています。逆に、トリソミー21胎児の妊娠では、平均胎児分画13~15%と正常より高くなっています。13トリソミーターナー症候群の胎児分画も2倍体胎児より低いようです。このことが、ダウン症候群の検出率が一番高いことにつながっていると考えられます。
その他
妊娠20週以前の母体による低分子ヘパリンの使用。
体外受精による妊娠。
双胎妊娠:胎児1人当たりの胎児分画は双胎の方が低いため

NIPTでダウン症偽陰性の症例提示

患者は生後1ヵ月の男性で、両親とともに台州病院を受診した。妊娠37+4週で正常経膣分娩により出生し、体重2850g、体長50cmであった。出生時の典型的な身体的特徴(扁平鼻梁、斜め上向きの口蓋裂など)からダウン症が疑われた。末梢血核型検査の結果、全クローンにおいて46,XY,der(21;21)(q10;q10),+21核型でダウン症の診断が確定した。新生児期に認められた合併症は、新生児溶血、房室中隔欠損症(AVSD)、動脈管開存症(PDA)などであった。

この患者の母親はG3P1A1の30歳(身長163cm、体重59.0kg、BMI22.2)で、4歳の健康な子供がいたが、自然流産を1回経験した。妊娠中、妊娠第1期の超音波検査では、心拍のある1個の妊娠嚢が確認され、妊娠12+4週時の胎児の透明度(NT)は正常(1.1mm)であった。妊娠中期の母体血清スクリーニングでは、妊娠16+3週でトリソミー21のリスクが1/592と算出された。NIPTの結果、妊娠17+5週の時点で、胎児は3つの一般的なトリソミーのそれぞれについて「低リスク」(T21のZスコア=0.664、T18のZスコア=0.424、T13のZスコア=0.205)であり、cfDNAの胎児分画は16.9%であった。血縁関係のない両親は健康で、病歴はなかった。両親の核型検査の結果、母親は46,XX核型の保因者であり、父親は46,XY核型の保因者であった。

21番染色体再構成によるアイソクロモソーム bmcmedgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12920-020-00751-8/figures/1 より引用%5B/caption%5D

母親は46,XX、父親は46,XY核型であった。したがって、この21q;21q再配列の症例はde novoの胎児21q再配列であった。しかし、この偽陰性NIPT症例は、モザイクの可能性があるため、分娩後に臍帯と胎盤から組織サンプルを採取して詳しい検査を行わなかったため、同定することができなかった。残念なことに、この患者の母親は妊娠24週目に高解像度の超音波検査を受けなかった。

我々の知る限り、これは染色体21q;21q再配列によるNIPT偽陰性の9例目の報告である。が以前にまとめた8症例にこの症例を加えた。これらの結果から、NIPTの偽陰性結果は、技術的な限界や質の低さではなく、生物学的なメカニズムによって起こる可能性があることが示された。21q;21q転座には、アイソクロモソーム21q転座とロバートソン転座21q;21qがある。細胞遺伝学的手法では、2つの異なる相同染色体に由来する真のロバートソン転座と、1つの親染色体に由来する遺伝的に同一のアームからなるアイソクロモソームを区別することはできません。アイソクロモソーム21qは、受精後にセントロメアのミスディビジョンや姉妹染色分体間のU型交換によってde novoで生じる。Shafferらは、ほとんどの21q;21q転座はアイソクロモソーム21q(88.9%、32/36)であり、残りの転座は分子細胞遺伝学的手法によって達成された真のロバートソン転座21q;21q(11.1%、4/36)であることを見出した。デノボのアイソクロモソーム21qによるダウン症候群は、標準的な核型(47,XN,+ 21)によるものよりも、NIPTの結果が偽陰性となる可能性が高い。偽陰性の生物学的原因は、ほぼ間違いなく21q;21q再構成の接合後形成に起因する胎盤モザイクであり、これにより胎盤細胞栄養芽細胞は主に正常核型を持つことになる。出生前スクリーニングにおいて、このような予期せぬ偽陰性NIPT結果を扱うことは重要である。

結論として、臨床遺伝学者とその患者にとって、NIPTは依然としてスクリーニング検査であることを理解することが不可欠です。NIPTに先立ち、すべての患者は遺伝カウンセリングを受け、偽陽性や偽陰性のリスクが起こりうるため、考えられる様々な検査結果についてインフォームド・コンセントを受けるべきであり、出生前の患者がより十分な情報を得た上でNIPTを受けることができるようにすべきである。

出典:A rare Down syndrome foetus with de novo 21q;21q rearrangements causing false negative results in non-invasive prenatal testing: a case report
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ミネルバクリニックでは、「健常なお子さんを抱かせてあげたい」という考えの臨床遺伝専門医の院長のもと、東京都港区青山で、NIPT検査を提供しています。少子化の時代、より健康なお子さんを持ちたいという思いが高まるのは当然のことと考えています。そのため、当院では世界の先進的特許技術に支えられた高精度、かつ、ご希望に合わせてたくさんの疾患検査を提供してくれる確かな技術力のある検査会社を遺伝専門医の目で選りすぐりご提供しています。オンライン診療で全国カバー、採血はお近くの提携医療機関でしていただくことも可能ですので是非ご検討ください。

プロフィール

この記事の筆者:仲田洋美(医師)

ミネルバクリニック院長・仲田洋美は、日本内科学会内科専門医、日本臨床腫瘍学会がん薬物療法専門医 (がん薬物療法専門医認定者名簿)、日本人類遺伝学会臨床遺伝専門医(臨床遺伝専門医名簿:東京都)として従事し、患者様の心に寄り添った診療を心がけています。

仲田洋美のプロフィールはこちら

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