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NIPT(新型出生前診断)の費用相場は?10万〜20万円の内訳と選び方を専門医が解説|東京・ミネルバクリニック

NIPT(新型出生前診断)の費用相場は?10万〜20万円の内訳と選び方を専門医が解説|東京・ミネルバクリニック

NIPT(新型出生前診断)の費用相場は?
10万〜20万円の内訳と選び方を専門医が解説

この記事でわかること
📖 読了時間:約10分
💰 NIPT費用・料金比較
臨床遺伝専門医監修

Q. NIPTの費用相場はいくらですか?

A. NIPTの費用相場は10万〜20万円程度です。
NIPT(新型出生前診断)の価格は、検査項目数、施設の種類(認可・非認可)、カウンセリング体制によって大きく異なります。安さだけで選ぶと陽性時のサポート不足で後悔することも。


  • NIPTの費用相場 → 認可施設で15〜20万円、非認可施設で10〜25万円

  • 価格差の理由検査項目数・検査会社の技術力・カウンセリング体制が影響

  • 格安検査の注意点遺伝カウンセリング不十分・陽性時の転院リスク

  • 保険適用 → NIPTは自費診療(保険適用外)だが医療費控除の対象

  • ミネルバクリニック33,000円相当の遺伝カウンセリング込み・互助会で確定検査費用もカバー

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1. NIPTの費用相場はいくら?10万〜20万円の内訳

【結論】 NIPTの費用相場は10万〜20万円程度です。認可施設では15〜20万円、非認可施設では検査項目によって10万円未満〜25万円以上まで幅があります。

「NIPTを受けたいけど、費用がいくらかかるのか心配」「施設によって料金が違いすぎて何を選べばいいかわからない」そんな不安を感じている妊婦さんは多いでしょう。まずは相場を把握して、納得できる選択をしましょう。

💰 NIPT費用の相場一覧
  • 認可施設(基本検査):15〜20万円(3つのトリソミーのみ)
  • 非認可施設(基本プラン):8〜12万円(3つのトリソミー)
  • 非認可施設(全染色体+微小欠失):15〜20万円
  • 非認可施設(単一遺伝子疾患含む):20〜30万円

💡 用語解説:3つのトリソミーとは?
NIPTで基本的に検査される3つの染色体異常のことです。21トリソミー(ダウン症候群)、18トリソミー13トリソミーを指します。認可施設ではこの3つのみが検査対象となります。

費用に含まれるもの・含まれないもの

NIPTの料金には「何が含まれているか」が施設によって大きく異なります。表示価格だけでなく、追加でかかる費用がないか必ず確認しましょう。

項目 含まれることが多い 別途費用のことも
採血・検査料 ✓ 含まれる
検査前カウンセリング 施設による 5,000〜15,000円
結果説明 ✓ 含まれる
陽性時の再カウンセリング 施設による 10,000〜30,000円
確定検査(羊水検査) 通常別途 15〜25万円

2. 認可施設と非認可施設の費用・サービスの違い

【結論】 認可施設は検査項目が限定的だが体制が整っているのが特徴。非認可施設は検査項目が豊富だが、サポート体制は施設により大きな差があります。

「認可」「非認可」という言葉を聞いて、「非認可は違法なの?」と不安に思う方もいらっしゃるかもしれません。これは日本産科婦人科学会による「認証制度」への登録の有無を指すもので、どちらも合法的な医療行為です。

🏥 認可施設の特徴

  • 費用:15〜20万円
  • 検査項目:3つのトリソミーのみ
  • 遺伝カウンセリング体制が充実
  • 確定検査への連携あり
  • 年齢制限・紹介状が必要な場合も

🔬 非認可施設の特徴

  • 費用:8〜30万円(検査内容による)
  • 検査項目:全染色体・微小欠失・単一遺伝子も
  • サポート体制は施設による差が大きい
  • 年齢制限なし・紹介状不要の場合が多い
  • 予約の取りやすさ

💡 用語解説:微小欠失とは?
染色体の一部が欠けている状態のことです。代表的なものに22q11.2欠失症候群(DiGeorge症候群)があり、心臓の異常や免疫不全、発達の遅れなどを引き起こすことがあります。NIPTでは検査方法によって検出精度が大きく異なります。

3. なぜ施設によって価格差があるのか?その理由

【結論】 NIPTの価格差は①検査項目数 ②検査会社の技術力 ③遺伝カウンセリング体制 ④陽性時のフォローの4つの要素で生まれます。安さには必ず理由があります。

「同じNIPTなのに、なぜこんなに料金が違うの?」と疑問に思われる方は多いでしょう。実は、NIPTと一口に言っても検査の中身や精度、サポート体制は施設によって全く異なります

価格差を生む4つの要因

⚠️ 価格差の要因
  • 検査項目数
    3つのトリソミーだけなら安く、全染色体・微小欠失・単一遺伝子疾患まで調べると高くなります。ダイヤモンドプランのような包括的検査は78項目を検査できます。
  • 検査会社の技術力
    同じ「NIPT」でも、検査会社によって精度や偽陽性率に大きな差があります。最新のシーケンサーや独自のバイオインフォマティクス技術を持つ会社ほどコストがかかります。
  • 遺伝カウンセリング体制
    臨床遺伝専門医による十分なカウンセリングには時間とコストがかかります。カウンセリングを省略・簡略化している施設は安くなる傾向があります。
  • 陽性時のフォロー体制
    陽性だった場合の確定検査への連携、心理的サポート、継続的なカウンセリングなど、「検査後」のサポートが充実している施設は費用も高くなります。
仲田洋美院長

🩺 院長コラム【検査会社選びが精度を左右する】

NIPTは「どこで受けても同じ」ではありません。同じIllumina社のシーケンサーを使っていても、解析アルゴリズムや判定基準は検査会社によって全く異なります

特に微小欠失の検出では、従来のシーケンス法(広域ゲノム法)では偽陽性が多いことが問題でした。当院が採用しているCOATE法は、SNPと標的シーケンスを組み合わせることで微小欠失の陽性的中率99%以上を実現しています。

「安いから」という理由だけで検査を選び、精度の低い結果に振り回されるケースを数多く見てきました。一生に関わる検査だからこそ、費用だけでなく精度と体制で選んでいただきたいのです。

4. 格安NIPTのリスクと注意点

【結論】 10万円を大きく下回る格安NIPTには要注意です。遺伝カウンセリング不十分、検査精度への不安、陽性時のフォロー不足など、「安さの代償」を支払うことになりかねません。

「できるだけ安く受けたい」というお気持ちはよくわかります。しかし、NIPTは妊娠中の一度きりの大切な検査です。価格だけで選んで後悔しないために、格安検査のリスクを知っておきましょう。

⚠️ 格安NIPTの5つのリスク
  • 遺伝カウンセリングが不十分 → 検査の意味や結果の解釈を理解しないまま受検
  • 精度への不安 → 安価な検査会社は偽陽性・偽陰性のリスクが高い可能性
  • 陽性時のフォロー不足 → 「陽性でした」と言われるだけで途方に暮れる
  • 確定検査への連携なし → 陽性時に自分で羊水検査を受けられる施設を探す必要
  • 追加費用の発生 → 陽性時のカウンセリングや確定検査で結局高額に

⚠️ 注意:NIPTで陽性が出た場合、確定検査(羊水検査など)が必ず必要です。「陽性でした」と結果だけ伝えられ、その後のサポートがない施設では、不安な状態で確定検査を受けられる施設を自分で探さなければなりません。時間的・精神的負担は計り知れません。

「安物買いの銭失い」にならないために

格安施設でNIPT陽性となり、当院に駆け込んでこられる方が後を絶ちません。「検査費用は安かったけど、結局カウンセリング費用と確定検査費用で総額30万円以上かかった」というケースも珍しくありません。

最初からカウンセリングと陽性時のフォローが整った施設を選んでいれば、トータルコストも精神的負担も抑えられたはずです。

費用だけでなく「陽性時のサポート」も確認を

NIPTは結果が出てからが本番です。
臨床遺伝専門医が最後まで寄り添う体制かどうかが重要です。


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5. NIPTに保険は適用される?医療費控除は?

【結論】 NIPTは健康保険の適用外(自費診療)です。ただし、医療費控除の対象となるため、確定申告で税金の還付を受けられる可能性があります。

「NIPTに保険は使えるの?」「医療費控除って何?」費用面で気になる点を解説します。

❌ 健康保険は適用外

  • NIPTは自費診療
  • 健康保険証は使えません
  • 全額自己負担となります

✓ 医療費控除の対象

  • 年間医療費10万円超で申請可能
  • 確定申告で税金の還付を受けられる
  • 領収書は必ず保管してください

💡 医療費控除の計算例
年収500万円の方がNIPT(15万円)+妊婦健診(5万円)+出産費用(10万円)を支払った場合、医療費合計30万円。
医療費控除額:30万円−10万円=20万円
還付金の目安(所得税率20%の場合):20万円×20%=約4万円の還付

6. ミネルバクリニックの料金体系と「トリプルリスクヘッジ」

【結論】 ミネルバクリニックでは、検査費用に33,000円相当の遺伝カウンセリングが含まれています。さらに互助会制度により、陽性時の確定検査費用を全額カバーする体制を整えています。

当院のNIPT料金には、臨床遺伝専門医による検査前の遺伝カウンセリング、結果説明、陽性時の継続サポートがすべて含まれています。「検査を受けたら終わり」ではなく、その後の人生設計までサポートする体制です。

「33,000円相当のカウンセリング」とは

遺伝カウンセリングの相場は1回30〜60分で10,000〜15,000円程度。当院では検査前の説明、結果説明、陽性時の継続相談を含めると、33,000円相当のカウンセリングが検査費用に含まれています。

💬 カウンセリングの内容
  • 検査前:検査の意味、結果の解釈、陽性だった場合の選択肢について説明
  • 結果説明:検査結果の詳細な解説と、次のステップの提案
  • 陽性時の継続サポート:確定検査の説明、心理的サポート、今後の相談
  • 妊娠中の不安相談:サイトメガロウイルス感染など、検査以外の相談も可能

互助会制度で確定検査費用もカバー

当院では互助会制度(8,000円)により、NIPT陽性時の確定検査(羊水検査・絨毛検査)費用を全額カバーしています。通常15〜25万円かかる確定検査の費用負担がなくなるため、経済的な不安なく検査に臨めます

🛡️ トリプルリスクヘッジ
  • 経済的リスクヘッジ
    互助会(8,000円)により、羊水検査費用を上限なしで全額補助
  • 時間的リスクヘッジ
    2025年6月より院内で羊水検査・絨毛検査に対応。転院の必要なし、結果も最短3日
  • 精神的リスクヘッジ
    臨床遺伝専門医が検査から確定診断まで一貫してサポート。不安な時期を最小限に
仲田洋美院長

🩺 院長コラム【なぜ「互助会」制度を作ったのか】

NIPTで陽性が出た方が、「確定検査の費用が払えない」と泣きながら相談に来られたことがありました。それがきっかけで互助会制度を始めました。

「自分は大丈夫」と思って加入しない方もいらっしゃいましたが、実際に陽性になって「入っておけばよかった」と後悔されるケースが続いたため、現在はNIPT受検者全員に互助会が適用される仕組みにしています。

8,000円で15〜25万円の確定検査費用をカバーできる。これは「みんなで支え合う」仕組みだからこそ実現できています。一生に関わる検査で経済的な理由で確定検査を諦める方をゼロにしたい、その思いで運営しています。

7. NIPT施設の選び方|費用以外にチェックすべきポイント

【結論】 NIPT施設選びでは、費用だけでなく①検査の精度 ②遺伝カウンセリング体制 ③陽性時のフォロー ④確定検査への連携を必ず確認してください。

NIPTは「受けて終わり」ではありません。結果が出てからが本当のスタートです。特に陽性だった場合、その後のサポートが人生を左右します。

チェック項目 確認すべきこと 要注意サイン
検査会社 どの検査会社を使っているか 検査会社名を公開していない
遺伝カウンセリング 誰が担当するか、時間、内容 「説明動画を見るだけ」「5分程度」
陽性時の対応 フォロー体制、カウンセリング回数 「結果をお伝えするだけ」
確定検査 院内対応か、連携施設があるか 「ご自身で探してください」
費用の内訳 総額、追加費用の有無 「カウンセリング別途」「再検査有料」

💡 施設選びの最重要ポイント

「陽性だった場合、どうなりますか?」と質問してみてください。具体的なフォロー体制を説明できる施設は信頼できます。曖昧な回答や「その時に考えましょう」という施設は避けた方が無難です。

🏥 ミネルバクリニックの特徴

日本で初めて臨床遺伝専門医が遺伝子検査・診断のために開設したクリニックです。
検査前から陽性時のフォローまで、臨床遺伝専門医が一貫して担当します。

よくある質問(FAQ)

Q1. NIPTの費用相場はいくらですか?

NIPTの費用相場は10万〜20万円程度です。認可施設では15〜20万円、非認可施設では検査項目によって8万円〜30万円まで幅があります。価格だけでなく、遺伝カウンセリング体制や陽性時のフォローも含めて検討することが大切です。

Q2. NIPTに保険は適用されますか?

いいえ、NIPTは健康保険の適用外(自費診療)です。全額自己負担となります。ただし、医療費控除の対象となるため、確定申告で税金の還付を受けられる可能性があります。領収書は必ず保管しておきましょう。

Q3. 認可施設と非認可施設の違いは何ですか?

「認可」「非認可」は日本産科婦人科学会による認証制度への登録の有無を指します。認可施設は検査項目が3つのトリソミーに限定されますが体制が整っています。非認可施設は検査項目が豊富ですが、サポート体制は施設により大きな差があります。どちらも合法的な医療行為です。

Q4. 格安NIPTは大丈夫ですか?

10万円を大きく下回る格安NIPTには注意が必要です。遺伝カウンセリングが不十分、精度への不安、陽性時のフォロー不足などのリスクがあります。結果が陽性だった場合、追加のカウンセリング費用や確定検査費用で、結局高額になるケースも多いです。

Q5. NIPTで陽性の場合、確定検査の費用はいくらですか?

羊水検査などの確定検査は通常15〜25万円程度かかります。当院では互助会制度(8,000円)により、確定検査費用を全額カバーしています。経済的な心配なく検査に臨めます。

Q6. ミネルバクリニックの料金体系を教えてください

当院のNIPT料金には、33,000円相当の遺伝カウンセリングが含まれています。検査前の説明、結果説明、陽性時の継続サポートまで追加費用なしで対応します。詳しい料金プランはNIPTトップページをご確認ください。

Q7. 遠方ですが受検できますか?

はい、オンラインNIPTにより全国どこからでも受検可能です。遺伝カウンセリングもオンラインで受けていただけます。お住まいの地域を問わず、臨床遺伝専門医による質の高い検査・カウンセリングを受けられます。

Q8. 支払い方法は何がありますか?

当院では現金、クレジットカード、電子マネーでのお支払いに対応しています。詳しくはご予約時にお問い合わせください。

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参考文献

  • [1] American College of Obstetricians and Gynecologists. Screening for Fetal Chromosomal Abnormalities: ACOG Practice Bulletin, Number 226. Obstet Gynecol. 2020;136(4):e48-e69. [PubMed]
  • [2] Gil MM, et al. Analysis of cell-free DNA in maternal blood in screening for fetal aneuploidies: updated meta-analysis. Ultrasound Obstet Gynecol. 2017;50(3):302-314. [PubMed]
  • [3] Gregg AR, et al. Noninvasive prenatal screening for fetal aneuploidy, 2016 update: a position statement of the American College of Medical Genetics and Genomics. Genet Med. 2016;18(10):1056-1065. [PubMed]
  • [4] International Society for Prenatal Diagnosis. Position Statement from the Chromosome Abnormality Screening Committee on behalf of the Board of the ISPD. Prenat Diagn. 2015;35(8):725-34. [PubMed]
  • [5] Society for Maternal-Fetal Medicine (SMFM). Norton ME, et al. Cell-free DNA analysis for noninvasive examination of trisomy. N Engl J Med. 2015;372(17):1589-97. [PubMed]
  • [6] 日本産科婦人科学会. 母体血を用いた出生前遺伝学的検査(NIPT)に関する指針. [日本産科婦人科学会]
  • [7] 厚生労働省. 出生前検査に関する情報提供. [厚生労働省]
  • [8] Wapner RJ, et al. Chromosomal microarray versus karyotyping for prenatal diagnosis. N Engl J Med. 2012;367(23):2175-84. [PubMed]


プロフィール
仲田洋美 医師(臨床遺伝専門医)

この記事の筆者:仲田 洋美(臨床遺伝専門医)

ミネルバクリニック院長。1995年に医師免許を取得後、臨床遺伝学・内科・腫瘍学を軸に、
のべ10万人以上のご家族の意思決定と向き合ってきた臨床遺伝専門医です。
出生前診断・遺伝学的検査においては、検査結果そのものだけでなく
「結果をどう受け止め、どう生きるか」までを医療の責任と捉え、
一貫した遺伝カウンセリングと医学的支援を行っています。

日本人類遺伝学会認定 臨床遺伝専門医/日本内科学会認定 総合内科専門医/
日本臨床腫瘍学会認定 がん薬物療法専門医。

2025年、国際誌『Global Woman Leader』および『Medical Care Review APAC』の2誌で立て続けに表紙(Cover Story)に抜擢。
「日本のヘルスケア女性リーダー10名」や「アジア太平洋地域のトップ出生前検査サービス」として、世界的な評価を確立しています。


▶ 仲田洋美の詳細プロフィールはこちら

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