神経筋疾患遺伝子パネル検査｜ミネルバクリニック

ACAD9, ACADL, ACADM, ACADVL, ACTA1, AGL, AMPD1, AMPD3, ANO5, ATP2A1, ATP7A, B4GAT1, BAG3, BIN1, BSCL2, CACNA1S, CAPN3, CAV3, CAVIN1, CFL2, CHAT, CHKB, CHRNA1, CHRNB1, CHRND, CHRNE, CHRNG, CLCN1, CNTN1, COL6A1, COL6A2, COL6A3, COLQ, CPT1B, CPT2, CRYAB, DAG1, DES, DMD, DNAJB6, DNM2, DOK7, DPM1, DPM3, DYNC1H1, DYSF, EMD, ETFA, ETFB, FHL1, FKRP, FKTN, FLNC, GAA, GLE1, GNE, GYS1, HADHA, HADHB, IGHMBP2, ISPD, ITGA7, KBTBD13, KLHL40, LAMA2, LAMP2, LARGE1, LDB3, LMNA, LPIN1, MEGF10, MTM1, MTMR14, MUSK, MYH2, MYH7, MYOT, NEB, OPA1, OPA3, PABPN1, PEX1, PEX12, PEX14, PEX2, PEX26, PEX3, PEX5, PEX6, PFKM, PGAM2, PGM1, PHKA1, PLEC, PLEKHG5, PMM2, PNPLA2, POLG, POLG2, POMGNT1, POMGNT2, POMT1, POMT2, PYGM, RAPSN, RRM2B, RXYLT1, RYR1, RYR2, SCN4A, SELENON, SGCA, SGCB, SGCD, SGCE, SGCG, SIL1, SMN1, SMN2, SUCLA2, SYNE1, SYNE2, TCAP, TK2, TMEM43, TNNI2, TNNT1, TNPO3, TPM2, TPM3, TRIM32, TRPV4, TTN, TWNK, TYMP, UBA1, VCP, VRK1 (138遺伝子)

主な遺伝子の詳細：

・DMD遺伝子（ジストロフィン遺伝子）：
デュシェンヌ型およびベッカー型筋ジストロフィーの原因遺伝子。X染色体上に位置し、筋細胞膜タンパク質であるジストロフィンをコードします。

・SMN1遺伝子：
脊髄性筋萎縮症の主要な原因遺伝子。運動ニューロンの生存に必要なSMNタンパク質をコードします。SMN2遺伝子は本検査ではエクソン7-8のみを対象としています。

・FKTN遺伝子：
福山型先天性筋ジストロフィーの原因遺伝子。フクチンというタンパク質をコードし、糖鎖修飾に関与します。

・DMPK遺伝子：
筋強直性ジストロフィー1型の原因遺伝子。CTGリピートの異常伸長により発症します（本パネル検査では塩基配列のみで、リピート伸長検査は別途となります）。

・LMNA遺伝子：
エメリー・ドレフュス型筋ジストロフィーや肢帯型筋ジストロフィーの原因遺伝子。核膜タンパク質をコードします。

・RYR1遺伝子：
セントラルコア病などの先天性ミオパチーの原因遺伝子。筋小胞体のカルシウムチャネルをコードします。

・NEB遺伝子：
ネマリンミオパチーの主要な原因遺伝子。ネブリンというタンパク質をコードします。

・CHRNE遺伝子：
先天性筋無力症候群の原因遺伝子。アセチルコリン受容体のイプシロンサブユニットをコードします。

・GAA遺伝子：
ポンペ病（糖原病II型）の原因遺伝子。酸性α-グルコシダーゼをコードします。

・その他の主要遺伝子：
CAPN3, DYSF, SGCA, SGCB, SGCD, SGCG（肢帯型筋ジストロフィー）、COL6A1, COL6A2, COL6A3（ウルリッヒ型・ベートレム型）、CLCN1（先天性ミオトニー）、SCN4A（筋強直症・周期性四肢麻痺）など、多数の重要な原因遺伝子が含まれています。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、1つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサヌクレオチドリピート伸長）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

遺伝子特異的な注記：

SMN2遺伝子：本検査におけるSMN2遺伝子（NM_017411.3）の検査方法は、SMN1遺伝子で診断的結果が検出された条件下で、エクソン7-8の配列決定および欠失/重複分析に限定されています。この遺伝子の他の領域については配列決定および欠失/重複分析は実施されません。