目次
FANCL遺伝子
FANCL遺伝子産物は、ユビキチンプロテインリガーゼ活性を持つことが予測される。DNA修復とタンパク質のモノユビキチン化に関与している。ファンコニー貧血核複合体の一部であることが予測される。核内で活性を持つことが予測される。生体内で発現している。ファンコニー貧血の研究に利用されている。この遺伝子のヒトのオルソログは、ファンコニー貧血の相補性グループLに関与している。ヒトのFANCL（FA相補群L）にオーソログがある。
承認済シンボル：FANCL
遺伝子名：FA complementation group L
参照：
一次ソース
遺伝子OMIM番号
Ensembl :
AllianceGenome : HGNC : 20748
遺伝子のlocus type :タンパク質をコードする
遺伝子のグループ：PHD finger proteins
FA complementation groups
FA core complex
遺伝子座: 2p16.1
FANCL遺伝子の機能
（参照）
この遺伝子はユビキチンリガーゼをコードしており、Fanconi anemia complementation group (FANC)のメンバーである。このグループのメンバーは、配列の類似性よりもむしろ共通の核タンパク質複合体へのアセンブリによって関連している。この遺伝子は、FANCD2およびFANCIのモノユビキチン化を媒介する相補性グループLのタンパク質をコードしている。ファンコニー貧血は、細胞遺伝学的不安定性、DNA架橋剤に対する過敏性、染色体切断の増加、DNA修復不全を特徴とする遺伝的に異質な劣性疾患である。転写産物は選択的スプライシングにより、複数のバリアントが存在する。2018年5月、RefSeqにより提供 。
Meetei ら（2003）は、PHF9 が FAコア複合体の安定した構成要素であることを示唆するいくつかの証拠を提示した。彼らは、野生型細胞の核および細胞質抽出液の両方でPHF9を検出した。しかし、2つのFANCA（607139）細胞株の溶解液では、PHF9のレベルは核抽出液では野生型よりも著しく低く、細胞質では正常であり、PHF9の核集積がFANCAに依存していることが示唆された。Meeteiら（2003）は、PHF9がin vitroでE3ユビキチンリガーゼ活性を持ち、in vivoでFANCD2（227646）のモノユビキチン化に必須であることを見いだした。彼らは、PHF9がFANCD2のモノユビキチン化に必要な触媒サブユニットとして、FA経路において重要であると結論づけた。
Grompe（2003）は、PHF9が生化学的アプローチによって同定された最初のファンコニー貧血タンパク質であり、明確な酵素活性を持つ最初のファンコニー貧血タンパク質であることを指摘した。PHF9は、DNA複製に伴う外因性DNA損傷を感知するファンコニー貧血コアコンプレックスにおいて、FAAP43と命名されていた。Grompe (2003)は、FAAP90、FAAP100、FAAP250は、おそらく他のファンコニー貧血タンパク質であり、この経路の機能に対する洞察をもたらすことが期待されると述べている。
Tremblayら（2008）は、造血幹細胞の自己複製に関与するNOTCH1（190198）経路の構成要素であるHES1（139605）が、FANCA、FANCF（603467）、FANCG（XRCC9；602956）、およびFANCLと直接作用し、他のFAコア複合体構成要素と作用しないことを酵母2ハイブリッドおよび共イムノプ沈降法により見いだした。変異体解析の結果、個々のFAコアコンポーネントとの相互作用には、HES1内の異なるドメインが必要であることがわかった。HES1は、FA関連変異を持つFAコアコンポーネントとは相互作用しなかったことから、HES1の相互作用には、機能的なFA経路が必要であることが示唆された。HeLa細胞からHES1を欠失させると、個々のFAコアコンポーネント間の正常な相互作用が阻害され、いくつかのFAコアコンポーネントのタンパク質レベルの変化や局在の乱れが見られた。HES1の欠失はまた、DNA架橋剤であるマイトマイシンC（MMC）に対する細胞の感受性を高め、MMCによって誘導されるFANCD2のモノユビキチン化およびFANCD2のMMC誘導巣への局在を減少させた。Tremblayら（2008）は、DNA損傷応答における正常なFAコア複合体の機能には、HES1との相互作用が必要であると結論づけた。彼らは、HES1が欠陥のあるFAコア複合体と相互作用できないことから、HSCのFAにおける欠陥が生じる可能性があると提唱した。
Zhangら（2011）は、酵母2-ハイブリッド解析により、マウスユビキチン結合酵素-2W（UBE2W；614277）がFanclと相互作用することを示し、タンパク質プルダウンおよび共イムノプレシピテーション解析によりその相互作用を確認した。FanclはUbe2w非存在下では細胞内に偏在し、Ube2w存在下では核内に局在していた。Ube2wはユビキチン結合活性を示し、in vitroでFanclのPHDドメインをモノユビキチン化した。
FANCL遺伝子の発現
副腎（RPKM 16.9）、精巣（RPKM 12.0）、その他25組織でユビキタスに発現
FANCL遺伝子と関係のある疾患
※OMIIMの中括弧”{ }”は、多因子疾患または感染症に対する感受性に寄与する変異を示す。[ ]は「非疾患」を示し、主に検査値の異常をもたらす遺伝的変異を示す。クエスチョンマーク”? “は、表現型と遺伝子の関係が仮のものであることを示す。
Fanconi anemia, complementation group L ファンコニ貧血相補群L
OMIM 614083 AR（常染色体劣性） 3
ファンコニー貧血（FA）は、臨床的にも遺伝的にも不均一な疾患であり、ゲノムの不安定性を引き起こす。特徴的な臨床症状として、主要臓器における発育異常、早期発症の骨髄不全、高い癌素因が挙げられる。FA の細胞学的特徴は、DNA 架橋剤に対する過敏性と、DNA 修復の欠陥を示唆する高頻度の染色体異常です（Deakyne and Mazin, 2011 による要約）。
臨床的特徴
Meeteiら（2003）は、相補性グループ未指定のファンコニー貧血（その後FANCLと命名）の個体からの細胞株（EURA868）において、PHF9タンパク質をほとんど、あるいは全く検出しなかった。EURA868 の細胞の表現型は、モノユビキチン化 FANCD2 (613984) の欠如、マイトマイシン C に対する過敏性など他のファンコニー貧血細胞と類似しており、これらのファンコニー貧血の欠陥は PHF9 の異所性発現によって修正された。
Aliら（2009）は、発達遅延、カフェオレ斑、軽度の低細胞化、および白血病の家族歴を有するFANCLの男性患者を報告した。
Vetroら（2015）は、VACTERL（192350）またはVACTERL-H（276950）を思わせる複数の先天性異常を呈する重症型のFANCLを持つ血縁関係のない幼児2例を報告した。最初の患者（症例1b）は、血縁関係にあるモロッコ人の両親から生まれ、妊娠14週の出生前超音波検査で橈骨低形成と子宮内発育遅延を指摘された。その後の検査でファロー四徴症、左腎不全、右腎水腎症、食道閉鎖症が認められた。出生後、hypertelorism（著明な眼間開離と鼻根部の扁平拡大化）、頬のふくらみ、両側親指の欠失がみられた。乳児は2カ月後に死亡し、死後検査で異常が確認された。家族歴には先天性奇形を有する胎児が2例あり、妊娠を中止した1例のデータからも同様の特徴が確認された。2例目はオランダ人の女性で、子宮内発育遅延、水頭症、鼻先陥没を伴う顔面異形、小耳症、口蓋裂、短頸、短前腕、母指欠損のある手の橈側偏位、仙骨低形成、直腸膣瘻を伴う肛門閉鎖を示した。彼女はまた心臓の欠陥と腎臓の低形成を有していた。彼女は生後2日で死亡した。両患者の細胞は，DEBまたはMMCで染色体切断の増加を示し、ファンコニー貧血の診断と一致した．
この記事の著者：仲田洋美（医師）
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この記事の筆者：仲田洋美（医師）
