心臓血管系疾患遺伝子パネル検査

(更新日：2023/05/29)

1 心臓血管系疾患パネル検査

心臓血管系疾患パネル検査

遺伝子パネル検査では、血液などの検体からDNAなどを取り出し、多数の遺伝子のセットに対して検査を行います。この遺伝子たちのセットをパネルと呼びます。

心血管疾患は、すぐに警告サインが出ないため、心臓のイベントが起こるまで診断されないことが多くなります。このパネルは、遺伝性心血管系疾患のリスクを評価することで、この困難を克服するのに役立ちます。検査は、家族性高コレステロール血症、心筋症、不整脈、先天性心疾患、結合組織病など、様々な心血管疾患の臨床管理に役立ちます。この包括的なパネルには、症候群性疾患および非症候群性疾患と関連する遺伝子が含まれています。

心臓血管系疾患パネル検査はどのような人に向いていますか？

このパネルは、心血管疾患、心臓突然死、または原因不明の突然死の個人歴または家族歴を持つすべての人に適切である可能性があります。重要な家族歴のある患者さんには、リスクが存在する場合に適切な予防措置をとることができるように、検査を強くお勧めします。

患者にとってどのような利点がありますか？

心臓病は何歳になっても発症する可能性がありますが、遺伝的な危険因子を若いうちに診断することで、症状の臨床管理に役立てることができます。特定の心臓病のリスクを特定し管理することで、心筋梗塞を予防することができます。

心血管系疾患遺伝子パネル検査では、以下のことが可能です。

適切な診断の確立または確認
関連する症状が追加されるリスクを特定
食事や運動など、ライフスタイルの変更を支援
よりパーソナライズされた症状管理の実現
家族に自身のリスクファクターを伝える
家族計画の選択肢を提供する

心臓血管系疾患パネル検査の対象となる遺伝子

A2ML1, ABCC9, ABL1, ACADVL, ACTA2, ACTB, ACTC1, ACTG1, ACTN2, ACVR2B, ACVRL1, ADA2, ADAMTS10, ADAMTS17, AGL, AKAP9, ALMS1, ANK2, ANKRD1, APOA5, APOB, B4GALT7, BAG3, BBS10, BCOR, BGN, BMPR2, BRAF, C1R, C1S, CACNA1C, CACNA2D1, CACNB2, CALM1, CALM2, CALM3, CALR3, CASQ2, CAV1, CAV3, CAVIN4, CBL, CBS, CCDC103, CCDC39, CCDC40, CHD7, CHRM2, COL1A1, COL3A1, COL5A1, COL5A2, COX15, CPT1A, CPT2, CRELD1, CRYAB, CSRP3, CTF1, CTNNA3, DEPDC5, DES, DMD, DNAAF1, DNAAF2, DNAAF3, DNAAF4, DNAAF5, DNAH11, DNAH5, DNAI1, DNAI2, DNAJC11, DNAJC19, DNAL1, DOLK, DSC2, DSG2, DSP, DTNA, EFEMP2, ELAC2, ELN, EMD, ENG, EYA4, FBN1, FBN2, FGD1, FHL1, FHL2, FKRP, FKTN, FLNA, FLNC, FOXE3, FOXH1, FXN, GAA, GATA4, GATA6, GATAD1, GDF1, GJA1, GJA5, GLA, GPC3, GPD1L, GYG1, HAMP, HAND1, HCN4, HFE, HJV, HRAS, ILK, INVS, IPO8, JAG1, JPH2, JUP, KAT6B, KCNA5, KCND3, KCNE1, KCNE2, KCNE3, KCNE5, KCNH2, KCNJ2, KCNJ5, KCNJ8, KCNK3, KCNQ1, KCNQ2, KCNQ3, KCNT1, KRAS, LAMA4, LAMP2, LDB3, LDLR, LDLRAP1, LEFTY2, LMNA, LOX, LTBP3, LZTR1, MAP2K1, MAP2K2, MAT2A, MED12, MED13L, MFAP5, MIB1, MKS1, MMP21, MRPL3, MTO1, MYBPC3, MYH11, MYH6, MYH7, MYL2, MYL3, MYLK, MYLK2, MYOM1, MYOZ2, MYPN, NDUFAF1, NDUFB11, NEBL, NEK8, NEXN, NF1, NKX2-5, NKX2-6, NME8, NODAL, NOTCH1, NOTCH2, NPHP3, NPPA, NR2F2, NRAS, NSD1, OFD1, PCDH19, PCSK9, PDLIM3, PKD1L1, PKP2, PLN, PLOD1, PRDM16, PRKAG2, PRKG1, PRRT2, PSEN2, PTPN11, RAF1, RANGRF, RASA1, RBM20, RIT1, RRAS, RYR2, SCN10A, SCN1A, SCN1B, SCN2B, SCN3B, SCN4B, SCN5A, SCN8A, SCN9A, SDHA, SGCD, SHOC2, SKI, SLC22A5, SLC25A20, SLC2A1, SLC2A10, SLC40A1, SLMAP, SMAD2, SMAD3, SMAD4, SMAD6, SMAD9, SNTA1, SOS1, SOS2, SYNE1, TAB2, TAZ, TBX1, TBX20, TBX5, TCAP, TFR2, TGFB2, TGFB3, TGFBR1, TGFBR2, TMEM43, TMEM70, TMPO, TNNC1, TNNI3, TNNT2, TPM1, TRDN, TRPM4, TTC8, TTN, TTR, TXNRD2, VCL, YWHAE, ZFPM2, ZIC3 ( 264遺伝子 )

Sequencing（塩基配列の決定）とDel/Dup（欠失/重複）が検査対象となります。

検査に必要な検体

検査に必要な検体は以下の通りです。

血液
唾液*
口腔粘膜ぬぐい液*

*唾液・口腔ぬぐい液の場合、遠隔地の方でもオンライン診療（ビデオスルーでの診察の事をいいます）で遺伝カウンセリングをしたのち、検体を当院にお送りいただく形で、当院にお越しにならずに検査が可能です。遠方の方でもお受けいただけます。

検査の限界

全ての配列決定技術には限界があります。この検査は次世代シークエンサー（NGS）によって行われ、コード領域とスプライシングジャンクションを調べるためにデザインされています。次世代配列決定技術およびバイオインフォマティクス分析は、偽遺伝子配列または他の高度に相同な配列の寄与を優位に減少させますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において、病原性の対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を妨害する場合があります。サンガー法は、低品質スコアのバリアントを確認し適用範囲の基準を満たすために用いられます。整理されていれば、欠失/重複分析により、1つの全遺伝子（口腔ぬぐい液検体及び全血検体）を含み大きさが2つ以上の連続したエクソン（全血検体のみ）であるゲノム領域の変化を同定できます。この検査で単一エクソンの欠失または重複が時々同定されることがありますが、日常的に検出されるものではありません。同定された推定上の欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）によって確認されます。このアッセイは、限定されるものではありませんが、転座または逆位・反復身長（例：トリヌクレオチドまたはヘキサヌクレオチド）・大部分の調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エクソンから20bpを超える）における変化のような疾患を引き起こし得る特定のタイプのゲノム変化を検出しません。このアッセイは、体細胞モザイク現象または体細胞突然変異の検出のためにデザインまたは妥当性が確認されていません。

カバレッジ

遺伝子パネル検査の場合、カバレッジは96% at 20xとなるよう設計されています。

特記事項

遺伝子	特記事項
FXN	疾患と最もよく関連するFXN遺伝子変異は、GAA3塩基反復配列の拡張である。本検査では、特に断りのない限り、この遺伝子の配列変異とコピー数の変化のみを検査する。患者の臨床症状がこの遺伝子に関連する疾患に特異的である場合、反復拡張検査が正当化される場合がある。
ZIC3	現在の検査方法では、この遺伝子のトリヌクレオチドリピート拡張は評価されません。