ワーデンブルグ症候群NGS遺伝子パネル検査｜ミネルバクリニック

EDN3, EDNRB, KIT, KITLG, MITF, PAX3, SNAI2, SOX10 ( 8遺伝子 )

各遺伝子の詳細：
・EDN3遺伝子：
エンドセリン3をコードする遺伝子。EDNRB受容体のリガンドとして機能し、神経堤由来細胞の発達と遊走に重要な役割を果たします。変異はWS4型（ワーデンブルグ・シャー症候群）の原因となり、ヒルシュスプルング病を合併します。常染色体劣性遺伝または常染色体優性遺伝の形式をとります。

・EDNRB遺伝子：
エンドセリンB受容体をコードする遺伝子。腸管神経系とメラノサイトの発達に重要です。変異はWS4型の原因となり、ヒルシュスプルング病と色素異常、難聴を合併します。常染色体劣性遺伝または常染色体優性遺伝の形式をとります。

・KIT遺伝子：
受容体型チロシンキナーゼをコードする遺伝子。メラノサイトの発達、遊走、増殖、生存に重要な役割を果たします。変異は主に色素異常を引き起こし、難聴を伴うこともあります。WS2型の一部の原因となることがあります。

・KITLG遺伝子：
KIT受容体のリガンド（幹細胞因子）をコードする遺伝子。メラノサイトの生存と増殖に重要です。変異は色素異常の原因となり、白髪や皮膚白斑を引き起こします。難聴を伴うこともあります。

・MITF遺伝子：
メラノサイト発達の主要な調節因子である転写因子（microphthalmia-associated transcription factor）をコードする遺伝子。WS2型の最も頻度の高い原因遺伝子の一つです。常染色体優性遺伝形式をとり、難聴と色素異常を引き起こします。内眼角開離は伴いません。

・PAX3遺伝子：
ペアードボックス転写因子3をコードする遺伝子。神経堤細胞の発達に重要な役割を果たします。WS1型（内眼角開離を伴う）およびWS3型（上肢異常を伴う）の主要な原因遺伝子です。常染色体優性遺伝形式をとります。ペアードドメインやホメオドメインの変異により、色素異常のパターンが異なることがあります。

・SNAI2遺伝子：
転写因子SNAIL2（SLUG）をコードする遺伝子。神経堤細胞の遊走に関与します。WS2型の原因遺伝子の一つで、常染色体優性遺伝形式をとります。難聴と色素異常を引き起こしますが、内眼角開離は伴いません。

・SOX10遺伝子：
SRY関連HMGボックス転写因子10をコードする遺伝子。神経堤由来細胞の発達に重要な役割を果たします。WS2型およびWS4型の原因遺伝子です。常染色体優性遺伝形式をとり、難聴と色素異常に加え、一部の症例ではヒルシュスプルング病や中枢神経系の異常（PCW症候群：末梢神経障害、中枢神経障害、ワーデンブルグ症候群、ヒルシュスプルング病の複合）を合併することがあります。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※この検査パネルでは、主要な8の原因遺伝子のみを対象としています。最近の研究では新たに13の遺伝子変異も見つかっており、これらは本検査パネルには含まれていません。また、同一の遺伝子変異を持っていても症状の現れ方は個人によって大きく異なり（不完全浸透）、検査で病原性変異が検出されなくても、臨床症状からワーデンブルグ症候群と診断されることもあります。