アッシャー症候群 遺伝子検査（NGSパネル）｜ミネルバクリニック

ABHD12, ADGRV1, ARSG, CDH23, CEP250, CEP78, CIB2, CLRN1, HARS, MYO7A, PCDH15, PDZD7, RPGR, USH1C, USH1G, USH2A, WHRN ( 17遺伝子 )

各遺伝子の詳細：
・ABHD12遺伝子：
アルファ/ベータ加水分解酵素ドメイン含有タンパク質12をコードする遺伝子。エンドカンナビノイド代謝に関与します。

・ADGRV1遺伝子（GPR98）：
接着性Gタンパク質共役受容体V1をコードする遺伝子。2型アッシャー症候群の原因遺伝子の一つです。内耳と網膜の細胞間接着に重要な役割を果たします。

・ARSG遺伝子：
アリールスルファターゼGをコードする遺伝子。

・CDH23遺伝子：
カドヘリン23をコードする遺伝子。1型アッシャー症候群の原因遺伝子で、MYO7Aに次いで頻度が高いです。感覚有毛細胞の束（Tip link）の構成要素であり、機械刺激を神経信号に変換する過程に関与します。

・CEP250遺伝子：
中心体タンパク質250をコードする遺伝子。中心体の機能に関与します。

・CEP78遺伝子：
中心体タンパク質78をコードする遺伝子。中心体の機能に関与します。

・CIB2遺伝子：
カルシウムおよびインテグリン結合タンパク質2をコードする遺伝子。感覚有毛細胞の機能に関与します。

・CLRN1遺伝子：
クラリン1をコードする遺伝子。3型アッシャー症候群の主要な原因遺伝子です。内耳と網膜の発達と維持に重要な役割を果たします。フィンランド人やアシュケナージ系ユダヤ人で頻度が高いことが知られています。

・HARS遺伝子：
ヒスチジルtRNA合成酵素をコードする遺伝子。タンパク質合成に関与します。

・MYO7A遺伝子：
ミオシンVIIAをコードする遺伝子。1型アッシャー症候群の最も頻度の高い原因遺伝子です。内耳の感覚有毛細胞と網膜の視細胞の機能に重要な役割を果たす運動タンパク質です。細胞内輸送やシナプス機能に関与しています。

・PCDH15遺伝子：
プロトカドヘリン15をコードする遺伝子。1型アッシャー症候群の原因遺伝子の一つです。CDH23と協調して感覚有毛細胞の束（Tip link）を形成し、機械刺激の伝達に関与します。

・PDZD7遺伝子：
PDZドメイン含有タンパク質7をコードする遺伝子。感覚有毛細胞の機能に関与します。

・RPGR遺伝子：
網膜色素変性GTPアーゼ制御因子をコードする遺伝子。X連鎖性網膜色素変性の原因遺伝子としても知られています。この検査では、特に重要なORF15領域の変異を検出できますが、一部の複雑な領域は完全には検出できない場合があります。

・USH1C遺伝子：
ハーモニンをコードする遺伝子。1型アッシャー症候群の原因遺伝子の一つです。感覚有毛細胞のシナプス機能に関与します。

・USH1G遺伝子：
SANSタンパク質をコードする遺伝子。1型アッシャー症候群の原因遺伝子の一つです。中心体の機能と感覚有毛細胞の発達に関与します。

・USH2A遺伝子：
ウシェリンをコードする遺伝子。2型アッシャー症候群の最も頻度の高い原因遺伝子です。内耳の支持組織と網膜の基底膜の維持に関与する大きな細胞外マトリックスタンパク質です。

・WHRN遺伝子（DFNB31）：
ウィルリンをコードする遺伝子。2型アッシャー症候群の原因遺伝子の一つです。感覚有毛細胞の機能に関与します。

RPGR遺伝子に関する重要な注意事項：
この検査はRPGR遺伝子の重要な「ORF15」領域（NM_001034853.1）のほとんどの病原性変異を検出できます。ただし、この領域の複雑性により、現在利用可能な検査技術では一部の領域（chrX(GRCh37):38144792-38146498）の変異を完全には検出できない場合があります。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

RPGR遺伝子の特記事項：
この検査はRPGR遺伝子の重要な「ORF15」領域（NM_001034853.1）のほとんどの病原性変異を検出できます。しかし、この領域の複雑性により、現在利用可能な検査技術では一部の領域（chrX(GRCh37):38144792-38146498）の変異を完全には検出できません。

※現在同定されている17の原因遺伝子のみを対象としています。検査で病原性変異が検出されなくても、アッシャー症候群を完全に否定することはできません。臨床症状と電気生理学的検査、眼科検査に基づいた診断と管理が引き続き重要です。