ステロイド抵抗性ネフローゼ症候群遺伝子検査（NGSパネル）｜ミネルバクリニック

ACTN4, CD2AP, COQ2, INF2, LAMB2, LMX1B, NPHS1, NPHS2, PDSS2, PLCE1, SCARB2, SMARCAL1, TRPC6, WT1 ( 14遺伝子 )

各遺伝子の詳細：
・ACTN4遺伝子：
α-アクチニン4をコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式で、アクチン架橋蛋白として足細胞の細胞骨格を安定化させます。変異によりアクチン結合能が亢進し、細胞骨格の生物物理学的特性が変化します。成人期に蛋白尿が出現し、慢性腎不全へ進行します。

・CD2AP遺伝子：
CD2関連蛋白をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、スリット膜とアクチン細胞骨格を繋ぐアダプター蛋白として機能します。小児期発症のステロイド抵抗性ネフローゼ症候群の原因となります。

・COQ2遺伝子：
コエンザイムQ2（4-ヒドロキシ安息香酸ポリプレニルトランスフェラーゼ）をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、ミトコンドリアにおけるコエンザイムQ10（CoQ10）の生合成に必須の酵素です。変異により早期発症型ネフローゼ症候群と神経症状を呈することがあります。

・INF2遺伝子：
逆転フォーミン2をコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式で、成人発症の家族性FSGSの最も頻度の高い原因遺伝子（最大17％）です。アクチンと微小管の細胞骨格の再構成に関与するジアファナス関連フォーミンファミリーのメンバーです。

・LAMB2遺伝子：
ラミニンβ2鎖をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、糸球体基底膜の主要構成成分です。変異によりピアソン症候群（先天性ネフローゼ症候群、眼異常、神経発達遅滞を特徴とする）を引き起こします。

・LMX1B遺伝子：
LIMホメオボックス転写因子1βをコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式で、爪膝蓋骨症候群（爪異形成、膝蓋骨形成不全、腎疾患を特徴とする）の原因となります。足細胞の発生と分化に重要な役割を果たします。

・NPHS1遺伝子：
ネフリンをコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、スリット膜の主要構成蛋白として糸球体濾過バリアの中心的役割を果たします。先天性ネフローゼ症候群のフィンランド型の原因遺伝子として最初に同定されました。生後間もなく発症する重症型が多いですが、小児期や成人発症例も報告されています。200以上の病的変異が同定されています。

・NPHS2遺伝子：
ポドシンをコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、スリット膜の構成成分として機能します。小児期発症のステロイド抵抗性ネフローゼ症候群で最も頻度の高い原因遺伝子です。生後3ヶ月から6歳の間に発症することが多く、ステロイドや免疫抑制薬に反応しません。腎移植後の再発リスクは低いことが知られています。

・PDSS2遺伝子：
プレニルジホスフェート合成酵素サブユニット2をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、ミトコンドリアにおけるコエンザイムQ10の生合成に関与します。変異により早期発症型ネフローゼ症候群を引き起こします。

・PLCE1遺伝子：
ホスホリパーゼCε1をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、細胞内シグナル伝達に関与します。早期発症型ネフローゼ症候群の原因となり、びまん性メサンギウム硬化症を呈することがあります。

・SCARB2遺伝子：
スカベンジャー受容体クラスBメンバー2（リソソーム統合膜蛋白2、LIMP-2）をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、アクションミオクローヌス腎不全症候群（進行性ミオクローヌスてんかんとネフローゼ症候群を特徴とする）の原因となります。

・SMARCAL1遺伝子：
SWI/SNF関連マトリックス関連アクチン依存性クロマチン調節因子サブファミリーAライク1をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、DNA修復とクロマチンリモデリングに関与します。シンメル・ライトシュナイダー症候群（免疫不全、腎疾患、骨異常を特徴とする）の原因となります。

・TRPC6遺伝子：
一過性受容体電位カチオンチャネル6をコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式で、カルシウム透過性陽イオンチャネルとして機能します。変異により機能亢進型となり、チャネル活性が増加します。家族性FSGSの約6％、孤発性FSGSの約2％の原因となります。通常、非ネフローゼ域の蛋白尿で発症し、徐々に腎機能が低下します。

・WT1遺伝子：
ウィルムス腫瘍1蛋白をコードする遺伝子。転写因子として足細胞の発生と維持に重要な役割を果たします。変異によりデニス・ドラッシュ症候群（びまん性メサンギウム硬化症、偽性半陰陽、ウィルムス腫瘍を特徴とする）やフレイジャー症候群（FSGS、性分化異常を特徴とする）などの症候群性ネフローゼ症候群を引き起こします。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※この検査パネルでは、14の原因遺伝子のみを対象としています。約70％のステロイド抵抗性ネフローゼ症候群症例では、既知の遺伝子に変異が見つかりません。検査で病原性変異が検出されなくても、疾患を完全に否定することはできません。