尿細管性アシドーシス(RTA) NGS遺伝子パネル検査｜ミネルバクリニック

ATP6V0A4, ATP6V1B1, CA2, HNF4A, SLC34A1, SLC4A1, SLC4A4 ( 7遺伝子 )

各遺伝子の詳細：
・ATP6V0A4遺伝子：
液胞型H+-ATPaseのa4サブユニットをコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、1型（遠位型）尿細管性アシドーシスの原因となります。ATP6V1B1遺伝子変異と異なり、難聴を伴わないか軽度です。遠位尿細管の介在細胞における酸分泌に必須の役割を果たします。

・ATP6V1B1遺伝子：
液胞型H+-ATPaseのB1サブユニットをコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、1型（遠位型）尿細管性アシドーシスの最も頻度の高い原因遺伝子の一つです。特徴的に感音性難聴を伴います。この遺伝子変異による難聴は進行性で不可逆的であり、早期からの聴力管理が重要です。内耳のコルチ器における酸分泌にも関与しています。

・CA2遺伝子：
炭酸脱水酵素II（Carbonic Anhydrase II）をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、2型（近位型）尿細管性アシドーシスの原因となります。本遺伝子変異では、RTA以外に大理石骨病（骨硬化症）、脳石灰化、知的障害を伴う稀な症候群を呈します。炭酸脱水酵素は水と二酸化炭素から炭酸を生成する反応を触媒し、尿細管での重炭酸イオンの再吸収と破骨細胞での酸分泌に重要な役割を果たします。

・HNF4A遺伝子：
肝細胞核因子4α（Hepatocyte Nuclear Factor 4 Alpha）をコードする転写因子の遺伝子。常染色体優性遺伝形式で、MODY1型糖尿病の原因遺伝子として知られていますが、ファンコーニ症候群を伴う2型尿細管性アシドーシスの原因ともなります。近位尿細管の発達と機能維持に関わる遺伝子発現を制御しています。

・SLC34A1遺伝子：
Na+/Pi共輸送体IIa（Sodium-Phosphate Cotransporter Type 2a）をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、近位尿細管におけるリン酸の再吸収に関与します。本遺伝子変異では、低リン血症性くる病と2型尿細管性アシドーシスを呈します。

・SLC4A1遺伝子：
陰イオン交換体1（Anion Exchanger 1、別名バンド3タンパク質）をコードする遺伝子。赤血球膜および遠位尿細管の介在細胞に発現し、Cl-とHCO3-の交換を行います。遺伝形式により重症度が異なり、常染色体優性遺伝では成人発症の軽症1型RTAが多く、常染色体劣性遺伝では小児発症の重症1型RTAと溶血性貧血を伴います。赤血球の形態異常（球状赤血球症、楕円赤血球症）を呈することもあります。

・SLC4A4遺伝子：
電解質依存性Na+/HCO3-共輸送体1（Electrogenic Sodium Bicarbonate Cotransporter 1、NBC-1）をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、2型（近位型）尿細管性アシドーシスの原因となります。近位尿細管における重炭酸イオンの再吸収に必須の役割を果たします。特徴的に眼症状（白内障、緑内障、帯状角膜症）を伴います。このタンパク質は眼内でも発現しており、房水の産生と眼内圧の調節に関与しています。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※この検査パネルでは、7の原因遺伝子のみを対象としています。遺伝性尿細管性アシドーシスの原因遺伝子はこれら以外にも存在する可能性があります。検査で病原性変異が検出されなくても、疾患を完全に否定することはできません。また、後天性の尿細管性アシドーシス（シェーグレン症候群、ファンコーニ症候群、薬剤性など）の診断には、この遺伝子検査は適用されません。