肺動脈性肺高血圧症NGS遺伝子検査｜ミネルバクリニック

ABCC8, ACVRL1, ATP13A3, BMPR2, CAV1, EIF2AK4, ENG, GDF2, GGCX, KCNA5, KCNK3, KDR, SMAD9, SOX17, TBX4, TET2 ( 16遺伝子 )

各遺伝子の詳細：
・ABCC8遺伝子：
ATP結合カセットサブファミリーCメンバー8をコードする遺伝子。カリウムチャネルの調節に関与します。

・ACVRL1遺伝子（ALK1）：
アクチビン受容体様キナーゼ1をコードする遺伝子。TGF-βシグナル伝達経路に関与し、遺伝性出血性毛細血管拡張症（HHT）との関連も知られています。ACVRL1遺伝子変異は遺伝性PAHの原因の一つです。

・ATP13A3遺伝子：
P型ATPアーゼをコードする遺伝子。細胞内イオン輸送に関与します。

・BMPR2遺伝子：
骨形成タンパク質受容体2型をコードする遺伝子。TGF-βスーパーファミリーのシグナル伝達に関与します。遺伝性PAHの最も頻度の高い原因遺伝子で、家族性PAHの約75％、孤発性IPAHの約25％に変異が認められます。BMPR2遺伝子変異により、肺動脈における平滑筋細胞の増殖と肺動脈内皮細胞の過剰なアポトーシスが誘導されます。

・CAV1遺伝子：
カベオリン1をコードする遺伝子。細胞膜カベオラの主要構成成分で、細胞内シグナル伝達に関与します。

・EIF2AK4遺伝子：
真核生物翻訳開始因子2αキナーゼ4をコードする遺伝子。タンパク質合成の調節に関与し、特に肺毛細血管腫症（PCH）との関連が知られています。

・ENG遺伝子（エンドグリン）：
エンドグリンをコードする遺伝子。血管内皮細胞に発現し、TGF-βシグナル伝達に関与します。遺伝性出血性毛細血管拡張症（HHT）の原因遺伝子としても知られています。

・GDF2遺伝子（BMP9）：
成長分化因子2（骨形成タンパク質9）をコードする遺伝子。血管の恒常性維持に関与します。

・GGCX遺伝子：
γ-グルタミルカルボキシラーゼをコードする遺伝子。ビタミンK依存性タンパク質の翻訳後修飾に関与します。

・KCNA5遺伝子：
電位依存性カリウムチャネルKv1.5をコードする遺伝子。肺動脈平滑筋細胞のカリウムチャネルとして機能します。

・KCNK3遺伝子：
2ポアドメインカリウムチャネルTASK-1をコードする遺伝子。肺動脈平滑筋細胞の静止膜電位の維持に関与します。

・KDR遺伝子（VEGFR2）：
血管内皮増殖因子受容体2をコードする遺伝子。血管新生と血管透過性の調節に関与します。

・SMAD9遺伝子（SMAD8）：
SMAD9（SMAD8としても知られる）をコードする遺伝子。BMPシグナル伝達経路の細胞内メディエーターとして機能します。

・SOX17遺伝子：
SRY関連HMGボックス転写因子17をコードする遺伝子。血管内皮細胞の分化と維持に関与します。

・TBX4遺伝子：
Tボックス転写因子4をコードする遺伝子。胎児期の肺と下肢の発生に関与します。TBX4遺伝子変異は、PAHに加え、指から肢体の異常、呼吸器疾患、発達障害、先天性心疾患など様々な表現型を伴うことがあります。

・TET2遺伝子：
テン-イレブン転座2をコードする遺伝子。DNAメチル化の調節に関与するエピジェネティック制御因子です。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※この検査パネルでは、16の原因遺伝子のみを対象としています。特発性・遺伝性肺動脈性肺高血圧症の全ての症例で既知の遺伝子に変異が見つかるわけではありません。検査で病原性変異が検出されなくても、疾患を完全に否定することはできません。