パーキンソン病包括的遺伝子検査（NGS 26遺伝子パネル）｜ミネルバクリニック

ATP13A2, ATP1A3, CSF1R, DCTN1, DNAJC6, EIF4G1, FBXO7, GBA, GCH1, HTRA2, LRRK2, MAPT, NOTCH3, PARK7, PINK1, PLA2G6, POLG, PRKN, PRKRA, PRNP, SLC6A3, SNCA, TAF1, TH, UCHL1, VPS35 ( 26遺伝子 )

各遺伝子の詳細：
・ATP13A2遺伝子（PARK9）：
リソソーム型P型ATPアーゼをコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、若年発症型パーキンソン病の原因となり、認知症を合併することがあります。クーフォー・ラケボーク症候群の原因遺伝子でもあります。

・ATP1A3遺伝子：
Na+/K+-ATPアーゼα3サブユニットをコードする遺伝子。急速発症ジストニア・パーキンソニズムの原因となります。

・CSF1R遺伝子：
コロニー刺激因子1受容体をコードする遺伝子。脳白質症を伴うパーキンソニズムの原因となります。

・DCTN1遺伝子：
ダイナクチンをコードする遺伝子。細胞内輸送に関与し、運動ニューロン障害を伴うことがあります。

・DNAJC6遺伝子（PARK19）：
シナプス小胞のエンドサイトーシスに関与する遺伝子。若年発症型パーキンソン病の原因となります。

・EIF4G1遺伝子：
真核生物翻訳開始因子4γをコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式のパーキンソン病の原因となります。

・FBXO7遺伝子（PARK15）：
F-box タンパク質7をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、若年発症型パーキンソン病の原因となり、錐体路徴候を伴うことがあります。

・GBA遺伝子：
グルコセレブロシダーゼをコードする遺伝子。ゴーシェ病の原因遺伝子であり、変異保因者はパーキンソン病の発症リスクが5～10倍高くなります。孤発性パーキンソン病の最も重要なリスク遺伝子です。

・GCH1遺伝子（PARK3）：
GTPシクロヒドロラーゼIをコードする遺伝子。ドパ反応性ジストニアやパーキンソニズムの原因となります。

・HTRA2遺伝子（PARK13）：
セリンプロテアーゼをコードする遺伝子。ミトコンドリア機能に関与します。

・LRRK2遺伝子（PARK8）：
ロイシンリッチリピートキナーゼ2をコードする遺伝子。常染色体優性遺伝性パーキンソン病の最も頻度の高い原因遺伝子です。欧米では遺伝性パーキンソン病の約5％、日本では約1％を占めます。

・MAPT遺伝子：
微小管結合タンパク質タウをコードする遺伝子。前頭側頭型認知症とパーキンソニズムの原因となります。

・NOTCH3遺伝子：
NOTCH3受容体をコードする遺伝子。CADASIL（皮質下梗塞と白質脳症を伴う常染色体優性脳動脈症）の原因遺伝子で、血管性パーキンソニズムに関連します。

・PARK7（DJ-1）遺伝子：
DJ-1タンパク質をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、若年発症型パーキンソン病の原因となります。酸化ストレスからの細胞保護に関与します。

・PINK1遺伝子（PARK6）：
PTEN誘導キナーゼ1をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、若年性パーキンソン病の原因遺伝子です。ミトコンドリアの品質管理に関与します。

・PLA2G6遺伝子（PARK14）：
カルシウム非依存性ホスホリパーゼA2をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、若年発症型パーキンソン病やジストニア・パーキンソニズムの原因となります。

・POLG遺伝子：
ミトコンドリアDNAポリメラーゼγをコードする遺伝子。ミトコンドリア病に伴うパーキンソニズムの原因となります。

・PRKN遺伝子（PARK2）：
パーキンをコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、若年性パーキンソン病の最も頻度の高い原因遺伝子です。日本の若年性パーキンソン病の約50％を占めます。

・PRKRA遺伝子：
dsRNA結合タンパク質をコードする遺伝子。ジストニア・パーキンソニズムの原因となることがあります。

・PRNP遺伝子：
プリオンタンパク質をコードする遺伝子。プリオン病に伴うパーキンソニズムの原因となります。

・SLC6A3遺伝子：
ドパミントランスポーターをコードする遺伝子。小児期発症のジストニア・パーキンソニズムの原因となります。

・SNCA遺伝子（PARK1/4）：
αシヌクレインをコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式で、遺伝性パーキンソン病で最初に同定された遺伝子です。レビー小体の主要構成成分であり、パーキンソン病の病態に中心的な役割を果たします。

・TAF1遺伝子：
TFIID基本転写因子複合体のサブユニットをコードする遺伝子。X連鎖遺伝性パーキンソン病の原因遺伝子で、主にフィリピンの一部地域で報告されています。

・TH遺伝子：
チロシン水酸化酵素をコードする遺伝子。ドパミン合成の律速酵素で、ドパ反応性ジストニアやパーキンソニズムの原因となります。

・UCHL1遺伝子（PARK5）：
ユビキチンC末端加水分解酵素L1をコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式のパーキンソン病の原因となります。

・VPS35遺伝子（PARK17）：
液胞タンパク質選別35をコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式で、小胞輸送に関与します。比較的稀な原因遺伝子です。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※この検査パネルでは、26の原因遺伝子のみを対象としています。パーキンソン病の約90～95％は原因不明の孤発性であり、既知の遺伝子に変異が見つからないことも多くあります。検査で病原性変異が検出されなくても、パーキンソン病を完全に否定することはできません。