部分性無歯症（Oligodontia）遺伝子検査NGSパネル｜ミネルバクリニック

ANKRD11, ATP6V1B2, AXIN2, BCL11B, BCOR, CCBE1, CDH1, CEP152, CLDN1, DSP, DVL1, EDA, EDAR, EDARADD, EVC2, FLNA, GREM2, HNRNPK, HUWE1, KCNJ2, KIF1BP, KREMEN1, LRP6, LTBP3, MESD, MSX1, PAX9, PDE3A, PIK3C2A, POLR3A, POLR3B, PORCN, PPP1R15B, PTH1R, PTHLH, ROR2, RUNX2, SATB2, SH3BP2, SLC25A24, SMOC2, TP63, UBR1, WNT10A, WNT10B, ZSWIM6 ( 46遺伝子 )

各遺伝子の詳細：

・ANKRD11遺伝子：
KBG症候群の原因遺伝子。歯牙異常、巨大前歯、骨格異常を伴います。

・ATP6V1B2遺伝子：
常染色体劣性遺伝形式。V-ATPaseサブユニットをコードし、歯の形成に関与します。

・AXIN2遺伝子：
oligodontia-癌素因症候群の原因遺伝子。WNTシグナル伝達経路に関与し、大腸ポリポーシス、大腸癌、乳癌のリスクを高めます。

・BCL11B遺伝子：
免疫不全症と歯牙異常を伴う症候群の原因遺伝子。

・BCOR遺伝子：
X連鎖性の眼歯指症候群（oculofaciocardiodental syndrome）の原因遺伝子。

・CCBE1遺伝子：
Hennekam症候群の原因遺伝子。リンパ浮腫、知的障害、歯牙異常を伴います。

・CDH1遺伝子：
E-カドヘリンをコードする遺伝子。歯無発生と遺伝性胃癌のリスクに関連します。

・CEP152遺伝子：
小頭症と歯牙異常を伴う常染色体劣性疾患の原因遺伝子。

・CLDN1遺伝子：
NISCH症候群（Neonatal Ichthyosis-Sclerosing Cholangitis）の原因遺伝子。

・DSP遺伝子：
デスモプラキンをコードし、外胚葉異形成症の一部で歯牙異常を伴います。

・DVL1遺伝子：
Robinow症候群の原因遺伝子の一つ。WNTシグナル伝達経路に関与します。

・EDA遺伝子：
X連鎖性低汗性外胚葉異形成症の原因遺伝子。最も頻度の高い外胚葉異形成症で、発汗障害、毛髪の菲薄化、歯牙異常を伴います。

・EDAR遺伝子：
常染色体優性または劣性遺伝の低汗性外胚葉異形成症の原因遺伝子。TNF/NF-κBシグナル伝達経路に関与します。

・EDARADD遺伝子：
常染色体劣性遺伝の低汗性外胚葉異形成症の原因遺伝子。

・EVC2遺伝子：
Ellis-Van Creveld症候群の原因遺伝子。四肢短縮、多指症、先天性心疾患、歯牙異常を伴います。

・FLNA遺伝子：
X連鎖性のフロントメタフィジール異形成症の原因遺伝子。

・GREM2遺伝子：
BMP拮抗因子をコードし、歯の発生に関与します。

・HNRNPK遺伝子：
Au-Kline症候群の原因遺伝子。知的障害、特徴的顔貌、歯牙異常を伴います。

・HUWE1遺伝子：
X連鎖性知的障害と歯牙異常を伴う症候群の原因遺伝子。

・KCNJ2遺伝子：
Andersen-Tawil症候群の原因遺伝子。周期性四肢麻痺、不整脈、歯牙異常を伴います。

・KIF1BP遺伝子：
Goldberg-Shprintzen症候群の原因遺伝子。ヒルシュスプルング病、知的障害、歯牙異常を伴います。

・KREMEN1遺伝子：
WNTシグナル伝達経路の調節因子をコードし、歯の発生に関与します。

・LRP6遺伝子：
WNT共受容体をコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式で、歯無発生、冠動脈疾患、代謝異常を伴うことがあります。

・LTBP3遺伝子：
常染色体劣性遺伝形式。TGF-β結合タンパク質をコードし、歯牙異常、短指症を伴います。

・MESD遺伝子：
LRP5/6のシャペロンタンパク質をコードし、WNTシグナル伝達に関与します。

・MSX1遺伝子：
最も頻度の高い原因遺伝子の一つ。常染色体優性遺伝形式で、主に第二小臼歯と第三大臼歯の欠如と関連します。Witkop症候群、口蓋裂を伴うoligodontiaの原因となります。

・PAX9遺伝子：
MSX1とともに頻度の高い原因遺伝子。常染色体優性遺伝形式で、主に大臼歯の欠如と関連します。

・PDE3A遺伝子：
高血圧症と歯牙異常を伴う症候群の原因遺伝子。

・PIK3C2A遺伝子：
ホスファチジルイノシトール3-キナーゼをコードし、細胞増殖に関与します。

・POLR3A遺伝子：
RNAポリメラーゼIIIサブユニットをコードし、4H症候群（Hypomyelination, Hypodontia, Hypogonadotropic Hypogonadism）の原因となります。

・POLR3B遺伝子：
POLR3Aと同様に4H症候群の原因遺伝子。常染色体劣性遺伝形式です。

・PORCN遺伝子：
X連鎖性のFocal Dermal Hypoplasiaの原因遺伝子。皮膚、骨格、歯牙の異常を伴います。

・PPP1R15B遺伝子：
タンパク質脱リン酸化酵素をコードし、ストレス応答に関与します。

・PTH1R遺伝子：
副甲状腺ホルモン受容体をコードし、骨格異常と歯牙異常を伴う疾患の原因となります。

・PTHLH遺伝子：
副甲状腺ホルモン関連ペプチドをコードし、歯の発生に関与します。

・ROR2遺伝子：
Robinow症候群の原因遺伝子。骨格異常、特徴的顔貌、歯牙異常を伴います。

・RUNX2遺伝子：
鎖骨頭蓋異形成症の原因遺伝子。鎖骨の低形成、大泉門の開存、多数の過剰歯と歯牙異常を伴います。常染色体優性遺伝形式です。注記：現在の検査方法では三塩基リピート伸長は評価しません。

・SATB2遺伝子：
SATB2関連症候群の原因遺伝子。口蓋裂、歯牙異常、知的障害を伴います。

・SH3BP2遺伝子：
ケルビズム（家族性骨線維性異形成症）の原因遺伝子。常染色体優性遺伝形式で、顎骨の対称性膨隆、歯牙異常を伴います。

・SLC25A24遺伝子：
ミトコンドリアATP-Mg/Pi輸送体をコードし、Gorlin-Chaudhry-Moss症候群の原因となります。

・SMOC2遺伝子：
SPARC関連モジュラーカルシウム結合タンパク質をコードし、歯の発生に関与します。

・TP63遺伝子：
p53ファミリー転写因子をコードし、EEC症候群、ADULT症候群、裂手裂足外胚葉異形成症候群など多様な症候群の原因となります。歯牙異常、四肢異常、皮膚異常を伴います。

・UBR1遺伝子：
Johanson-Blizzard症候群の原因遺伝子。膵外分泌不全、知的障害、歯牙異常を伴います。

・WNT10A遺伝子：
非症候群性oligodontiaの最も頻度の高い原因遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、30～50％の症例に変異が認められます。低汗性外胚葉異形成症、歯爪皮膚異形成症、Schöpf-Schulz-Passarge症候群の原因遺伝子でもあります。

・WNT10B遺伝子：
WNT10Aと類似の機能を持ち、WNTシグナル伝達経路に関与します。

・ZSWIM6遺伝子：
常染色体優性遺伝の知的障害と歯牙異常を伴う症候群の原因遺伝子。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※RUNX2遺伝子については、現在の検査方法では三塩基リピート伸長は評価しません。

※この検査パネルでは、46の原因遺伝子のみを対象としています。約50～60％の部分性無歯症症例では、既知の遺伝子に変異が見つかりません。検査で病原性変異が検出されなくても、疾患を完全に否定することはできません。