好中球減少症NGS遺伝子パネル検査｜ミネルバクリニック

AP3B1, CSF3R, CXCR4, ELANE, G6PC3, GATA1, GATA2, GFI1, HAX1, LAMTOR2, LYST, RAB27A, RAC2, SBDS, SLC37A4, TAZ, USB1, VPS13B, VPS45, WAS, WIPF1 ( 21遺伝子 )

各遺伝子の詳細：
・AP3B1遺伝子：
アダプタータンパク質複合体3ベータ1サブユニットをコードする遺伝子。ハーマンスキー・パドラック症候群2型の原因となり、好中球減少と色素異常を伴います。常染色体劣性遺伝形式をとります。

・CSF3R遺伝子：
コロニー刺激因子3受容体（G-CSF受容体）をコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式で、重症先天性好中球減少症の原因となります。変異によりG-CSF治療への反応が低下することがあります。

・CXCR4遺伝子：
CXCケモカイン受容体4をコードする遺伝子。WHIM症候群（疣贅、低ガンマグロブリン血症、感染症、骨髄カテキシス）の原因となり、好中球減少を呈します。

・ELANE遺伝子（好中球エラスターゼ）：
タンパク質分解酵素である好中球エラスターゼをコードする遺伝子。重症先天性好中球減少症と周期性好中球減少症の最も多い原因遺伝子です。常染色体優性遺伝形式をとります。変異により好中球の成熟障害が生じます。

・G6PC3遺伝子：
グルコース6-ホスファターゼ触媒サブユニット3をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、重症先天性好中球減少症の原因となります。心血管系や泌尿生殖器系の異常を伴うことがあります。

・GATA1遺伝子：
転写因子GATA1をコードする遺伝子。X連鎖遺伝形式で、好中球減少、貧血、血小板減少を伴うことがあります。

・GATA2遺伝子：
転写因子GATA2をコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式で、好中球減少、単球減少、B細胞・NK細胞減少を伴うMonoMAC症候群の原因となります。

・GFI1遺伝子：
成長因子非依存性1転写抑制因子をコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式で、重症先天性好中球減少症の原因となります。好中球の分化に重要な役割を果たします。

・HAX1遺伝子：
HCLS1関連タンパク質X-1をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、コストマン症候群の原因遺伝子です。アポトーシス（細胞死）の調節に関与し、重症の好中球減少を呈します。神経症状を伴うこともあります。

・LAMTOR2遺伝子：
リソソーム関連膜タンパク質調節因子2をコードする遺伝子。好中球減少症の原因となります。

・LYST遺伝子：
リソソーム輸送調節因子をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、チェディアック・東症候群の原因遺伝子です。好中球減少、易感染性、部分的白皮症、出血傾向を特徴とします。

・RAB27A遺伝子：
低分子量Gタンパク質RAB27Aをコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、グリセリ症候群2型の原因遺伝子です。好中球減少、免疫不全、部分的白皮症を呈します。

・RAC2遺伝子：
RAS関連C3ボツリヌス毒素基質2をコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式で、好中球機能障害と好中球減少を呈します。

・SBDS遺伝子：
シュワッハマン・ボダイアン・ダイアモンド症候群タンパク質をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、シュワッハマン・ダイアモンド症候群の原因遺伝子です。好中球減少に加えて膵外分泌機能不全、骨格異常、骨髄不全を伴います。

・SLC37A4遺伝子：
グルコース6-リン酸トランスポーターをコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、糖原病Ib型の原因遺伝子です。好中球減少と低血糖を特徴とします。

・TAZ遺伝子：
タファジンをコードする遺伝子。X連鎖遺伝形式で、バース症候群の原因遺伝子です。心筋症、好中球減少、ミトコンドリア異常を呈します。

・USB1遺伝子：
U6 snRNA生合成因子1をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、ポイキロデルマと好中球減少症候群の原因遺伝子です。

・VPS13B遺伝子：
液胞タンパク質選別13ホモログBをコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、コーエン症候群の原因遺伝子です。好中球減少、知的障害、網膜色素変性症を伴います。

・VPS45遺伝子：
液胞タンパク質選別45ホモログをコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、小胞輸送に関与します。好中球減少に加えて骨髄線維症、腎障害を伴うことがあります。

・WAS遺伝子：
ウィスコット・アルドリッチ症候群タンパク質をコードする遺伝子。X連鎖劣性遺伝形式で、ウィスコット・アルドリッチ症候群の原因遺伝子です。好中球減少、血小板減少、湿疹、易感染性を特徴とします。

・WIPF1遺伝子：
WASタンパク質相互作用タンパク質をコードする遺伝子。X連鎖遺伝形式で、好中球減少症の原因となります。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※この検査パネルでは、21の原因遺伝子のみを対象としています。すべての好中球減少症症例で遺伝子変異が検出されるわけではありません。検査で病原性変異が検出されなくても、疾患を完全に否定することはできません。また、後天性好中球減少症の場合は、遺伝子検査では原因を特定できません。