脳内鉄沈着神経変性症（NBIA）遺伝子検査NGSパネル｜ミネルバクリニック

ATP13A2, C19orf12, COASY, CP, DCAF17, FA2H, FTL, GTPBP2, PANK2, PLA2G6, SCP2, WDR45 ( 12遺伝子 )

各遺伝子の詳細：
・PANK2遺伝子：
パントテン酸キナーゼ2をコードする遺伝子。この酵素はコエンザイムA（CoA）の生合成に必須です。変異により引き起こされるPKAN（Pantothenate Kinase-Associated Neurodegeneration）は、NBIAの中で最も頻度が高く、典型例では小児期発症の進行性ジストニアと網膜色素変性症を呈します。MRIで「eye-of-the-tiger sign」と呼ばれる特徴的な所見が認められます。

・PLA2G6遺伝子：
ホスホリパーゼA2グループVIをコードする遺伝子。細胞膜のリン脂質代謝に関与します。変異により引き起こされるPLAN（PLA2G6-Associated Neurodegeneration）には、乳幼児期発症型、小児期発症型、成人発症型があり、パーキンソニズムやジストニアが主症状です。

・CP遺伝子：
セルロプラスミンをコードする遺伝子。銅運搬を担うとともに、2価鉄を3価鉄へ酸化するフェロオキシダーゼ活性を持ちます。変異により無セルロプラスミン血症を引き起こし、日本で比較的頻度が高いタイプです。成人期（30～40歳代）に発症し、脳だけでなく肝臓や膵臓にも鉄が蓄積し、糖尿病や貧血を合併することがあります。

・FTL遺伝子：
フェリチンライトチェインをコードする遺伝子。フェリチンは細胞内で鉄を安全に貯蔵する役割を果たします。変異により神経フェリチン症を引き起こし、NBIAの中で唯一常染色体優性遺伝形式をとります。成人期（30～50歳代）に発症し、線条体に空洞形成が特徴的です。

・WDR45遺伝子：
WDリピートドメイン45をコードする遺伝子。オートファジーに関与しています。変異によりBPAN/SENDA（β-propeller protein-Associated Neurodegeneration）を引き起こし、X連鎖性優性遺伝形式をとります。小児期に発達遅滞があり、20～30歳代にパーキンソニズムやジストニアが急速に進行します。

・ATP13A2遺伝子：
ATPase 13A2をコードする遺伝子。リソソーム機能とカチオン輸送に関与します。変異によりKufor-Rakeb症候群を引き起こし、若年性パーキンソニズムとピラミッド徴候を特徴とします。

・C19orf12遺伝子：
染色体19番上の遺伝子で、ミトコンドリアとの関連が示唆されています。変異により多様な神経症状を引き起こします。

・COASY遺伝子：
CoA合成酵素をコードする遺伝子。コエンザイムAの生合成に関与します。変異により小児期発症のジストニアと運動発達遅滞を引き起こします。

・FA2H遺伝子：
脂肪酸2-水酸化酵素をコードする遺伝子。ミエリン脂質の合成に関与します。変異により痙性対麻痺とジストニアを引き起こします。

・DCAF17遺伝子：
DCAFタンパク質ファミリーに属する遺伝子。ユビキチン化に関与します。変異により小児期発症の神経変性を引き起こします。

・GTPBP2遺伝子：
GTP結合タンパク質2をコードする遺伝子。ミトコンドリアのリボソーム機能に関与します。変異により神経発達遅滞と運動障害を引き起こします。

・SCP2遺伝子：
ステロール運搬タンパク質2をコードする遺伝子。脂質代謝に関与します。変異により神経変性と視覚障害を引き起こします。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※この検査パネルでは、主要な12遺伝子を対象としています。これらの遺伝子で病原性変異が検出されない場合でも、他の稀な原因遺伝子の可能性や、検査では検出できないタイプの変異が存在する可能性があります。