ミトコンドリアDNA枯渇症候群遺伝子検査（NGSパネル）｜ミネルバクリニック

AGK, DGUOK, FBXL4, MGME1, MPV17, OPA1, POLG, POLG2, RRM2B, SLC25A4, SUCLA2, SUCLG1, TFAM, TK2, TWNK, TYMP ( 16遺伝子 )

各遺伝子の詳細：
・AGK遺伝子：
アシルグリセロールキナーゼをコードする遺伝子。脳筋型の原因となり、発達遅延、筋力低下、白質脳症などを呈します。

・DGUOK遺伝子：
デオキシグアノシンキナーゼをコードする遺伝子。ヌクレオチド救済経路に関与し、肝脳型の主要な原因遺伝子の一つです。新生児期から乳児期に肝不全で発症することが多いです。

・FBXL4遺伝子：
F-boxタンパク質をコードする遺伝子。ミトコンドリアの品質管理に関与し、脳筋型を引き起こします。早期乳酸アシドーシス、発達遅延、てんかんなどが特徴的です。

・MGME1遺伝子：
ミトコンドリアゲノム維持エキソヌクレアーゼ1をコードする遺伝子。mtDNAの複製と修復に関与します。

・MPV17遺伝子：
ミトコンドリア内膜タンパク質をコードする遺伝子。肝脳型の原因となり、乳児期の肝不全、神経症状を呈します。

・OPA1遺伝子：
ミトコンドリアのダイナミクス（融合）に関与するタンパク質をコードする遺伝子。通常は常染色体優性遺伝性視神経萎縮症の原因ですが、劣性遺伝形式でmtDNA枯渇症候群を引き起こすこともあります。

・POLG遺伝子：
ミトコンドリアDNAポリメラーゼγの触媒サブユニットをコードする遺伝子。肝脳型の主要な原因遺伝子で、Alpers症候群（難治性てんかん、発達退行、肝不全）を引き起こします。非常に多様な臨床症状を示し、新生児期から高齢まであらゆる年齢で発症する可能性があります。

・POLG2遺伝子：
ミトコンドリアDNAポリメラーゼγの副サブユニットをコードする遺伝子。POLGと協働してmtDNAの複製を行います。

・RRM2B遺伝子：
リボヌクレオチド還元酵素の調節サブユニットp53R2をコードする遺伝子。ヌクレオチド合成に関与し、筋型および脳筋型の原因となります。

・SLC25A4遺伝子：
ADP/ATPトランスロカーゼ1（ANT1）をコードする遺伝子。ミトコンドリア内外でのADPとATPの交換を担います。筋型や脳筋型を引き起こします。

・SUCLA2遺伝子：
サクシニルCoAリガーゼのβサブユニットをコードする遺伝子。脳筋型の主要な原因遺伝子の一つで、発達遅延、筋緊張低下、ジストニア、難聴などが特徴的です。一部の患者では成人期まで生存する例も報告されています。

・SUCLG1遺伝子：
サクシニルCoAリガーゼのαサブユニットをコードする遺伝子。SUCLA2と協働して機能し、脳筋型を引き起こします。

・TFAM遺伝子：
ミトコンドリア転写因子Aをコードする遺伝子。mtDNAの転写と複製、mtDNAの維持に重要な役割を果たします。

・TK2遺伝子：
チミジンキナーゼ2をコードする遺伝子。ヌクレオチド救済経路に関与し、最も頻度の高い筋型の原因遺伝子です。乳児期から小児期に発症する進行性筋力低下が特徴で、急速進行型と緩徐進行型があります。

・TWNK遺伝子（旧C10orf2）：
Twinkleヘリカーゼをコードする遺伝子。mtDNAの複製に必須のヘリカーゼで、肝脳型の原因となります。

・TYMP遺伝子：
チミジンホスホリラーゼをコードする遺伝子。MNGIE症候群（ミトコンドリア神経消化管脳症）の原因となり、消化管運動障害、末梢神経障害、眼瞼下垂、難聴などが特徴的です。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※この検査パネルでは、16の原因遺伝子のみを対象としています。これらの遺伝子以外にもミトコンドリアDNA枯渇症候群の原因となる遺伝子が存在する可能性があります。検査で病原性変異が検出されなくても、疾患を完全に否定することはできません。また、mtDNA自体の変異によるミトコンドリア病は本検査では検出できません。