片頭痛遺伝子パネル検査（NGS検査）｜ミネルバクリニック

ALDH7A1, ARX, ATP1A2, CACNA1A, CDKL5, FOLR1, FOXG1, GAMT, KCNQ2, MECP2, NOTCH3, PCDH19, PHGDH, PNPO, POLG, PPT1, SCN1A, SLC2A1, STXBP1 ( 19遺伝子 )

各遺伝子の詳細：
・ALDH7A1遺伝子：
アルデヒド脱水素酵素ファミリー7メンバーA1をコードする遺伝子。ビタミンB6依存性てんかんの原因遺伝子で、片頭痛様症状を伴うことがあります。

・ARX遺伝子：
Aristaless関連ホメオボックスをコードする遺伝子。X連鎖性知的障害、てんかん、脳形成異常の原因遺伝子で、片頭痛様症状を合併することがあります。

・ATP1A2遺伝子：
ナトリウム/カリウムATPアーゼのα2サブユニットをコードする遺伝子。家族性片麻痺性片頭痛2型（FHM2）の原因遺伝子で、常染色体優性遺伝形式をとります。片頭痛の約20～30％を占める重要な遺伝子です。交代性片麻痺、てんかん、発達遅滞などとも関連します。

・CACNA1A遺伝子：
P/Q型電位依存性カルシウムチャネルのα1Aサブユニットをコードする遺伝子。家族性片麻痺性片頭痛1型（FHM1）の原因遺伝子で、最も頻度が高く（約40～50％）、常染色体優性遺伝形式をとります。脊髄小脳失調症6型（SCA6）や反復発作性運動失調症2型（EA2）の原因遺伝子でもあります。

・CDKL5遺伝子：
サイクリン依存性キナーゼ様5をコードする遺伝子。X連鎖性てんかん性脳症の原因遺伝子で、片頭痛様症状を伴うことがあります。

・FOLR1遺伝子：
葉酸受容体1をコードする遺伝子。脳葉酸欠乏症の原因遺伝子で、神経症状に片頭痛様頭痛を伴うことがあります。

・FOXG1遺伝子：
フォークヘッドボックスG1をコードする遺伝子。重度の神経発達障害の原因遺伝子で、てんかんや片頭痛様症状を合併することがあります。

・GAMT遺伝子：
グアニジノ酢酸メチルトランスフェラーゼをコードする遺伝子。クレアチン欠乏症候群の原因遺伝子で、てんかんや片頭痛様症状を伴うことがあります。

・KCNQ2遺伝子：
電位依存性カリウムチャネルをコードする遺伝子。良性家族性新生児てんかんの原因遺伝子で、片頭痛様症状を合併することがあります。

・MECP2遺伝子：
メチルCpG結合タンパク質2をコードする遺伝子。レット症候群の原因遺伝子で、X連鎖優性遺伝形式をとります。片頭痛様症状を伴うことがあります。

・NOTCH3遺伝子：
NOTCH3受容体をコードする遺伝子。CADASIL（皮質下梗塞と白質脳症を伴う常染色体優性脳動脈症）の原因遺伝子で、常染色体優性遺伝形式をとります。片頭痛様頭痛を高頻度に合併します。

・PCDH19遺伝子：
プロトカドヘリン19をコードする遺伝子。女性限定てんかんの原因遺伝子で、X連鎖性遺伝形式をとります。片頭痛様症状を伴うことがあります。

・PHGDH遺伝子：
ホスホグリセリン酸脱水素酵素をコードする遺伝子。セリン生合成経路異常症の原因遺伝子で、てんかんや片頭痛様症状を伴うことがあります。

・PNPO遺伝子：
ピリドキサミン5′-リン酸オキシダーゼをコードする遺伝子。ビタミンB6依存性てんかんの原因遺伝子で、片頭痛様症状を伴うことがあります。

・POLG遺伝子：
DNAポリメラーゼγをコードする遺伝子。ミトコンドリア疾患の原因遺伝子で、てんかん、運動失調、片頭痛様症状を伴うことがあります。

・PPT1遺伝子：
パルミトイルタンパク質チオエステラーゼ1をコードする遺伝子。神経セロイドリポフスチン症の原因遺伝子で、片頭痛様症状を伴うことがあります。

・SCN1A遺伝子：
電位依存性ナトリウムチャネルのα1サブユニットをコードする遺伝子。家族性片麻痺性片頭痛3型（FHM3）の原因遺伝子で、常染色体優性遺伝形式をとります。比較的稀で数％程度とされています。ドラベ症候群などのてんかんの原因遺伝子としても知られています。

・SLC2A1遺伝子：
グルコーストランスポーター1をコードする遺伝子。グルコーストランスポーター1欠損症の原因遺伝子で、てんかん、運動失調、片頭痛様症状を伴います。

・STXBP1遺伝子：
シンタキシン結合タンパク質1をコードする遺伝子。早期乳児てんかん性脳症の原因遺伝子で、片頭痛様症状を伴うことがあります。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※この検査パネルでは、19の遺伝子のみを対象としています。一般的な片頭痛の多くは多因子遺伝疾患であり、単一の遺伝子変異では説明できないことが多いです。検査で病原性変異が検出されなくても、片頭痛を完全に否定することはできません。また、家族性片麻痺性片頭痛においても、約30～40％の症例では既知の遺伝子に変異が見つかりません。

※MECP2遺伝子について：現在利用可能な技術（NGSおよびqPCR）は、MECP2遺伝子のエキソン1の単一エキソン欠失/重複の検出には適していません。