小頭症NGS遺伝子パネル検査｜ミネルバクリニック

AKT3, ANKLE2, ARFGEF2, ASPM, ATR, ATRIP, BUB1B, CASK, CDK5RAP2, CDK6, CENPE, CENPF, CENPJ, CEP135, CEP152, CEP63, CKAP2L, COX7B, CREBBP, CRIPT, DIAPH1, DNM1L, EFTUD2, HMGB3, IER3IP1, KATNB1, KIF11, KNL1, LIG4, MCPH1, MED17, MFSD2A, MRE11, MSMO1, MYCN, NBN, NDE1, NHEJ1, NIN, NR2E1, PAFAH1B1, PCLO, PCNT, PHC1, PLEKHG2, PLK4, PNKP, POMT1, PPP1R15B, PQBP1, QARS, RARS2, RBBP8, RTTN, SASS6, SLC1A4, SLC25A19, SLC9A6, SPATA5, STAMBP, STIL, THOC6, TRMT10A, TSEN2, TSEN34, TSEN54, TUBB2B, TUBGCP4, TUBGCP6, VRK1, WDR62, WDR73, XRCC4, ZEB2, ZNF335 ( 75遺伝子 )

これらの遺伝子は、脳の発生過程、特に神経幹細胞の分裂、中心体機能、DNA損傷修復、細胞周期制御など、様々な細胞プロセスに関与しています。

主要な原因遺伝子の詳細：

・MCPH1遺伝子：
常染色体劣性原発性小頭症1型（MCPH1）の原因遺伝子。DNA損傷応答と細胞周期チェックポイント制御に関与します。

・CDK5RAP2遺伝子：
常染色体劣性原発性小頭症3型（MCPH3）の原因遺伝子。中心体の機能と神経幹細胞の分裂に重要な役割を果たします。

・ASPM遺伝子：
常染色体劣性原発性小頭症5型（MCPH5）の原因遺伝子で、最も頻度の高い原因遺伝子の一つです。紡錘体の極での局在と有糸分裂時の中心体機能に関与します。

・CENPJ遺伝子：
常染色体劣性原発性小頭症6型（MCPH6）およびセッケル症候群4型の原因遺伝子。中心体の複製に必須のタンパク質をコードします。

・STIL遺伝子：
常染色体劣性原発性小頭症7型（MCPH7）の原因遺伝子。中心体の複製と神経前駆細胞の増殖に関与します。

・WDR62遺伝子：
常染色体劣性原発性小頭症2型（MCPH2）の原因遺伝子。紡錘体極での局在と有糸分裂の進行に重要です。

・CEP152遺伝子：
常染色体劣性原発性小頭症9型（MCPH9）およびセッケル症候群5型の原因遺伝子。中心体の複製開始に関与します。

・CEP135遺伝子：
常染色体劣性原発性小頭症8型（MCPH8）の原因遺伝子。中心小体の構造維持に重要です。

・ATR遺伝子：
セッケル症候群1型の原因遺伝子。DNA損傷修復とチェックポイント制御に関与するキナーゼをコードします。

・RBBP8遺伝子：
セッケル症候群2型の原因遺伝子。DNA二本鎖切断の修復に関与します。

・PCNT遺伝子：
セッケル症候群の原因遺伝子の一つで、原発性小頭症も引き起こします。中心体のペリセントリオール・マトリックスの主要構成要素です。

・MRE11遺伝子：
セッケル症候群に関連する遺伝子。DNA二本鎖切断の修復に関与し、染色体の安定性維持に重要です。

・CEP63遺伝子：
セッケル症候群6型の原因遺伝子。中心体の複製サイクルに関与します。

・NIN遺伝子：
セッケル症候群7型の原因遺伝子。中心体の成熟と微小管の組織化に関与します。

・CREBBP遺伝子：
Rubinstein-Taybi症候群の原因遺伝子で、小頭症を伴います。ヒストンアセチル化に関与する転写コアクチベーターをコードします。

・ZEB2遺伝子：
Mowat-Wilson症候群の原因遺伝子で、小頭症を伴います。神経系の発生に重要な転写因子をコードします。

・PAFAH1B1遺伝子：
滑脳症（lissencephaly）と小頭症を引き起こします。神経細胞の移動に重要な役割を果たします。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※この検査パネルでは、75の遺伝的原因のみを対象としています。小頭症の多くの症例では、感染症や環境要因など非遺伝的原因によるものもあります。また、現在知られている遺伝子以外の未同定の遺伝子が原因である可能性もあります。検査で病原性変異が検出されなくても、小頭症を完全に否定することはできません。