黄斑変性症NGS遺伝子検査パネル｜ミネルバクリニック

ABCA4, C3, CFB, CFH, CFI, CNGB3, CST3, CX3CR1, EFEMP1, ELOVL4, ERCC6, FBLN5, HMCN1, HTRA1, PRPH2, RAX2, RLBP1, RPGR, TLR4 ( 19遺伝子 )

各遺伝子の詳細：
・ABCA4遺伝子：
ATP結合カセットトランスポーターA4をコードする遺伝子。スタルガルト病（若年性黄斑変性症）の最も頻度の高い原因遺伝子で、常染色体劣性遺伝形式をとります。網膜の視細胞における視物質の代謝に重要な役割を果たしています。

・C3遺伝子：
補体成分C3をコードする遺伝子。免疫系の補体経路の中心的な役割を担い、加齢黄斑変性の発症リスクに関与します。慢性炎症との関連が示唆されています。

・CFB遺伝子：
補体因子Bをコードする遺伝子。補体系の副経路の活性化に関与し、加齢黄斑変性の感受性遺伝子の一つです。

・CFH遺伝子：
補体因子Hをコードする遺伝子。加齢黄斑変性の最も重要なリスク因子の一つで、補体系の制御に関与します。特定の多型は発症リスクを数倍高めることが知られています。

・CFI遺伝子：
補体因子Iをコードする遺伝子。補体系の制御因子で、加齢黄斑変性の感受性遺伝子として報告されています。

・CNGB3遺伝子：
環状ヌクレオチド依存性イオンチャネルβ3サブユニットをコードする遺伝子。錐体機能障害に関与し、一部の黄斑変性症の原因となります。

・CST3遺伝子：
シスタチンCをコードする遺伝子。タンパク質分解酵素の阻害因子で、加齢黄斑変性との関連が報告されています。

・CX3CR1遺伝子：
CX3Cケモカイン受容体1をコードする遺伝子。炎症反応や免疫細胞の移動に関与し、加齢黄斑変性の感受性遺伝子の一つです。

・EFEMP1遺伝子：
EGF含有フィブリリン様細胞外マトリックスタンパク質1をコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式で、マリネスコ・シェーグレン症候群や優性遺伝性ドルーゼンの原因遺伝子として知られています。

・ELOVL4遺伝子：
極長鎖脂肪酸伸長酵素4をコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式で、スタルガルト病3型などの原因となります。脂肪酸代謝に関与します。

・ERCC6遺伝子：
DNA修復タンパク質をコードする遺伝子。コケイン症候群の原因遺伝子ですが、一部の網膜変性疾患とも関連します。

・FBLN5遺伝子：
フィブリン5をコードする遺伝子。細胞外マトリックスの構成成分で、常染色体優性遺伝形式で加齢黄斑変性との関連が報告されています。

・HMCN1遺伝子：
ヘミセンチン1をコードする遺伝子。細胞外マトリックスタンパク質で、加齢黄斑変性の感受性遺伝子として同定されています。

・HTRA1遺伝子：
高温要求性Aセリンペプチダーゼ1をコードする遺伝子。日本人を含むアジア人で特に重要な加齢黄斑変性のリスク因子です。細胞外マトリックスタンパク質の分解に関与します。

・PRPH2遺伝子（別名RDS）：
ペリフェリン2をコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式で、様々な網膜ジストロフィーの原因遺伝子で、黄斑変性症の表現型を示すこともあります。視細胞の光受容体外節の構造維持に重要です。

・RAX2遺伝子：
網膜および前脳ホメオボックスタンパク質2をコードする遺伝子。網膜の発生と維持に関与します。

・RLBP1遺伝子：
レチナールデヒド結合タンパク質1をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、網膜色素上皮ジストロフィーの原因となります。視物質の再生過程に重要な役割を果たします。

・RPGR遺伝子：
網膜色素変性症GTPアーゼ制御因子をコードする遺伝子。X連鎖遺伝形式で、X連鎖性網膜色素変性症の主要な原因遺伝子ですが、黄斑障害を伴うこともあります。ORF15領域の変異が多く報告されています。

・TLR4遺伝子：
Toll様受容体4をコードする遺伝子。自然免疫系の重要な受容体で、炎症反応に関与し、加齢黄斑変性の感受性遺伝子の一つです。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※この検査パネルでは、19の原因遺伝子および感受性遺伝子のみを対象としています。加齢黄斑変性は多因子遺伝性疾患であり、遺伝的要因以外にも喫煙、紫外線曝露、食生活などの環境要因が発症に大きく影響します。検査で病原性変異が検出されなくても、疾患を完全に否定することはできません。