大頭症・過成長症候群 NGS遺伝子検査パネル｜ミネルバクリニック

AKT1, AKT3, ASPA, ASXL2, BRWD3, CCND2, CDKN1C, CHD8, CUL4B, DHCR24, DIS3L2, DNMT3A, EED, EIF2B5, EZH2, GFAP, GLI3, GPC3, GPSM2, GRIA3, H19, HEPACAM, HERC1, HUWE1, KIF7, KRAS, L1CAM, MED12, MLC1, MPDZ, MTOR, NFIX, NSD1, OFD1, PIGA, PIK3CA, PIK3R2, PTCH1, PTEN, RAB39B, RNF125, RNF135, SYN1, TBC1D7, TSC1, TSC2, UPF3B ( 47遺伝子 )

主要遺伝子の詳細：

・NSD1遺伝子：
ソトス症候群の原因遺伝子。ヒストンメチル化に関与するタンパク質をコードします。日本人では染色体微細欠失型が約50%を占め、遺伝子内変異型が約10%です。大頭症、過成長、骨年齢促進、発達の遅れ、特徴的顔貌を特徴とします。

・PTCH1遺伝子：
ゴーリン症候群（基底細胞母斑症候群）の原因遺伝子。がん抑制遺伝子で、Sonic Hedgehogシグナル伝達経路に関与します。基底細胞癌の多発、顎骨嚢胞、手掌・足底皮膚小陥凹、大脳鎌石灰化、骨格異常を特徴とします。

・PTEN遺伝子：
PTEN過誤腫症候群（カウデン症候群、Bannayan-Riley-Ruvalcaba症候群など）の原因遺伝子。がん抑制遺伝子で、PI3K/AKT/mTORシグナル伝達経路を負に制御します。多発過誤腫、大頭症、乳癌・甲状腺癌・子宮内膜癌・腎癌などの悪性腫瘍リスク増加を特徴とします。

・EZH2遺伝子：
ウィーバー症候群の原因遺伝子。ヒストンメチルトランスフェラーゼをコードし、PRC2複合体の触媒成分です。出生前からの過成長、特徴的顔貌、骨年齢促進、軽度～中等度の発達の遅れを特徴とします。

・GPC3遺伝子：
シンプソン・ゴラビ・ベーメル症候群1型の原因遺伝子。グリピカン3（ヘパラン硫酸プロテオグリカン）をコードし、細胞増殖と分裂の制御に関与します。X連鎖遺伝形式で、出生前からの過成長、特異顔貌、多発奇形、Wilms腫瘍・肝芽腫のリスク増加を特徴とします。

・PIK3CA遺伝子：
PIK3CA関連分節性過成長症候群の原因遺伝子。ホスファチジルイノシトール3-キナーゼの触媒サブユニットαをコードします。病的変異の大半が体細胞モザイクで生じるため、検出には複数組織の検査が必要な場合があります。局所的過成長、脂肪組織の異常、血管奇形などを特徴とします。

・NFIX遺伝子：
ソトス様症候群（ソトス症候群2型）の原因遺伝子。核因子I/Xをコードし、転写調節に関与します。NSD1変異陰性のソトス症候群様症状を呈する患者で同定されています。

・TSC1、TSC2遺伝子：
結節性硬化症の原因遺伝子。mTORシグナル伝達経路の負の制御因子をコードします。大頭症、てんかん、知的障害、皮膚病変、多臓器の過誤腫、腎血管筋脂肪腫などを特徴とします。

・MTOR遺伝子：
mTOR関連大頭症症候群の原因遺伝子。機能獲得型変異により、大頭症、発達遅滞、てんかんなどを引き起こします。

・AKT1、AKT3遺伝子：
Proteus症候群、Proteus様症候群、大頭症症候群の原因遺伝子。PI3K/AKT/mTORシグナル伝達経路の構成要素をコードします。

・CHD8遺伝子：
自閉症スペクトラム障害と大頭症の原因遺伝子。クロマチンリモデリング因子をコードし、遺伝子発現の調節に関与します。

その他の遺伝子：
ASPA、ASXL2、BRWD3、CCND2、CDKN1C、CUL4B、DHCR24、DIS3L2、DNMT3A、EED、EIF2B5、GFAP、GLI3、GPSM2、GRIA3、H19、HEPACAM、HERC1、HUWE1、KIF7、KRAS、L1CAM、MED12、MLC1、MPDZ、OFD1、PIGA、PIK3R2、RAB39B、RNF125、RNF135、SYN1、TBC1D7、UPF3Bなど、大頭症・過成長症候群に関連する多様な遺伝子が含まれています。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※PIK3CA病的変異の大半は体細胞モザイクで生じるため、検出には複数組織の検査が必要な場合があります。この検査でPIK3CA病的変異が検出されなくても、特徴的な臨床所見を有する患者では、PIK3CA関連分節性過成長症候群の臨床診断を除外できません。