滑脳症NGS遺伝子パネル検査｜ミネルバクリニック

ACTB, ACTG1, ARX, DCX, FKRP, FKTN, LARGE1, MACF1, PAFAH1B1, POMGNT1, POMT1, POMT2, RELN, TUBA1A, VLDLR ( 15遺伝子 )

各遺伝子の詳細：
・ACTB遺伝子：
β-アクチンをコードする遺伝子。細胞骨格の主要構成要素で、神経細胞の移動に重要な役割を果たします。変異により滑脳症や小頭症を引き起こします。

・ACTG1遺伝子：
γ-アクチンをコードする遺伝子。ACTBと同様に細胞骨格の構成要素で、神経細胞の形態維持と移動に関与します。変異により滑脳症、小頭症、難聴などを呈します。

・ARX遺伝子：
アリスタレス関連ホメオボックスタンパク質をコードする遺伝子。X染色体に位置し、転写因子として前脳の発達に重要な役割を果たします。変異により外性器異常を伴うX連鎖性滑脳症（XLAG）を引き起こします。後頭部優位の脳回形成異常が特徴的です。

・DCX遺伝子：
ダブルコルチンタンパク質をコードする遺伝子。X染色体に位置し、神経細胞の微小管に結合して神経細胞の移動に必須の役割を果たします。滑脳症の約23％を占める頻度の高い原因遺伝子です。男性では重症の滑脳症、女性では軽症の皮質下帯状異所性灰白質を呈します。前頭部優位の脳回形成異常が特徴的で、6層構造の皮質を示します。

・FKRP遺伝子：
フクチン関連タンパク質をコードする遺伝子。タンパク質のグリコシル化に関与し、変異により先天性筋ジストロフィーと敷石様皮質異形成を引き起こします。

・FKTN遺伝子：
フクチンをコードする遺伝子。福山型先天性筋ジストロフィーの原因遺伝子で、筋ジストロフィーに加えて敷石様皮質異形成を伴います。国内で特に重要な原因遺伝子です。

・LARGE1遺伝子：
グリコシルトランスフェラーゼ様タンパク質をコードする遺伝子。α-ジストログリカンのグリコシル化に関与し、変異により先天性筋ジストロフィーと脳形成異常を引き起こします。

・MACF1遺伝子：
微小管アクチン架橋因子1をコードする遺伝子。細胞骨格の微小管とアクチンフィラメントを架橋し、神経細胞の移動と形態維持に関与します。

・PAFAH1B1（LIS1）遺伝子：
血小板活性化因子アセチルヒドロラーゼ1b調節サブユニット1をコードする遺伝子。17番染色体（17p13.3）に位置し、滑脳症の最も頻度の高い原因遺伝子（約40％）です。運動タンパク質ダイニンを調節することで、神経細胞核の微小管に沿った移動に関与します。変異または欠失により孤発性滑脳症を、YWHAE遺伝子を含むより大きな欠失によりミラー・ディカー症候群を引き起こします。後頭部優位の脳回形成異常が特徴的で、4層構造の皮質を示します。

・POMGNT1遺伝子：
プロテインO-マンノース β-1,2-N-アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼ1をコードする遺伝子。タンパク質のグリコシル化に関与し、変異により筋・眼・脳疾患（muscle-eye-brain disease）を引き起こします。

・POMT1遺伝子：
プロテインO-マンノシルトランスフェラーゼ1をコードする遺伝子。タンパク質のO-マンノシル化に関与し、変異によりWalker-Warburg症候群などの重症先天性筋ジストロフィーと脳形成異常を引き起こします。

・POMT2遺伝子：
プロテインO-マンノシルトランスフェラーゼ2をコードする遺伝子。POMT1と同様にタンパク質のO-マンノシル化に関与し、変異によりWalker-Warburg症候群などを引き起こします。

・RELN遺伝子：
リーリンタンパク質をコードする遺伝子。7番染色体（7q22.1）に位置し、神経細胞の移動と配置に重要な役割を果たします。常染色体劣性遺伝形式で、小脳低形成を伴う滑脳症（lissencephaly with cerebellar hypoplasia: LCH）を引き起こします。

・TUBA1A遺伝子：
チューブリンアルファ1aをコードする遺伝子。12番染色体（12q13.2）に位置し、微小管の主要構成要素として神経細胞の移動に重要です。滑脳症の約5％を占めます。小脳低形成、脳梁欠損、脳幹形成不全などを合併することがあります。

・VLDLR遺伝子：
超低比重リポタンパク質受容体をコードする遺伝子。リーリンシグナル伝達経路に関与し、神経細胞の移動と配置に重要です。変異により小脳低形成を伴う滑脳症を引き起こします。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※この検査パネルでは、15の原因遺伝子のみを対象としています。これらの遺伝子で変異が検出されない症例も存在します。また、先天性サイトメガロウイルス感染症や環境要因による滑脳症は、この遺伝子検査では検出できません。検査で病原性変異が検出されなくても、疾患を完全に否定することはできません。