リポジストロフィー（脂肪萎縮症）NGS遺伝子検査パネル｜ミネルバクリニック

AGPAT2, AKT2, BSCL2, CAV1, CAVIN1, CIDEC, LMNA, PPARG, TBC1D4, ZMPSTE24 ( 10遺伝子 )

各遺伝子の詳細：
・AGPAT2遺伝子：
1-アシルグリセロール-3-リン酸O-アシルトランスフェラーゼ2をコードする遺伝子。脂質合成経路において重要な役割を果たします。常染色体劣性遺伝形式で、先天性全身性脂肪萎縮症（Berardinelli-Seip症候群1型）の原因となります。

・AKT2遺伝子：
プロテインキナーゼBβをコードする遺伝子。インスリンシグナル伝達とグルコース代謝において中心的な役割を果たします。常染色体優性遺伝形式で、家族性部分性脂肪萎縮症と重症インスリン抵抗性を引き起こします。

・BSCL2遺伝子：
セイピン（seipin）をコードする遺伝子。脂肪細胞の分化と脂質滴の形成に重要な役割を果たします。常染色体劣性遺伝形式で先天性全身性脂肪萎縮症（Berardinelli-Seip症候群2型）の原因となります。常染色体優性遺伝形式では上肢優位の筋力低下を伴う運動ニューロパチーを引き起こすこともあります。

・CAV1遺伝子：
カベオリン-1をコードする遺伝子。細胞膜のカベオラ（小窩）の主要構成要素で、脂肪細胞の分化とシグナル伝達に関与します。常染色体優性または劣性遺伝形式で、先天性全身性脂肪萎縮症3型の原因となります。

・CAVIN1（PTRF）遺伝子：
カベオラ関連タンパク質1（ポリメラーゼIおよび転写放出因子）をコードする遺伝子。カベオラの形成に必須で、脂質代謝に重要な役割を果たします。常染色体劣性遺伝形式で、先天性全身性脂肪萎縮症4型と筋ジストロフィーを引き起こします。

・CIDEC遺伝子：
細胞死誘導DFFα様エフェクターC（FSP27とも呼ばれる）をコードする遺伝子。脂質滴の融合と脂肪蓄積に重要な役割を果たします。常染色体劣性遺伝形式で、家族性部分性脂肪萎縮症5型の原因となります。

・LMNA遺伝子：
ラミンA/Cをコードする遺伝子。核膜の構造維持に関与します。常染色体優性遺伝形式で、家族性部分性脂肪萎縮症2型（Dunnigan型）の最も頻度の高い原因遺伝子です。思春期以降に四肢と体幹の皮下脂肪が進行性に減少する一方、顔面や頸部の脂肪は保たれるか増加します。

・PPARG遺伝子：
ペルオキシソーム増殖因子活性化受容体γをコードする遺伝子。脂肪細胞の分化において中心的な役割を果たす転写因子です。常染色体優性遺伝形式で、家族性部分性脂肪萎縮症3型の原因となります。重度のインスリン抵抗性と糖尿病を伴います。

・TBC1D4遺伝子：
TBC1ドメインファミリーメンバー4（AS160とも呼ばれる）をコードする遺伝子。インスリン刺激によるグルコース取り込みの調節に関与します。常染色体劣性遺伝形式で、家族性部分性脂肪萎縮症の原因となり、インスリン抵抗性と糖尿病を引き起こします。

・ZMPSTE24遺伝子：
亜鉛メタロプロテアーゼをコードする遺伝子。ラミンAの成熟過程において、プレラミンAを切断する役割を果たします。常染色体劣性遺伝形式で早老症候群を引き起こしますが、部分性脂肪萎縮症の表現型も呈することがあります。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※この検査パネルでは、10の原因遺伝子のみを対象としています。他の未同定の遺伝子変異や、検査対象外の遺伝子変異によるリポジストロフィーの可能性もあります。また、後天性リポジストロフィー（自己免疫異常、ウイルス感染、薬剤性など）は遺伝子検査では診断できません。検査で病原性変異が検出されなくても、疾患を完全に否定することはできません。