肢帯型筋ジストロフィー NGS遺伝子パネル検査｜ミネルバクリニック

ANO5, CAPN3, CAV3, DES, DNAJB6, DYSF, FKRP, FLNC, GAA, HNRNPDL, ISPD, LMNA, MYOT, PNPLA2, SGCA, SGCB, SGCD, SGCG, TCAP, TRIM32, TTN ( 21遺伝子 )

各遺伝子の詳細：
・ANO5遺伝子（LGMD2L/LGMDR12、アノクタミノパチー）：
アノクタミン5をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、筋膜修復に関与します。成人発症が多く、大腿後面筋や下腿筋の障害が特徴的です。

・CAPN3遺伝子（LGMD2A/LGMDR1、カルパイノパチー）：
カルパイン3をコードする遺伝子。最も頻度の高い原因遺伝子の一つで、常染色体劣性遺伝形式をとります。思春期以降に下肢の筋力低下で発症し、高CK血症を伴います。心筋障害は比較的少ないですが、進行すると呼吸障害をきたすことがあります。

・CAV3遺伝子（LGMD1C、カベオリノパチー）：
カベオリン3をコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式で、筋線維の被刺激性が亢進し、軽い刺激で筋線維が収縮する現象（rippling muscle disease）が特徴的です。

・DES遺伝子：
デスミンをコードする遺伝子。筋原線維の構造タンパク質で、心筋障害を伴うことがあります。

・DNAJB6遺伝子（LGMD1D/LGMDD1）：
シャペロンタンパク質をコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式で、タンパク質の品質管理に関与します。

・DYSF遺伝子（LGMD2B/LGMDR2、ジスフェリノパチー）：
ジスフェリンをコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、筋膜修復に関与します。成人発症が多く、下腿の腓腹筋やヒラメ筋の萎縮が特徴的です。大腿では後面筋が前面筋より強く障害されます。

・FKRP遺伝子（LGMD2I/LGMDR9）：
フクチン関連タンパク質をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、糖鎖修飾に関与します。心筋障害や呼吸障害を伴うことがあります。

・FLNC遺伝子：
フィラミンCをコードする遺伝子。筋原線維の構造維持に関与し、心筋障害を伴うことがあります。

・GAA遺伝子：
酸性α-グルコシダーゼをコードする遺伝子。ポンペ病（糖原病II型）の原因遺伝子としても知られていますが、遅発型では肢帯型筋力低下を呈することがあります。

・HNRNPDL遺伝子：
RNA結合タンパク質をコードする遺伝子。RNA代謝に関与します。

・ISPD遺伝子：
イソプレノイド合成酵素をコードする遺伝子。糖鎖修飾に関与し、中枢神経症状を伴うことがあります。

・LMNA遺伝子（LGMD1B、ラミノパチー）：
ラミンA/Cをコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式で、核膜の構造維持に関与します。心筋障害（拡張型心筋症、伝導障害）を高頻度に伴い、心臓管理が非常に重要です。

・MYOT遺伝子（LGMD1A）：
ミオティリンをコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式で、Z帯の構造維持に関与します。遠位筋または近位筋の筋力低下で発症し、緩徐に進行します。

・PNPLA2遺伝子：
アディポトリグリセリドリパーゼをコードする遺伝子。脂質代謝に関与し、neutral lipid storage disease with myopathyの原因遺伝子です。

・SGCA, SGCB, SGCD, SGCG遺伝子（LGMD2C～2F/LGMDR3～6、サルコグリカノパチー）：
α-, β-, δ-, γ-サルコグリカンをコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、ジストロフィン・糖タンパク質複合体の構成成分です。デュシェンヌ型に似た重症型からベッカー型に近い成人発症型まで様々な症状を示します。拡張型心筋症、呼吸障害をきたしやすく、血清CK値は著明に上昇します（正常値の10倍以上）。

・TCAP遺伝子（LGMD2G/LGMDR7）：
テレトニンをコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、Z帯に存在しtitin をZ帯に固定する役割があります。翼状肩甲と下腿の筋肥大を伴いやすく、下垂足を呈することもあります。

・TRIM32遺伝子：
TRIFパートナータンパク質をコードする遺伝子。ユビキチン化に関与します。

・TTN遺伝子：
タイチンをコードする遺伝子。筋肉の伸縮性に重要な巨大タンパク質で、様々な筋疾患の原因となります。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※この検査パネルでは、21の原因遺伝子のみを対象としています。約60％の肢帯型筋ジストロフィー症例では、既知の遺伝子に変異が見つかりません。検査で病原性変異が検出されなくても、疾患を完全に否定することはできません。