白質脳症NGS遺伝子検査｜ミネルバクリニック

ABAT, ABCD1, ACOX1, ADAR, ADK, AIMP1, ALDH3A2, ARSA, ASPA, AUH, B3GALNT2, CLCN2, CLN6, COL4A1, COX15, CSF1R, CYP27A1, DARS2, EARS2, EIF2B1, EIF2B2, EIF2B3, EIF2B4, EIF2B5, FA2H, FAM126A, FKRP, FOLR1, FOXRED1, GALC, GFAP, GJC2, HEPACAM, HSPD1, HTRA1, KCNT1, L2HGDH, LMNB1, MARS2, MLC1, MLYCD, MTTP, NDUFAF5, NOTCH3, PAH, PC, PLP1, POLR3A, POLR3B, PRPS1, PSAP, PTEN, RNASEH2A, RNASEH2B, RNASEH2C, RNASET2, SAMHD1, SCP2, SDHA, SDHB, SLC16A2, SLC25A12, SOX10, STXBP1, SUMF1, TREM2, TREX1, TUBB4A, TYROBP ( 69遺伝子 )

主要な遺伝子の詳細：

・ABCD1遺伝子：
X連鎖性副腎白質ジストロフィー（X-ALD）の原因遺伝子。脂肪酸代謝に関与し、副腎機能不全を伴うことがあります。

・ARSA遺伝子：
異染性白質ジストロフィー（MLD）の原因遺伝子。アリールスルファターゼAをコードし、スルファチドの蓄積により白質が障害されます。

・ASPA遺伝子：
カナバン病の原因遺伝子。アスパルトアシラーゼをコードし、N-アセチルアスパラギン酸の蓄積により白質海綿状変性を来します。

・EIF2B1, EIF2B2, EIF2B3, EIF2B4, EIF2B5遺伝子：
白質消失病（CACH/VWM）の原因遺伝子群。翻訳開始因子の一部をコードし、ストレスに対する反応異常により白質が進行性に消失します。

・GALC遺伝子：
クラッベ病（球状細胞型白質ジストロフィー）の原因遺伝子。ガラクトセレブロシダーゼをコードし、ガラクトセレブロシドの蓄積により白質が障害されます。

・GFAP遺伝子：
アレキサンダー病の原因遺伝子。グリア線維性酸性タンパク質をコードし、白質に特徴的なローゼンタール線維が形成されます。

・GJC2（GJA12）遺伝子：
ペリツェウス・メルツバッハー様病1型の原因遺伝子。ギャップ結合タンパク質をコードします。

・HEPACAM遺伝子：
皮質下嚢胞をもつ大頭型白質脳症（MLC）の原因遺伝子の一つ。

・LMNB1遺伝子：
成人発症の常染色体優性白質脳症の原因遺伝子。核膜タンパク質をコードします。

・MLC1遺伝子：
皮質下嚢胞をもつ大頭型白質脳症（MLC）の最も一般的な原因遺伝子。膜タンパク質をコードします。

・NOTCH3遺伝子：
CADASIL（皮質下梗塞と白質脳症を伴う常染色体優性脳動脈症）の原因遺伝子。細胞表面受容体をコードし、脳の細い血管が障害されます。

・PLP1遺伝子：
ペリツェウス・メルツバッハー病の原因遺伝子。プロテオリピドプロテインをコードし、髄鞘の主要構成成分です。

・POLR3A, POLR3B遺伝子：
4H症候群（低髄鞘形成、低歯形成、性腺機能低下症）などの原因遺伝子。RNAポリメラーゼIIIをコードします。

・RNASEH2A, RNASEH2B, RNASEH2C遺伝子：
アイカルディ・グティエール症候群の原因遺伝子群。RNase H2をコードし、自己免疫様の炎症反応により白質が障害されます。

・CSF1R遺伝子：
成人発症の遺伝性びまん性白質脳症の原因遺伝子。マクロファージコロニー刺激因子受容体をコードします。

・HTRA1遺伝子：
CADASILに類似した脳小血管病の原因遺伝子。セリンプロテアーゼをコードします。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※白質脳症は臨床的にも遺伝的にも非常に多様な疾患群であり、この検査パネルでは69の原因遺伝子のみを対象としています。検査で病原性変異が検出されなくても、疾患を完全に否定することはできません。また、新たな原因遺伝子が今後同定される可能性もあります。