低マグネシウム血症（遺伝性）NGS遺伝子パネル検査｜ミネルバクリニック

CASR, CLCNKB, CLDN16, CLDN19, CNNM1, CNNM2, CNNM4, EGF, FAM111A, FXYD2, HNF1B, KCNA1, KCNJ10, MAGT1, MMGT1, NIPA2, PCBD1, SARS2, SLC12A3, SLC41A2, SLC41A3, TRPM6, TRPM7 ( 23遺伝子 )

各遺伝子の詳細：
・CASR遺伝子：
カルシウム感知受容体をコードする遺伝子。副甲状腺と腎臓に発現し、カルシウムとマグネシウムの恒常性維持に重要な役割を果たします。常染色体優性遺伝形式で、変異により低マグネシウム血症を伴う低カルシウム尿性高カルシウム血症を発症することがあります。

・CLCNKB遺伝子：
腎臓の塩素イオンチャネルClC-Kbをコードする遺伝子。ヘンレループ太い上行脚と遠位尿細管に発現し、塩化物イオンの再吸収に関与します。常染色体劣性遺伝形式で、変異によりバーター症候群III型を発症します。低マグネシウム血症、低カリウム血症、代謝性アルカローシスを特徴とします。

・CLDN16遺伝子：
タイトジャンクション蛋白クローディン16（パラセリン1）をコードする遺伝子。ヘンレループ太い上行脚に発現し、マグネシウムとカルシウムの傍細胞経路での再吸収に必須です。常染色体劣性遺伝形式で、変異により高カルシウム尿症と腎石灰化症を伴う家族性低マグネシウム血症（FHHNC）を発症します。

・CLDN19遺伝子：
タイトジャンクション蛋白クローディン19をコードする遺伝子。CLDN16と協調してマグネシウムとカルシウムの再吸収を担います。常染色体劣性遺伝形式で、変異によりCLDN16と同様のFHHNCに加えて、眼科的異常（黄斑変性、眼振、近視）を合併します。

・CNNM1遺伝子：
サイクリンM1をコードする遺伝子。細胞膜でのマグネシウム輸送を担うサイクリンMファミリーの一員です。

・CNNM2遺伝子：
サイクリンM2をコードする遺伝子。基底膜側でのマグネシウム排出に関与し、腎臓と脳に高発現します。常染色体優性遺伝形式で、変異により低マグネシウム血症に加えて、発作性運動失調や知的障害を伴うことがあります。

・CNNM4遺伝子：
サイクリンM4をコードする遺伝子。歯のエナメル質形成にも関与し、変異により低マグネシウム血症とエナメル質形成不全症（ジャルバ症候群）を発症します。

・EGF遺伝子：
上皮成長因子（EGF）をコードする遺伝子。腎臓と腸管でのマグネシウム輸送を制御します。常染色体劣性遺伝形式で、変異により腎性マグネシウム喪失を伴う低マグネシウム血症を発症します。

・FAM111A遺伝子：
トリプシン様セリンプロテアーゼをコードする遺伝子。細胞周期の制御と複製に関与します。常染色体優性遺伝形式で、変異により腎機能障害や低マグネシウム血症を伴う骨格異常症候群を発症することがあります。

・FXYD2遺伝子：
Na-K-ATPaseのγサブユニットをコードする遺伝子。遠位尿細管に発現し、ナトリウムとマグネシウムの再吸収を調節します。常染色体優性遺伝形式で、変異により単独性優性低マグネシウム血症を発症します。

・HNF1B遺伝子：
肝細胞核因子1βをコードする転写因子遺伝子。腎臓の発生と尿細管機能に重要です。常染色体優性遺伝形式で、変異により腎嚢胞と糖尿病症候群（RCAD）を発症し、低マグネシウム血症を合併します。

・KCNA1遺伝子：
電位依存性カリウムチャネルKv1.1をコードする遺伝子。神経系と腎臓に発現します。常染色体優性遺伝形式で、変異により発作性運動失調と低マグネシウム血症を伴うことがあります。

・KCNJ10遺伝子：
内向き整流性カリウムチャネルKir4.1をコードする遺伝子。遠位尿細管と脳に発現します。常染色体劣性遺伝形式で、変異によりEAST/SeSAME症候群（てんかん、運動失調、感音性難聴、尿細管障害、低マグネシウム血症）を発症します。

・MAGT1遺伝子：
ミトコンドリアのマグネシウムトランスポーターをコードする遺伝子。X連鎖遺伝形式で、変異によりX連鎖免疫不全症を伴う低マグネシウム血症（XMEN症候群）を発症します。EBウイルス感染症や慢性下痢を合併します。

・MMGT1遺伝子：
膜マグネシウムトランスポーター1をコードする遺伝子。細胞内のマグネシウム恒常性維持に関与します。

・NIPA2遺伝子：
マグネシウムトランスポーターをコードする遺伝子。腎臓と脳に発現します。

・PCBD1遺伝子：
プテリン-4α-カルビノールアミン脱水酵素をコードする遺伝子。プテリジン代謝に関与し、変異により低マグネシウム血症と肝疾患を伴うことがあります。

・SARS2遺伝子：
ミトコンドリアのセリルtRNA合成酵素をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、変異によりミトコンドリア機能異常を伴う低マグネシウム血症を発症します。発達遅滞や筋力低下を合併することがあります。

・SLC12A3遺伝子：
遠位尿細管のチアジド感受性Na-Cl共輸送体（NCCT）をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、変異によりギテルマン症候群を発症します。低マグネシウム血症、低カリウム血症、低カルシウム尿症、代謝性アルカローシスを特徴とする最も頻度の高い遺伝性尿細管機能異常症です。

・SLC41A2遺伝子：
マグネシウムトランスポーターSLC41A2をコードする遺伝子。細胞内のマグネシウム恒常性維持に関与します。

・SLC41A3遺伝子：
マグネシウムトランスポーターSLC41A3をコードする遺伝子。腎臓と消化管に発現します。

・TRPM6遺伝子：
陽イオンチャネルTRPM6をコードする遺伝子。腸管と腎臓遠位尿細管に発現し、マグネシウムの能動的吸収に必須です。常染色体劣性遺伝形式で、変異により低カルシウム血症を伴う原発性低マグネシウム血症を発症します。乳児期から重度の低マグネシウム血症と二次性低カルシウム血症によるけいれん発作を呈します。

・TRPM7遺伝子：
陽イオンチャネルTRPM7をコードする遺伝子。TRPM6と相互作用し、細胞のマグネシウム恒常性維持に関与します。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※この検査パネルでは、23の原因遺伝子のみを対象としています。まだ同定されていない遺伝子に変異がある可能性や、非遺伝性の原因による低マグネシウム血症もあります。検査で病原性変異が検出されなくても、疾患を完全に否定することはできません。