遺伝性痙性対麻痺（HSP）遺伝子検査パネル｜ミネルバクリニック

ABCD1, ACOX1, ALDH18A1, AP5Z1, ATAD3A, ATL1, BICD2, BSCL2, CPT1C, CYP7B1, DNM2, DSTYK, ERLIN2, FA2H, HSPD1, KIF1A, KIF5A, KPNA3, L1CAM, NIPA1, NT5C2, OPA3, PLP1, REEP1, REEP2, RTN2, SLC16A2, SLC33A1, SPART, SPAST, SPG11, SPG21, SPG7, TUBB4A, UBAP1, WASHC5, ZFYVE26, ZFYVE27 ( 38遺伝子 )

各遺伝子の詳細：
・SPAST遺伝子（SPG4）：
スパスチンをコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式で、最も頻度の高い原因遺伝子です（約38％）。微小管の切断に関与するタンパク質をコードしています。発症年齢は幅広く、大部分は純粋型ですが、一部に複合型もあります。

・ATL1遺伝子（SPG3A）：
アトラスチン-1をコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式で、比較的若年発症が多いです（約5％）。小胞体の形態維持に関与します。

・REEP1遺伝子（SPG31）：
受容体付随タンパク質1をコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式で、約5％を占めます。小胞体の形態維持に関与します。

・KIF5A遺伝子（SPG10）：
キネシンファミリーメンバー5Aをコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式で、細胞内輸送に関与します（約2％）。

・SPG11遺伝子：
スパタシンをコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、最も頻度の高い劣性遺伝性HSPです。脳梁の菲薄化を特徴とし、複合型が多いです。

・SPG7遺伝子：
パラプレジンをコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、ミトコンドリア障害に関連します。小脳失調を伴うことがあります。

・L1CAM遺伝子（SPG1）：
L1細胞接着分子をコードする遺伝子。X連鎖遺伝形式で、男児に発症し、知的障害を伴うことが多いです。

・PLP1遺伝子（SPG2）：
プロテオリピドタンパク質1をコードする遺伝子。X連鎖遺伝形式で、Pelizaeus-Merzbacher病の軽症型とも関連します。

・BSCL2遺伝子：
セイピン（seipin）をコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式で、上肢の障害を伴うことがあります（Silver症候群）。

・NIPA1遺伝子（SPG6）：
マグネシウムトランスポーターをコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式です。

・SPG21遺伝子（ACP33遺伝子）：
マストイリンをコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、脳梁の菲薄化を伴うことがあります。

・ZFYVE26遺伝子（SPG15）：
スパスチジンをコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、脳梁の菲薄化を特徴とします。

・ZFYVE27遺伝子（SPG33）：
プロテルギンをコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式です。

・WASHC5遺伝子（SPG8）：
WASH複合体サブユニット5をコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式です。

・ERLIN2遺伝子（SPG18）：
ERリピドラフト関連タンパク質2をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式です。

・FA2H遺伝子（SPG35）：
脂肪酸2-水酸化酵素をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、脂質代謝に関与します。

・CYP7B1遺伝子（SPG5）：
シトクロムP450 7B1をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、ステロイド代謝に関与します。

・ALDH18A1遺伝子（SPG9）：
アルデヒド脱水素酵素18ファミリーメンバーA1をコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式です。

・SPART遺伝子（SPG20）：
スパルチンをコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、Troyer症候群の原因遺伝子です。

・HSPD1遺伝子（SPG13）：
熱ショックタンパク質60をコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式で、ミトコンドリアシャペロンに関与します。

・BICD2遺伝子（SPG51）：
ビカウダルDホモログ2をコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式で、細胞内輸送に関与します。

・KIF1A遺伝子（SPG30）：
キネシンファミリーメンバー1Aをコードする遺伝子。常染色体優性または劣性遺伝形式で、細胞内輸送に関与します。

・REEP2遺伝子：
受容体付随タンパク質2をコードする遺伝子。小胞体の形態維持に関与します。

・RTN2遺伝子（SPG12）：
レティキュロン2をコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式で、小胞体の形態維持に関与します。

・ABCD1遺伝子：
ATP結合カセットサブファミリーDメンバー1をコードする遺伝子。X連鎖遺伝形式で、副腎白質ジストロフィー（ALD）の原因遺伝子としても知られています。

・ACOX1遺伝子：
アシルCoAオキシダーゼ1をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、ペルオキシソームの脂肪酸β酸化に関与します。

・AP5Z1遺伝子（SPG48）：
アダプター関連タンパク質複合体5ζ1サブユニットをコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式です。

・ATAD3A遺伝子（SPG84）：
ATPアーゼファミリーAAA+ドメイン含有タンパク質3Aをコードする遺伝子。ミトコンドリア機能に関与します。

・CPT1C遺伝子（SPG73）：
カルニチンパルミトイルトランスフェラーゼ1Cをコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式です。

・DNM2遺伝子：
ダイナミン2をコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式で、小胞輸送に関与します。

・DSTYK遺伝子（SPG23）：
デュアルセリン/スレオニンおよびチロシンタンパク質キナーゼをコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式です。

・KPNA3遺伝子：
カリオフェリンサブユニットα3をコードする遺伝子。核輸送に関与します。

・NT5C2遺伝子（SPG45）：
5′-ヌクレオチダーゼ、サイトゾリックIIをコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式です。

・OPA3遺伝子：
視神経萎縮症3をコードする遺伝子。ミトコンドリア機能に関与します。

・SLC16A2遺伝子（SPG36）：
溶質担体ファミリー16メンバー2（甲状腺ホルモントランスポーター）をコードする遺伝子。X連鎖遺伝形式です。

・SLC33A1遺伝子（SPG42）：
溶質担体ファミリー33メンバー1（アセチルCoAトランスポーター）をコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式です。

・TUBB4A遺伝子（SPG5、DYT4）：
チューブリンβ4Aクラスをコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式で、微小管の構成に関与します。

・UBAP1遺伝子（SPG80）：
ユビキリン関連タンパク質1をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式です。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※この検査パネルでは、38の原因遺伝子のみを対象としています。常染色体優性遺伝性HSPの約半数では、既知の遺伝子に変異が見つかりません。検査で病原性変異が検出されなくても、疾患を完全に否定することはできません。臨床症状と合わせた総合的な判断が必要です。