難聴遺伝子検査パネル

(更新日：2023/11/15)

1 難聴遺伝子検査パネル

難聴遺伝子検査パネル

難聴遺伝子検査パネルは、難聴の病歴または家族歴を持つすべての人に適しています。聴力検査の不合格、言語発達の遅れ、難聴、予想より若い年齢で補聴器を必要とするなどの特徴を示した個人または家族には、この検査が有効です。

難聴とは、両側または片側の聴力が部分的または完全に失われることを指します。難聴には伝音性、感音性、または混合性があります。感音性難聴の約80%は遺伝性です。難聴は、非症候性（症例の約70％）または症候性（症例の約30％）です。症候性とは、他の疾患や追加的な症状を伴って発生する難聴です。非症候性とは他の疾患や付加的な症状を伴わない難聴を言います。難聴の大部分は常染色体劣性遺伝ですが、どのような遺伝パターンもあり得ます。

難聴の症状や程度は人によって様々です。難聴の症状は完全に聞こえなくなる場合と、部分的に聞こえなくなる場合があります。難聴は、片耳または両耳に症状が出ることもあり、特定の音域にのみ症状が出ることもあります。また、他の症状を伴うこともあります。多くの人が多くの人が年をとるにつれて難聴を経験しますが、遺伝的な難聴は若い年齢で起こることもあります。幼児期にも発症することがあります。

難聴の原因には、環境因子と遺伝があり、その両方が関与する可能性があります。CDCによると乳幼児の難聴の約50％は遺伝に起因すると言われています。環境因子と遺伝の両方が難聴になる可能性があります。CDCによると、乳幼児の難聴の約50％は難聴の約50％は遺伝に起因すると言われています。同様に、遺伝的な要因も加齢による難聴の原因となることもあります。環境要因による難聴の影響を受けやすくなることが考えられます。環境要因には、大きな音にさらされること、薬物治療、ある種の感染症などがあります。感染症などの環境因子は、耳の構造を弱め、難聴の原因となる可能性があります。

このように、年齢によるものであれ、生まれつきのものであれ、遺伝が難聴に関与していることはよくあります。この遺伝子検査パネルには、非症候性難聴と、アッシャー症候群、アルポート症候群、ヤーベル・ランゲ・ニールセン症候群、ワールデンブルグ症候群、鰓弓耳腎（Branchio-oto-renal：BOR）症候群などの症候群性難聴に関連する遺伝子が含まれています。検査結果は、診断やリスク評価に役立つ場合があります。

患者にとってどのような利点があるのでしょうか？

遺伝子検査は、難聴の原因を説明するのに役立ち、また医療従事者が新たな症状の発現に備えるのに役立ちます。早期に発見されれば、発症を遅らせたり、症候群的な特徴を改善するための治療の選択肢があるかもしれません。

総合的な難聴の遺伝学的検査は、以下を可能にします。

適切な診断の確立または確認
その他の関連症状のリスクの特定
より個別化された治療や症状管理の実現
家族に対して、自分自身の危険因子について情報を提供する
家族計画のための選択肢を提供する

難聴遺伝子検査パネルの対象遺伝子

ABHD12, ACTB, ACTG1, ADCY1, ADGRV1, AIFM1, ALMS1, AMMECR1, ANKH, ASAH1, ATP6V1B1, BCS1L, BDP1, BSND, BTD, CABP2, CACNA1D, CATSPER2, CCDC50, CD164, CDC14A, CDC42, CDH23, CEACAM16, CEP78, CHD7, CHSY1, CIB2, CISD2, CLDN14, CLIC5, CLPP, CLRN1, COCH, COL11A1, COL11A2, COL2A1, COL4A3, COL4A4, COL4A5, COL4A6, COL9A1, COL9A2, COL9A3, CRYL1, CRYM, DCDC2, DIABLO, DIAPH1, DIAPH3, DNMT1, DSPP, EDN3, EDNRB, ELMOD3, EPS8, ERCC2, ERCC3, ESPN, ESRRB, EYA1, EYA4, FGF3, FGFR1, FGFR2, FOXI1, GATA3, GIPC3, GJA1, GJB2, GJB3, GJB6, GPSM2, GRHL2, GRXCR1, GRXCR2, GSDME, HARS, HARS2, HGF, HOMER2, HOXB1, HSD17B4, ILDR1, KARS, KCNE1, KCNJ10, KCNQ1, KCNQ4, KITLG, LARS2, LHFPL5, LHX3, LOXHD1, LRP2, LRTOMT, MANBA, MARVELD2, MET, MIR96, MITF, MPZL2, MSRB3, MYH14, MYH9, MYO15A, MYO1C, MYO3A, MYO6, MYO7A, NARS2, NDP, NF2, NLRP3, OPA1, OSBPL2, OTOA, OTOF, OTOG, OTOGL, P2RX2, PAX3, PCDH15, PDZD7, PEX1, PEX6, PJVK, PMP22, PNPT1, POLR1C, POLR1D, POU3F4, POU4F3, PRPS1, PTPRQ, RDX, RIPOR2, ROR1, S1PR2, SEMA3E, SERPINB6, SIX1, SIX5, SLC17A8, SLC19A2, SLC26A4, SLC26A5, SLC4A11, SLC52A2, SLC52A3, SLITRK6, SMAD4, SMPX, SNAI2, SOX10, STRC, SYNE4, TBC1D24, TBL1X, TBX1, TCOF1, TECTA, TFAP2A, TIMM8A, TJP2, TMC1, TMEM132E, TMIE, TMPRSS3, TMPRSS5, TNC, TPRN, TRIOBP, TSPEAR, TWNK, TYR, USH1C, USH1G, USH2A, WFS1, WHRN ( 181 遺伝子 )

Sequencing（塩基配列の決定）とDel/Dup（欠失/重複）が検査対象となります。

カバレッジ

カバレッジについては別ページをご覧ください。

96% (20×)

検体

血液（4ml EDTAチューブ2本）または抽出DNA（EBバッファーに3ug）または頬粘膜または唾液。

検査のテストの限界

すべてのシーケンサー技術には限界があります。この解析は次世代シーケンス（NGS）により行われ、コーディング領域とスプライシングジャンクションを調べるように設計されています。次世代シーケンス技術やバイオインフォマティクス解析は、偽遺伝子配列やその他の相同性の高い配列の寄与を大幅に低減しますが、それでも、シーケンス解析および欠失／重複解析のいずれにおいても、病原性バリアントアレルを特定する本アッセイの技術能力を妨げる場合があります。サンガー・シーケンスは、品質スコアが低いバリアントを確認し、カバレッジ標準を満たすために使用されます。当院の遺伝子検査は、欠失／重複解析を含めて行なっており、1つの遺伝子全体（頬粘膜検体および全血検体）を含み、2つ以上の連続したエクソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を特定できます。単一エクソンの欠失または重複が特定できることもあるが、この検査では日常的に検出されるわけではありません。同定された推定欠失または重複は、直交する方法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。この検査は、転座や逆位、反復拡大（例えばトリヌクレオチドやヘキサヌクレオチド）、ほとんどの制御領域（プロモーター領域）や深いイントロン領域（エクソンから20bp以上）での変化など（ただしこれらに限らない）の疾患を引き起こすかもしれない特定のタイプのゲノム変化を検出することはありません。このアッセイは、体細胞モザイクや体細胞突然変異の検出のために設計または検証されたものではありません。