難聴遺伝子検査パネル｜ミネルバクリニック

ABHD12, ACTB, ACTG1, ADCY1, ADGRV1, AIFM1, ALMS1, AMMECR1, ANKH, ASAH1, ATP6V1B1, BCS1L, BDP1, BSND, BTD, CABP2, CACNA1D, CATSPER2, CCDC50, CD164, CDC14A, CDC42, CDH23, CEACAM16, CEP78, CHD7, CHSY1, CIB2, CISD2, CLDN14, CLIC5, CLPP, CLRN1, COCH, COL11A1, COL11A2, COL2A1, COL4A3, COL4A4, COL4A5, COL4A6, COL9A1, COL9A2, COL9A3, CRYL1, CRYM, DCDC2, DIABLO, DIAPH1, DIAPH3, DNMT1, DSPP, EDN3, EDNRB, ELMOD3, EPS8, ERCC2, ERCC3, ESPN, ESRRB, EYA1, EYA4, FGF3, FGFR1, FGFR2, FOXI1, GATA3, GIPC3, GJA1, GJB2, GJB3, GJB6, GPSM2, GRHL2, GRXCR1, GRXCR2, GSDME, HARS, HARS2, HGF, HOMER2, HOXB1, HSD17B4, ILDR1, KARS, KCNE1, KCNJ10, KCNQ1, KCNQ4, KITLG, LARS2, LHFPL5, LHX3, LOXHD1, LRP2, LRTOMT, MANBA, MARVELD2, MET, MIR96, MITF, MPZL2, MSRB3, MYH14, MYH9, MYO15A, MYO1C, MYO3A, MYO6, MYO7A, NARS2, NDP, NF2, NLRP3, OPA1, OSBPL2, OTOA, OTOF, OTOG, OTOGL, P2RX2, PAX3, PCDH15, PDZD7, PEX1, PEX6, PJVK, PMP22, PNPT1, POLR1C, POLR1D, POU3F4, POU4F3, PRPS1, PTPRQ, RDX, RIPOR2, ROR1, S1PR2, SEMA3E, SERPINB6, SIX1, SIX5, SLC17A8, SLC19A2, SLC26A4, SLC26A5, SLC4A11, SLC52A2, SLC52A3, SLITRK6, SMAD4, SMPX, SNAI2, SOX10, STRC, SYNE4, TBC1D24, TBL1X, TBX1, TCOF1, TECTA, TFAP2A, TIMM8A, TJP2, TMC1, TMEM132E, TMIE, TMPRSS3, TMPRSS5, TNC, TPRN, TRIOBP, TSPEAR, TWNK, TYR, USH1C, USH1G, USH2A, WFS1, WHRN（181遺伝子）

主要な遺伝子の詳細：

・GJB2遺伝子（コネキシン26）：
日本人の先天性難聴で最も頻度が高い原因遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、非症候性難聴を引き起こします。人工内耳の良好な適応とされています。

・SLC26A4遺伝子（ペンドリン）：
日本人で2番目に多い原因遺伝子。ペンドレッド症候群（甲状腺腫を伴う）やDFNB4（非症候性難聴）の原因となります。前庭水管拡大症を伴い、進行性難聴を呈することがあります。

・CDH23、PCDH15、USH1C、USH1G、USH2A、WHRN、CLRN1遺伝子：
アッシャー症候群の原因遺伝子。難聴と進行性網膜色素変性症を特徴とします。

・COL4A3、COL4A4、COL4A5、COL4A6遺伝子：
アルポート症候群の原因遺伝子。腎機能障害、感音難聴、眼症状を伴います。

・KCNQ1、KCNE1遺伝子：
ジャーベル・ランゲ-ニールセン症候群の原因遺伝子。先天性難聴とQT延長症候群を伴います。

・PAX3、MITF、SNAI2、SOX10、EDN3、EDNRB遺伝子：
ワールデンブルグ症候群の原因遺伝子。難聴と色素異常を特徴とします。

・EYA1、SIX1、SIX5遺伝子：
鰓耳腎症候群の原因遺伝子。難聴、鰓原性器官異常、腎尿路異常を伴います。

・OTOA遺伝子：
偽遺伝子の干渉により、現在の検査方法ではエキソン20-28（NM_144672.3）の変異を確実に検出できません。

・STRC遺伝子：
この検査では一般的なSTRC/CATSPER2連続遺伝子欠失を検出できます。偽遺伝子の干渉により、STRCの他の変異（部分的遺伝子欠失やSTRCの配列変異など）は通常評価されません。

・TPRN遺伝子：
エキソン1は現在の配列決定法では解析が困難なため、この領域の配列決定および欠失/重複分析は実施されません。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

遺伝子特異的な制限事項：

・OTOA遺伝子：偽遺伝子の干渉により、現在の検査方法ではエキソン20-28（NM_144672.3）の変異を確実に検出できません。

・STRC遺伝子：この検査では一般的なSTRC/CATSPER2連続遺伝子欠失を検出できます。偽遺伝子の干渉により、STRCの他の変異（STRCの部分的遺伝子欠失やSTRCの配列変異など）は通常評価されません。

・TPRN遺伝子：エキソン1は現在の配列決定法では解析が困難なため、この領域の配列決定および欠失/重複分析は実施されません。

※検査で病原性変異が検出されなくても、疾患を完全に否定することはできません。検査対象外の遺伝子や、検出できない種類の変異が原因である可能性があります。