ネフローゼ症候群・糸球体性蛋白尿NGS遺伝子検査パネル｜ミネルバクリニック

ABCC6, ACTN4, ALG1, AMN, ANLN, APOE, APOL1, ARHGAP24, ARHGDIA, CD151, CD2AP, CFH, COL4A3, COL4A4, COL4A5, COQ2, COQ6, COQ8B, CRB2, CUBN, DGKE, ELMO1, EMP2, ENPP1, ERCC4, EXT1, FAN1, FAT1, FGA, FN1, FOXP3, HNF1B, INF2, ITGA3, ITGB4, KANK1, KANK2, KANK4, LAGE3, LAMB2, LMX1B, LPL, LRP2, MAFB, MAGI2, MEFV, MYH9, MYO1E, NEIL1, NPHS1, NPHS2, NUP107, NUP205, NUP93, NXF5, OSGEP, PAX2, PDSS2, PLCE1, PMM2, PTPRO, REN, SCARB2, SEC61A1, SGPL1, SMARCAL1, TP53RK, TPRKB, TRPC6, TTC21B, UMOD, WDR73, WT1, XPO5, ZAP70, ZMPSTE24 ( 76遺伝子 )

主要な遺伝子の詳細：
・NPHS1遺伝子：
ネフリン（nephrin）をコードする遺伝子。スリット膜の最も重要な構成タンパク質で、タンパク尿を防ぐ働きを持ちます。フィンランド型先天性ネフローゼ症候群の原因遺伝子として知られ、常染色体劣性遺伝形式をとります。生後数日～数週間で高度の蛋白尿とネフローゼ症候群を発症します。

・NPHS2遺伝子：
ポドシン（podocin）をコードする遺伝子。スリット膜に局在し、ネフリンと相互作用してろ過バリアを形成します。常染色体劣性遺伝形式で、乳児～小児期発症のステロイド抵抗性ネフローゼ症候群の最も頻度の高い原因遺伝子です。

・WT1遺伝子：
ウィルムス腫瘍1タンパク質（Wilms’ tumor 1）をコードする転写因子。ポドサイトの分化と維持に重要な役割を果たします。Denys-Drash症候群（男性仮性半陰陽、ウィルムス腫瘍、腎症）やFrasier症候群（男性仮性半陰陽、巣状分節性糸球体硬化症）の原因となります。

・LAMB2遺伝子：
ラミニンβ2鎖をコードし、糸球体基底膜の構成要素。常染色体劣性遺伝形式で、Pierson症候群（先天性ネフローゼ症候群＋小眼球症などの眼異常）の原因です。

・PLCE1遺伝子：
ホスホリパーゼCε1（phospholipase C epsilon 1）をコードし、細胞内シグナル伝達に関与します。常染色体劣性遺伝形式で、早期発症型のネフローゼ症候群やびまん性メサンギウム硬化症の原因となります。

・ACTN4遺伝子：
α-アクチニン4（alpha-actinin-4）をコードし、ポドサイトの足突起の細胞骨格を構成します。常染色体優性遺伝形式で、成人発症の家族性巣状分節性糸球体硬化症（FSGS）の原因遺伝子です。

・TRPC6遺伝子：
陽イオンチャネルTRPC6（transient receptor potential cation channel 6）をコードし、ポドサイトのカルシウム流入経路として機能します。常染色体優性遺伝形式で、家族性FSGSの原因遺伝子の一つです。

・INF2遺伝子：
インバーテッドフォルミン2（inverted formin 2）をコードし、アクチン細胞骨格の調節に関与します。常染色体優性遺伝形式で、常染色体優性FSGSの最も頻度の高い原因遺伝子です（家族性FSGSの約17%）。

・CD2AP遺伝子：
CD2結合タンパク質（CD2-associated protein）をコードし、スリット膜と細胞骨格をつなぐアダプタータンパク質として機能します。ネフリンやポドシンと相互作用し、ポドサイトの構造維持に重要です。

・MYO1E遺伝子：
ミオシン1E（myosin 1E）をコードし、ポドサイトの足突起の維持に関与します。常染色体劣性遺伝形式で、小児期発症のステロイド抵抗性ネフローゼ症候群の原因です。

・COL4A5遺伝子：
IV型コラーゲンα5鎖をコードし、糸球体基底膜の主要構成要素。X連鎖遺伝形式で、アルポート症候群の約80%を占めます。男性で重症、女性で軽症～中等症の腎炎を呈し、難聴や眼症状（前部円錐水晶体、網膜斑点など）を合併します。

・COL4A3・COL4A4遺伝子：
IV型コラーゲンα3鎖・α4鎖をコードし、糸球体基底膜の構成要素。常染色体劣性遺伝形式でアルポート症候群（約15%）、常染色体優性遺伝形式で菲薄基底膜病または遅発性アルポート症候群（約5%）の原因となります。

・APOL1遺伝子：
アポリポタンパク質L1（apolipoprotein L1）をコードします。G1とG2と呼ばれる特定のリスク変異は、主にアフリカ系の人々でFSGSや高血圧性腎硬化症のリスクを著しく高めます。

・MYH9遺伝子：
非筋型ミオシン重鎖IIA（non-muscle myosin heavy chain IIA）をコードします。May-Hegglin異常、Fechtner症候群、Sebastian症候群などの症候群性FSGS/腎疾患の原因です。血小板異常や難聴を合併します。

・CFH遺伝子：
補体因子H（complement factor H）をコードし、補体の代替経路の調節に関与します。非典型溶血性尿毒症症候群（aHUS）や膜性増殖性糸球体腎炎の原因となります。

・COQ2、COQ6、COQ8B、PDSS2遺伝子：
コエンザイムQ10（CoQ10）生合成経路に関与する遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、ミトコンドリア機能障害によるステロイド抵抗性ネフローゼ症候群を引き起こします。CoQ10補充療法が有効な場合があります。

その他、ANLN、ARHGAP24、ARHGDIA、CRB2、DGKE、FN1、HNF1B、KANK1、KANK2、KANK4、LMX1B、MAGI2、PAX2、SMARCAL1など、糸球体のポドサイト機能、細胞骨格、シグナル伝達、核膜孔複合体、腎臓発生に関与する多数の遺伝子も含まれています。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

遺伝子特異的な制限：
ALG1遺伝子については、高度に相同な領域の干渉により、現在の検査方法ではエキソン6-13（NM_019109.4）の変異検出感度が低下しています。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※この検査パネルでは、76の遺伝子を対象としていますが、すべての遺伝性腎疾患の原因遺伝子を網羅しているわけではありません。検査で病原性変異が検出されなくても、遺伝性腎疾患を完全に否定することはできません。また、多因子性の腎疾患や環境因子の関与も考慮する必要があります。