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承認済シンボル:TP53
遺伝子名:tumor protein p53
参照:
HGNC: 11998
NCBI:7157
遺伝子OMIM番号191170
Ensembl :
UCSC : ENSG00000141510
AllianceGenome : HGNC : 11998
遺伝子のlocus type :タンパク質をコードする
遺伝子のグループ:
遺伝子座: 17p13.1
TP53遺伝子の機能
TP53遺伝子産物は、DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的活性、酵素結合活性、核酸結合活性など。細胞内シグナル伝達、DNA鋳型転写の制御、アポトーシス過程の制御などいくつかの過程に関与する。細胞周期G2/M相転移の制御に負の影響を及ぼす上流で働く。ER過剰応答、グルコース飢餓に対する細胞応答、p53クラスメディエーターによるDNA損傷に応答した内在性アポトーシスシグナル伝達経路など、いくつかのプロセスの上流またはその中で働く。中心体、核内腔、転写抑制複合体など、いくつかの細胞構成要素に存在する。クロマチンおよび転写制御因子複合体の一部。核小体と共局在。Li-Fraumeni症候群(複数)、がん(複数)、消化器系がん(複数)、血液がん(複数)、開放隅角緑内障(複数)など、いくつかの疾患に関与。癌腫(複数)、移植片対宿主病、血液癌(複数)、口腔粘膜白板症、口腔粘膜下線維症など複数の疾患のバイオマーカー。
この遺伝子は、転写活性化ドメイン、DNA結合ドメイン、オリゴマー化ドメインを持つ癌抑制タンパク質をコードしている。コードされたタンパク質は様々な細胞ストレスに応答して標的遺伝子の発現を制御し、それによって細胞周期の停止、アポトーシス、老化、DNA修復、代謝の変化を誘導する。この遺伝子の変異は、Li-Fraumeni症候群のような遺伝性癌を含む様々なヒト癌と関連している。この遺伝子の代替スプライシングと代替プロモーターの使用により、複数の転写産物の変異体およびアイソフォームが生じる。また、同一の転写産物の変異体から別の翻訳開始コドンが使用されることにより、さらなるアイソフォームが生じることも示されている(PMID: 12032546, 20937277)。2016年12月、RefSeqより提供。
TP53遺伝子の発現
脾臓(RPKM 13.2)、リンパ節(RPKM 13.1)、その他25組織でユビキタスに発現
TP53遺伝子と関係のある疾患
※OMIIMの中括弧”{ }”は、多因子疾患または感染症に対する感受性に寄与する変異を示す。[ ]は「非疾患」を示し、主に検査値の異常をもたらす遺伝的変異を示す。クエスチョンマーク”? “は、表現型と遺伝子の関係が仮のものであることを示す。エントリ番号の前の数字記号(#)は、記述的なエントリであること、通常は表現型であり、固有の遺伝子座を表さないことを示す。
Li-Fraumeni syndrome リ・フラウメニ症候群
151623 AD 3
Li-Fraumeni症候群(リ・フラウメニ症候群)(LFS)は、臨床的にも遺伝学的にも異質な遺伝性癌症候群である。LFSは常染色体優性遺伝と腫瘍の早期発症、個体内の多発性腫瘍、複数の罹患家族を特徴とする。部位特異的な癌を主徴とする他の遺伝性癌症候群とは対照的に、LFSは様々なタイプの腫瘍を呈する。最も一般的なものは、軟部肉腫、骨肉腫、乳癌、脳腫瘍、白血病、副腎皮質癌である。古典的なLFSは、45歳以前に肉腫を発症し、45歳以前に何らかの癌を発症した1親等以内の近親者、および45歳以前に何らかの癌を発症した1親等以内の近親者、または45歳以前に肉腫を発症した1親等以内の近親者、または45歳以前に肉腫を発症した2親等以内の近親者であると定義される(Li et al., 1988)。Li-Fraumeni様症候群(LFL)は、45歳以前に小児がん、肉腫、脳腫瘍、副腎皮質腫瘍のいずれかを発症したプローバントと、年齢を問わず典型的なLFS腫瘍を発症した同系統の第1度または第2度近親者、および60歳以前に何らかのがんを発症した同系統の第1度または第2度近親者が1人追加されたものと定義される(Birch et al., 1994)。より限定的なLFLの定義は、年齢を問わず一度または二度の近親者に2つの異なるLFS関連腫瘍があることである(Eeles, 1995)。LFS症例の約70%およびLFL症例の40%は、染色体17p13.1上のp53遺伝子に生殖細胞系列変異を有する(Bachinski et al., 2005)。
Bone marrow failure syndrome 5 骨髄不全症候群5
618165 AD 3
骨髄不全症候群-5(BMFS5)は、染色体17p13上のTP53遺伝子(191170)のヘテロ接合体変異によって引き起こされるという証拠があるため、この項目には番号記号(#)が使用されている。
骨髄不全症候群-5(BMFS5)は、輸血を必要とする重篤な赤血球貧血の幼児期発症を特徴とする血液疾患である。その他の特徴として、低ガンマグロブリン血症、小頭症を伴う発育不良、発達遅延、および痙攣がある(Tokiらによる要約、2018年)。
骨髄不全症候群の遺伝的多様性
染色体9q22上のERCC6L2遺伝子(615667)の変異に起因するBMFS2(615715);染色体5p13上のDNAJC21遺伝子(617048)の変異に起因するBMFS3(617052)も参照のこと; 染色体1p32上のMYSM1遺伝子(612176)の変異に起因するBMFS4(618116)、染色体17p13上のTP53遺伝子(191170)の変異に起因するBMFS5(618165); 染色体1q32上のMDM4遺伝子(602704)の変異に起因するBMFS6(618849)、BMFS7(AMEDS; 619151)、染色体12q24上のALDH2遺伝子(100650)の特異的変異を伴う染色体4q上のADH5遺伝子(103710)の変異に起因するBMFS7(AMEDS;619151)、染色体1p21上のSLC30A7遺伝子(611149)の変異に起因するBMFS8(ZHS;620501)。
臨床的特徴
Tokiら(2018)は、生後数日から数カ月で貧血と低ガンマグロブリン血症を呈した血縁関係のない患者2例を報告した。両患者とも輸血とIgG補充が必要であった。他の血液パラメータは正常であった。骨髄検査では選択的赤血球減少がみられた。両患者ともさらに症候群的特徴を有していた。患者1は20歳の男性で、生後3ヵ月で発作を発症し、重度の小頭症(-6SD)を伴う発育不良、認知障害を伴う全体的な発達遅滞を認めた。また、皮膚の網状色素沈着、歯の異常、性腺機能低下症、骨年齢の遅れがみられた。13歳の時、貧血は自然寛解を示し、クローン性遺伝的復帰事象を示唆した。しかし、血小板数は徐々に減少し、骨髄は軽度の三系列低形成を示した。2番目の患者は5歳の男児で、生後9ヵ月で無熱性発作を起こした。また、重度の発育遅延、小頭症(-4.9SD)、全体的な発達遅滞がみられた。骨髄移植後、5歳で死亡した。両患者ともテロメアの長さは正常で、癌は発症せず、感染症も再発しなかった。
その他
{Basal cell carcinoma 7} 614740 AD 3
{Choroid plexus papilloma} 260500 AD 3
{Colorectal cancer} 114500AD, SMu 3
{Glioma susceptibility 1} 137800 AD, SMu 3
{Osteosarcoma} 259500 SMu 3
Breast cancer, somatic 114480 3
Hepatocellular carcinoma, somatic 114550 3
Nasopharyngeal carcinoma, somatic 607107 3
Pancreatic cancer, somatic 260350 3




