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PHF6遺伝子
別名:
染色体: X
遺伝子座: Xq26.2
遺伝カテゴリー:
関連する疾患:Borjeson-Forssman-Lehmann syndrome 301900 XLR
PHF6遺伝子の機能
PHF6遺伝子産物は細胞核、特に核小体に局在する。このような局在性と、2本のPHD様zinc fingerの存在から、PHF6が転写に関与していることが示唆された。
PHF6遺伝子の発現
Lowerら(2002)は、Borjeson-Forssman-Lehmann症候群(BFLS; 301900)のXq26.3の狭義の9-Mb臨界領域内にある62の特徴的な遺伝子の中に、植物のホメオドメイン(PHD)様フィンガー遺伝子(PHF6)を同定した。1,095bpのオープンリーディングフレーム(ORF)は、2本の不完全な亜鉛フィンガーを含む365アミノ酸のタンパク質をコードしている。1,095bpのオープンリーディングフレーム(ORF)は、2本の不完全な亜鉛フィンガーを含む365アミノ酸のタンパク質をコードしており、4.5kbの代替スプライシングされたユビキタス発現転写物を生成する。PHF6遺伝子の2つのスプライスバリアント(PHF6aとPHF6b)は、短い方のPHF6aのイントロン10を構成する330bpの配列の有無によって異なる。PHF6は、他の種のオルソログの間でもよく保存されている。生後12.5日目のマウス胚を用いてin situ hybridizationを行ったところ、Phf6は胚の中枢神経系で最も高発現しており、他の組織では低発現であった。成体の脳にも非常に低いレベルで存在していた。
Van Vlierbergheら(2010)は、ヒトの胸腺細胞におけるPHF6遺伝子の発現を報告しており、CD4/CD8+ T細胞では顕著なアップレギュレーションが見られた。
Lowerら(2002)は、緑色蛍光タンパク質(GFP)でタグ付けされたPHF6が、細胞核、特に核小体に局在することを示した。このような局在性と、2本のPHD様Zinc fingerの存在から、PHF6が転写に関与していることが示唆された。
PHF6遺伝子と自閉症スペクトラムASDとの関係
PHF6遺伝子の病的変異は自閉症スペクトラムに関係するとしてClinVarに登録されています。
PHF6遺伝子とその他の疾患との関係
Borjeson-Forssman-Lehmann 症候群
Borjeson-Forssman-Lehmann症候群(BFLS;301900)は、中等度から重度の精神遅滞、てんかん、性腺機能低下症、代謝低下症、著しい女性化乳房を伴う肥満、顔面の皮下組織の腫脹、狭い口蓋裂、変形していないが大きな耳を特徴とします。Lowerら(2002)は、Xq26.3のBFLS臨界区間内にPHF6遺伝子を同定した。この遺伝子の突然変異スクリーニングにより、家族性BFLS症例7例と散発性BFLS症例2例で、8種類のミスセンス変異と切断変異が同定された。一方、BFLSと推定診断された4例の散発性症例では、PHF6の変異は認められなかった。確定診断のための特異的な身体的・生化学的マーカーがないことを考えると、これは驚くべきことではないと考えられた。
Crawfordら(2006)は、BFLSに類似した症状を持つ14歳の少女において、PHF6遺伝子に1bpの挿入があることをヘテロ接合で確認した(300414.0010)。著者らは、臨床的にBFLSと診断された女性で、PHF6遺伝子の変異が確認されたのはこの報告が初めてであると述べています。Crawfordら(2006)は、臨床的にBFLSと診断された24人の血縁関係のない男性のうち、4人にPHF6遺伝子の変異を確認した。1人は母方のXが歪んで不活性化した孤立例、3人は家族例で、そのうち2人は母方のXが歪んで不活性化していた。Crawfordら(2006)は、BFLSが疑われる男性のPHF6スクリーニングの成功率は、家族歴がある場合や母親に歪んだXの不活性化が認められる場合に顕著に高まると結論づけている。