NSD1遺伝子
遺伝子名: nuclear receptor binding SET domain protein 1
別名:
染色体: 5
遺伝子座: 5q35.3
遺伝カテゴリー: Syndromic-Rare Single Gene variant
関連する疾患:Sotos syndrome 1 117550 AD
機能
NSD1遺伝子は、SETドメイン、2つのLXXLLモチーフ、3つの核内移行シグナル(NLS)、4つの植物ホメオドメイン(PHD)フィンガー領域、およびプロリンリッチ領域を含むタンパク質をコードしている。このタンパク質は、アンドロゲン受容体(AR)の活性化を促進し、他のアンドロゲン受容体に関連するコレギュレーターが存在する場合には、この活性化がさらに促進される。このタンパク質は、核に局在する基本的な転写因子として、また、二重機能を持つ転写調節因子として作用する可能性がある。この遺伝子の変異は、ソトス症候群とウィーバー症候群に関連している。この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする2つの転写バリアントが同定されています。
発現
Jajuら(1999)は、de novoの小児急性骨髄性白血病(AML)において、5番染色体の長腕の欠失を伴うt(5;11)(q35;p15.5)という再発性の隠蔽性転座を同定した。Jajuら(2001)は、11番染色体のブレイクポイント遺伝子がNUP98(601021)であることを確認し、その新規5番染色体融合パートナーであるNSD1のクローニングを報告した。NUP98のヌクレオチド1552は、NSD1のヌクレオチド3504とインフレームで融合していた。NSD1の完全なコード化された配列は、2,596アミノ酸のタンパク質をコードしている。ヒトとマウスのNSD1タンパク質は、85%の配列が同一であり、保存されたSETドメイン、SETドメイン関連システインリッチドメイン(SACドメイン)、5本のPHDフィンガーを含む同じドメイン構造を持っている。ノーザンブロット解析では、10.5kbと12.0kbの2つのNSD1転写産物が、それぞれ血液組織とその他の組織に広く発現していることが検出された。
Wangら(2001)は、ARとTR4(NR2C2)のリガンド結合ドメイン(LBD)を餌にした脳cDNAライブラリーの酵母2ハイブリッドスクリーニングと、精巣cDNAライブラリーの5-prime RACEを用いて、NSD1をコードするcDNAを単離した。このタンパク質は、SETドメイン、2つのLXXLLモチーフ、3つの核内移行シグナル(NLS)、4つの植物ホメオドメイン(PHD)フィンガー領域、およびプロリンリッチ領域を有している。4つのPHDフィンガー領域には、cys-rich領域、リングフィンガー、ジンクフィンガーが含まれている。また、Wangら(2001)は、ARA267-βアイソフォームが、マウスのNsd1と83%相同で、ARA267-αの11番目の残基に合流する279個のN末端残基を持つ2,696アミノ酸のタンパク質をコードしていることを明らかにした。ノーザンブロット解析では、複数の細胞株で13kbおよび10kbの転写産物の発現が確認された。ドットブロット解析では、ほとんどの組織で発現が確認され、リンパ節での発現が最も高かった。変異解析および結合解析の結果、ARA267のN-末端およびC-末端ドメインは、全長またはC-末端ARと相互作用するが、N-末端ARとは相互作用しないことから、ARのLBDおよびDNA結合ドメインが相互作用に関与している可能性が示唆された。ルシフェラーゼ解析の結果、ARA267は他のARAコレギュレーターと同様に、ARのN末端とC末端の相互作用にほとんど影響を与えないことが明らかになった。
自閉症スペクトラムASDとの関係
この遺伝子は、特定の症候群を持つ人の一部が自閉症を発症する症候性自閉症と関連している。特に、NSD1遺伝子のまれな変異は、ソトス症候群との関連が指摘されている(Kurotaki et al. ある研究では、ASD患者にNSD1遺伝子のいくつかの稀な変異が確認されたが、これらの変異は非病原性であると考えられている(Buxbaumら、2007年)。
その他の疾患との関係
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NSD1 | |
疾患名 | ソトス症候群1型 |
バリアント | |
検出率 | |
分布 | |
引用 | |
程度 | 重度 |
遺伝形式 | |
症状:引用元 | |
症状 | 頭が大きい(大頭症)などの顔貌の特徴、過成長、発達の遅れがみられます。その他の特徴は、行動障害、先天性心奇形、新生児黄疸、腎奇形、脊柱側彎、てんかんなどです。 |
頻度 | 約2,500人 |
保因者頻度 | 新生突然変異 |
新生児マススクリーニング | 対象外 |
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