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CLRN1

承認済シンボルCLRN1
遺伝子:clarin 1
参照:
HGNC: 12605
AllianceGenome : HGNC : 12605
NCBI7401
Ensembl :ENSG00000163646
UCSC : uc003eyk.1
遺伝子OMIM番号606397
遺伝子のlocus type :タンパク質をコードする
遺伝子のグループ:Clarins
遺伝子座:3q25.1
ゲノム座標:(GRCh38): 3:150,926,163-150,972,999

遺伝子の別名

USH3
USH3A
USH3A_HUMAN
Usher syndrome 3A
Usher syndrome type 3 protein

遺伝子の概要

CLRN1遺伝子によってコードされるクラリン1タンパク質は、正常な聴覚と視覚の両方に重要な役割を果たしていることが示唆されています。このタンパク質が特に重要であるのは、内耳に存在する有毛細胞や、光を感知する目の網膜といった感覚器官の機能においてです。有毛細胞は、音や動きの信号を検出し、これらの情報を神経信号に変換して脳に伝える役割を持ちます。同様に、網膜は目に入ってくる光を検出し、それを神経信号に変換して視覚情報として脳に送ります。

クラリン1の正確な機能はまだ完全には解明されていませんが、既存の研究からは、このタンパク質が内耳と網膜の神経細胞間のコミュニケーションにおいて重要な役割を果たしていることが示唆されています。特に、神経細胞間の接合部であるシナプスの発達と機能においてクラリン1が関与している可能性があります。シナプスは、神経細胞間で情報が伝達される場所であり、この過程は聴覚や視覚の正常な機能に不可欠です。

CLRN1遺伝子の変異は、Usher症候群タイプ3と関連しています。この症候群は、聴覚障害、進行性の視覚障害(網膜色素変性症)、時には平衡感覚の問題を引き起こす遺伝性の状態です。クラリン1の損失や機能不全は、これらの感覚器官の異常に直接関連していると考えられています。

したがって、クラリン1タンパク質の研究は、これらの感覚障害の理解を深め、将来的には治療法の開発につながる可能性があります。細胞間コミュニケーションとシナプス機能の調節におけるクラリン1の役割の解明は、聴覚と視覚障害を持つ人々の生活の質を改善するための重要なステップです。

遺伝子と関係のある疾患

Retinitis pigmentosa 61  網膜色素変性症61 614180 3 

Usher syndrome, type 3A  アッシャー症候群3A  276902 AR 3 

遺伝子の発現とクローニング

Joensuuらによる2001年の研究は、アッシャー症候群IIIA型(USH3A)の原因となる遺伝子であるCLRN1を含む、染色体3q21-q25上のクリティカル領域に位置するいくつかの遺伝子を同定しました。彼らはESTデータベース検索と塩基配列決定を通じてこの発見を行いました。USH3Aタンパク質は細胞質のN末端、2つの耳輪型膜貫通ドメイン、そしてC末端に小胞体膜保持シグナルTKGHを持つ構造を示しています。ノーザンブロット解析では、ヒト成人組織におけるUSH3A転写産物の偏在発現が確認され、特に4.5kb、1.4kb、2.0kbの3つの転写産物が見られました。また、RT-PCR解析を用いて網膜での発現が検出され、USH3Aの発現はヒトリンパ芽細胞では見られないことが示されました。

Fieldsらの2002年の研究では、USH3A遺伝子が推定232アミノ酸のタンパク質をコードしており、その成熟型は3つの膜貫通ドメインと204残基を含むと予測されています。

Adatoらも2002年に、USH3A遺伝子にまたがる500kbのゲノム領域をアセンブルし、USH3A遺伝子の全長コード配列を決定しました。彼らはこの遺伝子が4つの膜貫通ドメインを持つ232アミノ酸のタンパク質、clarin-1をコードすると予想しました。Adatoらは、網膜、骨格筋、精巣、嗅上皮でUSH3Aの発現を検出しました。マウスの内耳では、発現はコルティ器官の内側と外側の有毛細胞と渦状神経節細胞に特異的であったことが示されました。

Vastinsaloらは2011年に、CLRN1クローンの塩基配列決定を通じて、エクソン0、2、3を含む232アミノ酸のタンパク質をコードする主要バリアントに加えて、10の代替スプライスバリアントを同定しました。これらのスプライスバリアントは、30から245アミノ酸のタンパク質をコードすると予測され、その多くが1から4個の膜貫通セグメントを持つことが示されました。いくつかのバリアントは早発停止コドンを含み、翻訳されない可能性があります。さらに、PCR分析では、主要なCLRN1バリアントの弱い発現がほとんどの組織で検出され、245アミノ酸タンパク質をコードするバリアントは、網膜、蝸牛、心臓、脳、胎盤、肺、骨格筋、膵臓、卵巣で検出されました。

これらの研究は、CLRN1遺伝子およびそのタンパク質産物clarin-1の構造と機能に関する重要な情報を提供しており、アッシャー症候群IIIA型の理解に寄与しています。これらの発見は、この遺伝性疾患の分子基盤の解明と将来的な治療法の開発に向けた基礎を築いています。

遺伝子の構造

CLRN1遺伝子に関する複数の研究が、その遺伝子構造とスプライスバリアントの理解を進展させてきました。これらの研究は、CLRN1遺伝子がどのように構造化されているか、そしてその構造がどのように機能に影響を与える可能性があるかについて、次第に詳細な情報を提供しています。

Joensuuら(2001): CLRN1遺伝子が4つのエクソンを含んでおり、約18kbのゲノムDNAにまたがっていることを明らかにしました。彼らはまた、87bpのエクソン1bを含むスプライスバリアント、いわゆるアイソフォームbも同定しました。

Fieldsら(2002): CLRN1遺伝子の構造に関するさらなる修正を提案し、新しい翻訳開始点、5′非翻訳領域、および232アミノ酸のタンパク質をコードする転写産物を示しました。彼らは、修正されたCLRN1 cDNAがエクソン1、エクソン1b、エクソン4を含まないことを指摘しました。

Adatoら(2002): より長い転写物を同定し、これが新たに同定されたエクソン0から始まり、エクソン2に続くものであり、エクソン3とエクソン4が介在するイントロンとともに転写されていることを発見しましたが、エクソン1とエクソン1bは含まれていませんでした。

Vastinsaloら(2011): CLRN1遺伝子が少なくとも8つのエクソン(エクソン0、0b、1、1b、2、2b、3a、3b)を持っていることを明らかにしました。エクソン3aと3bは、主要なスプライスバリアントでエクソン3を形成するために介在するイントロンとともに結合します。メインバリアントでは転写されないエクソン1の上流にはCpGアイランドが存在し、エクソン0、1、2、3の上流領域には転写因子結合部位が存在すると推定されます。また、偽遺伝子CLRN1OSがCLRN1遺伝子の反対鎖に位置し、5-prime UTRがCLRN1の5-prime UTRと重なり反対方向に走っています。

これらの研究は、CLRN1遺伝子が複雑なスプライスパターンと多様な転写産物を持つことを示しており、その遺伝子構造がどのようにしてその機能と疾患との関連に寄与しているかの理解に貢献しています。特に、異なるエクソンの組み合わせがどのように異なるタンパク質アイソフォームの産生につながるか、そしてこれらのアイソフォームが生物学的にどのように機能するかの理解は、遺伝性聴覚障害やその他の関連疾患の治療法の開発に重要な意味を持ちます。

マッピング

この段落では、CLRN1遺伝子の染色体上の位置(マッピング)と、その遺伝子に関連する研究成果について説明しています。マッピングとは、特定の遺伝子の物理的な位置を染色体上で特定する過程を指します。これは遺伝病の研究や遺伝子機能の理解に不可欠なステップです。

Joensuuら(2001): CLRN1遺伝子を染色体の3q21-q25領域に位置付けました。染色体上の「q」とは長腕を示し、「3q21-q25」は染色体3の長腕の21から25の領域に位置することを意味します。これにより、CLRN1遺伝子の精密な染色体上の位置が初めて特定されました。

Fieldsら(2002): さらに細かいマッピングを行い、CLRN1遺伝子の位置を3q25と特定しました。これはJoensuuらの研究をさらに精密化したもので、遺伝子の正確な位置をより詳細に特定しています。

マウスとラットのオルソログ: Fieldsらはまた、マウスではCLRN1遺伝子のオルソログ(進化的に相同な遺伝子)が第3染色体上に、ラットでは第2染色体上に存在することを明らかにしました。オルソログ遺伝子のマッピングは、異なる種間での遺伝子の保存された機能や進化的関係を理解するのに役立ちます。

ヒトのパラログ: さらに、ヒトではCLRN1遺伝子のパラログ(遺伝子重複により生じた機能的に類似した遺伝子)が4番と10番染色体に同定されました。パラログ遺伝子の特定は、遺伝子の機能的多様性や遺伝子ファミリーの進化を理解する上で重要です。

このような研究は、特定の遺伝子の物理的位置を明らかにすることで、遺伝子の機能、関連する疾患のメカニズム、そして種間での遺伝的相同性や多様性を理解するための基盤を提供します。CLRN1遺伝子は特に聴覚や視覚障害と関連しているため、これらの研究は治療法の開発に向けた重要なステップとなります。

遺伝子ファミリー

Adatoらによる2002年の研究は、クラリン遺伝子ファミリーに関する興味深い発見を提供します。この研究では、クラリン-1に加えて、クラリン-2とクラリン-3という2つの新たなヒトパラログが同定されました。以下に、この研究の主なポイントを要約します:

●クラリン遺伝子ファミリーの特徴
脊椎動物特有: クラリン遺伝子ファミリーは脊椎動物に限定されており、原核生物、酵母、植物、線虫、昆虫のゲノムではオルソログが見つかりませんでした。
共通の構造特徴: クラリンファミリーのメンバーは、4つの膜貫通ドメイン、保存された配列モチーフ、およびTM1とTM2の間の単一のグリコシル化コンセンサス部位を特徴とします。
種間での同定: 異なる生物種で合計14のクラリンが同定されています。
●クラリンの生物学的役割
スーパーファミリーの一部: クラリンは、4つの膜貫通ドメインを持つ小さな膜貫通型糖タンパク質の大きなスーパーファミリーに属しています。このスーパーファミリーには、聴覚障害に関与することが示されたコネキシンやクローディンも含まれています。
唯一の類似タンパク質: 3つのクラリンと有意な配列類似性を示す唯一のタンパク質は、細胞シナプスタンパク質であるstargazin(CACNG2遺伝子によってコードされる)でした。
●クラリンの機能的意義
クラリン-1のシナプスにおける役割: stargazinとの配列相同性を基に、Adatoらは有毛細胞(聴覚細胞)と視細胞のシナプスにおけるクラリン-1の潜在的な役割を示唆しました。これは、クラリンが聴覚や視覚に関連するシナプス機能において重要な役割を果たしている可能性があることを示しています。

この研究は、クラリン遺伝子ファミリーの理解を深め、特に聴覚や視覚の生理学的プロセスにおけるその役割についての新たな洞察を提供します。このような知見は、聴覚障害や視覚障害の治療法の開発において重要な意味を持つ可能性があります。

遺伝子の機能

アッシャー症候群は、聴覚障害、平衡感覚の障害、および視覚障害を特徴とする遺伝性疾患で、網膜色素変性症は夜盲、視野狭窄、そして最終的には視力喪失につながる進行性の眼疾患です。この遺伝子によってコードされるタンパク質は、内耳と網膜の発達およびその機能の維持に重要な役割を果たしています。

細胞膜および細胞間コミュニケーションの調節
クラリン1は細胞膜タンパク質であり、細胞間コミュニケーションにおいて重要な役割を果たしていると考えられています。特に、神経細胞間のシグナル伝達や、感覚器官である内耳と網膜の機能に必要な細胞間の相互作用に関与している可能性があります。

聴覚と視覚の機能維持
クラリン1は、内耳の有毛細胞や網膜の光感受性細胞である光受容細胞における正常な機能に不可欠です。これらの細胞はそれぞれ、音や光の信号を電気的な神経信号に変換し、脳に伝える役割を担っています。クラリン1の損失または機能不全は、これらのプロセスを妨げ、聴覚および視覚障害の原因となります。

神経細胞とシナプスの機能
クラリン1は、神経細胞間の接合部であるシナプスの形成や機能の調節にも関与していると考えられています。シナプスは、神経細胞間で情報が伝達される場所であり、この過程は聴覚や視覚の正常な機能に不可欠です。クラリン1の欠如や異常は、シナプスの発達や機能に影響を与え、感覚情報の処理に障害をもたらす可能性があります。

細胞質N末端: CLRN1遺伝子がコードするタンパク質のこの部分は細胞質に位置し、細胞内でのタンパク質の機能や相互作用に関与する可能性があります。
複数のらせん状膜貫通ドメイン: これらのドメインによりタンパク質は細胞膜を貫通し、細胞内外のシグナル伝達に関与することが示唆されます。
小胞体膜保持シグナルTKGH: このシグナルはタンパク質が小胞体膜に留まるために必要であり、細胞内での適切な局在と機能を保証します。
この遺伝子とタンパク質は、平衡感覚、視細胞の維持、音の知覚に重要であり、細胞運動やラメラポディウム集合体の正の制御にも関与しています。ラメラポディウム、微小管、細胞膜に存在することから、細胞の動きや形態の変化、細胞間のコミュニケーションにおいて中心的な役割を担っています。

CLRN1遺伝子内の変異は、IIIa型アッシャー症候群と関連しており、この症候群における聴覚、視覚、平衡感覚の障害の分子基盤を理解する上で重要です。さらに、この遺伝子は異なるアイソフォームをコードする複数の転写バリアントを持ち、これらのバリアントは疾患の発症や進行において異なる役割を果たす可能性があります。

CLRN1遺伝子とタンパク質の研究は、アッシャー症候群および網膜色素変性症のより良い理解と治療法の開発に貢献する可能性があります。

分子遺伝学

III型アッシャー症候群

分子遺伝学の研究は、III型アッシャー症候群(USH3A)の遺伝的基盤を解明する上で重要な役割を果たしています。USH3Aは、聴覚障害、進行性の視覚障害(網膜色素変性症)、場合によっては平衡感覚の問題を特徴とする遺伝性疾患です。以下は、USH3A遺伝子(CLRN1)の変異に関する主要な発見を時系列でまとめたものです。

Sankilaら(1995)とJoensuuら(1996)
フィンランドの2家族でUSH3A遺伝子の変異が報告されました。これらの初期の研究は、USH3Aに関する理解の基盤を築きました。
Gaspariniら(1998)
イタリアの1家族でUSH3A遺伝子の変異が同定され、遺伝子の地理的分布に関する理解を深めました。
Joensuuら(2001)
USH3A遺伝子の変異(606397.0001-606397.0003)を同定し、フィンランドおよびイタリアの家族における変異の存在を確認しました。
Fieldsら(2002)
USH3A遺伝子における4つの新規疾患原因変異を報告しました。特にN48K変異(606397.0004)はアシュケナージ・ユダヤ人集団において比較的多く見られました。
Adatoら(2002)
アッシャー症候群IIIA型の6家系11人に3つのUSH3A変異を検出しました。これらにはミスセンス変異(606397.0004)、ナンセンス変異(606397.0006)、23bpの欠失(606397.0007)が含まれ、これらの変異はクラリン-1を機能的に不活性にする可能性があります。
Allerら(2004)
スペインのアッシャー症候群患者におけるUSH3A遺伝子の変異をスクリーニングし、2家系で変異を確認しました。C40G変異(606397.0008)のホモ接合体である患者が1人同定されました。彼らは、スペインのアッシャー症候群家系におけるUSH3A遺伝子の変異は非常に限定的であることを示しました。

これらの研究は、USH3A遺伝子の変異がアッシャー症候群III型の発症に直接関連していることを示しています。さらに、特定の変異が特定の人口集団においてより一般的であることから、遺伝的背景と地理的分布の両方における疾患の異質性が示されました。これらの発見は、疾患の分子的診断、遺伝カウンセリング、および将来的には標的となる治療法の開発に貢献しています。

非症候性常染色体劣性網膜色素変性症61

Khanらによる2011年の研究は、非症候性常染色体劣性網膜色素変性症(RP61;614180)に焦点を当て、パキスタンの近親結婚が行われた2家系の患者において、CLRN1遺伝子にミスセンス変異(606397.0009-606397.0010)のホモ接合性があることを同定しました。ミスセンス変異とは、遺伝子の一塩基置換によって異なるアミノ酸がコードされる変異を指し、この場合、CLRN1遺伝子の特定の位置における変異が、膜貫通ドメイン内のアミノ酸の置換を引き起こしました。

この研究で注目されたのは、これらの変異が極性を保持していたことです。極性を持つアミノ酸は、その側鎖が電荷を持つか、または極性分子と相互作用する能力があるため、タンパク質の構造や機能に重要な影響を及ぼします。Khanらは、USH3(ウシャー症候群タイプ3)の患者においてより深刻な変化が検出されたことと比較し、これらのRP関連変異がhypomorphic mutation、つまり遺伝子の活性が減少したが完全には失われていない変異である可能性を示唆しました。

Hypomorphic mutationは、関連するタンパク質の機能が部分的にしか損なわれないため、症状の重篤度が完全に機能を失った場合に比べて軽度になることがあります。この研究から、RP61に関連するCLRN1遺伝子の変異が疾患の発症にどのように寄与しているか、そして変異がタンパク質の機能にどのように影響するかについての貴重な洞察が得られました。このような知見は、網膜色素変性症やUSH3などの疾患の理解を深め、将来的な治療法の開発に向けた基盤となります。

動物モデル

Gengらによる2009年の研究は、IIIA型アッシャー症候群の理解に大きく貢献した動物モデルの開発に関するものです。アッシャー症候群は、遺伝性の聴覚障害と進行性の視覚障害を特徴とする疾患であり、このマウスモデルは病態の解明と将来的な治療法の開発に重要な役割を果たすことが期待されます。以下に、この研究の主要な発見を要約します:

●Clrn1の発現と重要性
発現時期と場所: Clrn1遺伝子は、胚発生の16.5日目から、聴覚有毛細胞、前庭有毛細胞、および関連する神経節ニューロンで発現しています。この発現は、内毛細胞よりも外毛細胞でより高いことが示されました。
機能: Clrn1遺伝子は有毛細胞の機能維持と神経活性化に必須であることが示唆されています。
●Clrn1 -/- マウスの表現型
聴覚障害: Clrn1 -/- マウスは生後早期に難聴を発症し、その後急速に重度の聴覚障害へと進行します。生後14~21日目には聴性誘発脳幹反応(ABR)の閾値が上昇し、ピーク潜時とピーク間潜時が延長します。約70%のマウスは生後21日目にABRが検出不可能となり、生後30日目には完全に聴覚を失います。
前庭機能: Clrn1欠損による前庭機能の障害も観察され、蝸牛の機能障害を反映しているものの、より徐々に悪化します。
有毛細胞の変化: 外有毛細胞定位繊毛の乱れは生後2日目から観察され、生後21日目には外有毛細胞の消失が確認されました。
●結論
Clrn1の重要性: この研究は、Clrn1遺伝子が聴覚有毛細胞および前庭有毛細胞の正常な機能にとって必要不可欠であることを強調しています。特に、聴覚と前庭系の健康におけるその役割は、IIIA型アッシャー症候群の患者における聴覚障害とバランス障害の理解に寄与します。
この研究によって開発されたClrn1 -/- マウスモデルは、アッシャー症候群の病態メカニズムの解明に加え、将来的な治療法の評価において貴重なツールとなります。

アレリックバリアント

アレリック・バリアント(10例):ClinVar はこちら

.0001 IIIA型アッシャー症候群
clrn1, tyr176ter
Fieldsら(2002)は、Joensuuら(2001)によって300C-T(TYR100TER)と同定されたUSH3A遺伝子のエクソン3におけるFin(major)USH3A突然変異は、tyr176からterへの置換をもたらす528T-Gと呼ばれるべきであることを示した。Joensuuら(2001)は、アッシャー症候群IIIA型(USH3A; 276902)を持つフィンランド人家族でこの変異のホモ接合性を同定し、さらに52人のフィンランド人患者でこの変異を発見した。Fieldsら(2002)は、フィンランド人および他の北ヨーロッパの祖先を持つ罹患者の28の変異対立遺伝子のうち11にこの変異を見出した。

.0002 IIIA型アッシャー症候群
clrn1, met120lys
アッシャー症候群IIIA型(USH3A; 276902)の2家系4人のフィンランド人患者において、Joensuuら(2001)はFin(major)変異(606397.0001)とmet120-lys(M120K)置換をもたらすT-to-A転位のヘテロ接合を同定した。Joensuuら(2001)は、Fin(minor)と命名されたこの突然変異を131T-A (MET44LYS)と呼んでいたが、Fieldsら(2002)は、この突然変異は359T-A (M120K)と呼ぶべきであると示した。この変異はUSH3A遺伝子のエクソン1に生じた。

.0003 IIIA型アッシャー症候群
clrn1, 3-bp del, 459att
アッシャー症候群IIIA型(USH3A; 276902)を持つイタリアの近親家族において、Joensuuら(2001)はUSH3A遺伝子のエクソン3に3-bpの欠失を同定し、その結果1個のメチオニンがイソロイシンとロイシンに置換された。Fieldsら(2002)は、Joensuuら(2001)が231-233delATTと呼んだこの突然変異は、459-461delATTと呼ぶべきであることを示した。

.0004 IIIA型アッシャー症候群
clrn1, asn48lys
Fieldsら(2002)がアッシャー症候群IIIA型(USH3A; 276902)患者において検出したUSH3A遺伝子の合計28個の変異対立遺伝子のうち、11個はエクソン1の144T-Gトランスバージョンによるasn48からlys(N48K)へのミスセンス変異を有していた。この変異はアシュケナージ・ユダヤ人患者にのみ認められ、leu150-to-pro変異(L150P; 606397.0005)との複合ヘテロ接合体であった1人を除いて、すべてホモ接合体であった。

Adatoら(2002)は、東ヨーロッパ系ユダヤ人の血縁関係のない4家族から6人の罹患者にN48Kミスセンス変異を検出した。5人はホモ接合体であったが、1人は1つの対立遺伝子にのみ変異があり、2番目のUSH3A変異は検出されなかった。キャリア染色体上のマイクロサテライトSNPハプロタイプの共有から、この突然変異の創始者効果の存在が示唆された。

アッシャー症候群のアシュケナージ・ユダヤ人患者40人のコホートにおいて、Nessら(2003)は、臨床的にアッシャー症候群III型と分類された16人(40%)がN48K変異のホモ接合体であることを発見した。ニューヨーク地域のアシュケナージ・ユダヤ人におけるN48Kの保因者頻度は0.7%(95%CI = 0.0-1.6%)であり、アッシャー症候群III型の有病率は10万人あたり1.2人と予測された。このグループにおけるアッシャー症候群III型の遺伝的均質性にもかかわらず、N48Kホモ接合体によって示された表現型の重症度には幅があった。聴覚表現型の発症年齢は幼児期から35歳以上まで様々であった。56歳の女性では、眼球の表現型は幼児期に発症し、有用な視力は得られなかったが、難聴は35歳以降に始まり、中等度から重度に進行した。

.0005 IIIA型アッシャー症候群
clrn1, leu150pro
Fieldsら(2002)は、米国在住のIIIA型アッシャー症候群(USH3A; 276902)のアシュケナージ・ユダヤ人患者において、CLRN1遺伝子の一般的なユダヤ人の突然変異asn48からlys(N48K; 606397.0004)が複合ヘテロ接合状態でエクソン3の449T-C転移と組み合わされ、leu150からpro(L150P)への突然変異を生じていることを発見した。

.0006 IIIA型アッシャー症候群
clrn1, tyr63ter
スペインの非血縁者家族に由来するIIIA型アッシャー症候群(USH3A; 276902)の3兄妹において、Adatoら(2002)はCLRN1遺伝子の189C-A置換を検出し、これはtyr63-to-ter(Y63X)ホモ接合性ナンセンス突然変異を引き起こすと予想された。

Allerら(2004)は、Adatoら(2002)が報告したY63X変異を持つ家系は、聴覚障害が深く安定していることから、臨床的にはアッシャー症候群I型と診断できると述べている。Allerら(2004)は、進行性難聴はアッシャー症候群III型とアッシャー症候群I型およびII型を鑑別する決定的なパラメータではないと考えた。

.0007 IIIA型アッシャー症候群
Clrn1、23bpのdel、nt187
イエメナイト系ユダヤ人の非血族に由来するアッシャー症候群IIIA型(USH3A; 276902)の2人の兄弟において、Adatoら(2002)はホモ接合状態でCLRN1遺伝子の23-bp欠失を検出した。この欠失は最初のメチオニンコドンの下流187-209ヌクレオチドにまたがり、アミノ酸63でフレームシフトを起こし、25アミノ酸後に停止コドンを起こすと予測された。

.0008 IIIA型アッシャー症候群
clrn1, cys40gly
アッシャー症候群IIIA型(USH3A; 276902)の患者において、Allerら(2004)はCLRN1遺伝子の118T-Gのホモ接合性を同定し、cys40-to-gly(C40G)変異をもたらした。両親と罹患していない姉妹はこの突然変異に対してヘテロ接合体であった。

.0009 網膜色素変性症 61
clrn1, leu154trp
非症候性網膜色素変性症(RP61; 614180)を有するパキスタンの血縁家族の罹患者において、Khanら(2011)は、CLRN1遺伝子のエクソン3における461T-Gのホモ接合性を同定し、その結果、膜貫通ドメインのleu154-trp(L154W)置換が生じた。細胞内局在研究では、野生型タンパク質が主に細胞膜に存在するのに対し、変異型タンパク質は小胞体に留まっていることが示された。この変異は、血縁関係のないパキスタン人の網膜色素変性症患者81人および民族的に一致した対照者90人には認められなかった。

.0010 網膜色素変性症 61
clrn1, pro31leu
非症候性網膜色素変性症(RP61; 614180)のパキスタンの血縁家族の罹患者において、Khanら(2011)は、CLRN1遺伝子のエクソン1における92C-T転移のホモ接合性を同定し、その結果、膜貫通ドメインにおいてpro31からleu(P31L)への置換が生じた。細胞内局在研究では、野生型タンパク質が主に細胞膜に存在するのに対し、変異型タンパク質は小胞体に留まっていることが示された。この変異は、血縁関係のないパキスタン人のRP患者81人および民族的に一致した対照者90人には認められなかった。

参考文献

プロフィール

この記事の筆者:仲田洋美(医師)

ミネルバクリニック院長・仲田洋美は、日本内科学会内科専門医、日本臨床腫瘍学会がん薬物療法専門医 、日本人類遺伝学会臨床遺伝専門医として従事し、患者様の心に寄り添った診療を心がけています。

仲田洋美のプロフィールはこちら

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