CHD7

CHD7_HUMAN
FLJ20357
FLJ20361
IS3
KIAA1416
●Previous symbols
CRG
●Previous names
CHARGE association
●Alias symbols
KIAA1416
FLJ20357
FLJ20361

CHD7は、クロマチンリモデリングと遺伝子発現調節に関与するタンパク質であり、特に核小体のエンハンサーエレメントに結合することで転写制御因子として機能します。核小体は、細胞核内に存在する構造で、リボソームRNA（rRNA）の生合成が行われる場所です。CHD7がエンハンサーエレメントに結合することにより、特定の遺伝子の転写が促進され、これによりリボソームの構成要素となるrRNAの合成が活性化されます。

Zentnerらによる2010年の研究要約によれば、CHD7は核小体におけるrRNA生合成のポジティブレギュレーターとしての役割も果たしています。これは、CHD7が核小体内でのrRNAの合成を促進し、細胞のタンパク質合成能力を支えるリボソームの生産を増加させることを意味します。このようにして、CHD7は細胞の成長や分裂、さらには正常な発達プロセスにおける重要な役割を担っているのです。

CHD7の機能不全は、チャージ症候群などの遺伝性疾患と関連があります。この症候群は、顔面の特徴、聴覚障害、心臓の異常など、さまざまな臨床的特徴を示します。CHD7の遺伝子変異が原因であり、この変異によりCHD7の正常な機能が妨げられ、遺伝子発現の調節異常が引き起こされると考えられています。このため、CHD7は遺伝子発現の調節だけでなく、特定の遺伝性疾患の理解においても重要なターゲットとなっています。

CHD7遺伝子はクロモドメインヘリカーゼDNA結合蛋白質7をコードしており、このタンパク質は身体の多くの部分、特に眼球、内耳、脳において重要な役割を果たしています。脳内では、特に嗅球という神経細胞の束がある領域で活性を示し、これは匂いの知覚に必須です。

CHD7タンパク質はクロマチンリモデリングに関与するタンパク質ファミリーの一員であり、クロマチンの構造を変更することによって遺伝子の発現を制御します。クロマチンはDNAとタンパク質の複合体であり、DNAを染色体にパッケージ化しています。クロマチンリモデリングは、クロマチンの密度を変更することによって、特定の遺伝子領域へのアクセスを容易にするか、または制限する過程です。DNAが密にパッキングされている場合、遺伝子の発現は抑制されますが、DNAが緩くパッキングされている場合は遺伝子の発現が促進されます。

研究者たちは、CHD7タンパク質が具体的にどの遺伝子の発現を制御しているのか、そしてそのメカニズムを解明するための研究を進めています。この過程の理解は、CHD7タンパク質の機能やその関連疾患、特にCHARGE症候群と呼ばれる遺伝性障害の理解に寄与します。CHARGE症候群は、CHD7遺伝子の変異によって引き起こされ、多様な臨床的特徴を持つ複雑な状態です。この研究は、CHARGE症候群の診断、治療、および管理において重要な意味を持ちます。

CHARGE syndrome　　CHARGE症候群 214800 AD　 3

Hypogonadotropic hypogonadism 5 with or without anosmia 　中枢性性腺機能低下症5（低ゴナドトロピン性性腺機能低下症5）±嗅覚障害　612370 AD　 3

Nagaseら（2000年）による研究は、CHD7遺伝子のクローニングとその発現パターンに関する初期の研究の一つです。彼らは成人の脳cDNAライブラリーからCHD7をクローニングし、この遺伝子が1,967アミノ酸から成る推定タンパク質をコードしていることを明らかにしました。RT-PCR ELISAの結果から、CHD7はすべての調べた組織と脳の特定領域で中程度から低発現が検出され、特に脳、腎臓、骨格筋で高発現が見られました。

Sanlavilleら（2006年）は、in situハイブリダイゼーションを用いて、正常ヒト胚および選択的妊娠終了後に得られた胎児組織におけるCHD7遺伝子の発現パターンを詳細に分析しました。彼らの研究では、CHD7が未分化神経上皮および神経堤由来の間充織に広く発現しており、後根神経節、脳神経および神経節、聴覚、下垂体、鼻の組織、神経網膜において特に発現していることが示されました。これらの発見は、CHD7の発現パターンがCHARGE症候群で観察される発育異常と良好な相関を示していることを示し、CHD7の機能的重要性を強調しています。

Zentnerら（2010年）は、DLD1ヒト大腸がん細胞を用いた研究において、CHD7が核小体と核形質の両方に局在することを発見しました。この発見は、CHD7が細胞核内で複数の機能を持つことを示唆しており、クロマチンリモデリングおよび遺伝子発現調節におけるその役割に関する理解を深めるものです。

これらの研究は、CHD7遺伝子の重要性と多様な機能を示しており、特に発達過程および神経系の発達におけるその役割を強調しています。また、CHD7の異常がCHARGE症候群などの発達障害の原因となることを示しており、これらの疾患の理解と治療法の開発に寄与しています。

Vissersらによる2004年の研究では、CHD7遺伝子が38エキソンから構成され、そのゲノムサイズが188kbであることが明らかにされました。

Nagaseら（2000年）による放射線ハイブリッド解析は、CHD7遺伝子を8番染色体にマッピングしました。この手法は、染色体上の遺伝子の正確な位置を特定するために使用されるもので、遺伝子の物理的な位置情報を提供します。この情報は、遺伝子の機能解析、遺伝病の原因遺伝子の同定、および遺伝子間の相互作用の研究に非常に重要です。

CHD7遺伝子が8番染色体に位置しているという知見は、この遺伝子が関与する疾患、特にCHARGE症候群の遺伝的背景を理解する上で貴重な情報を提供します。CHARGE症候群は、複数の器官に影響を与える複雑な発達障害であり、CHD7遺伝子の変異が主な原因とされています。この遺伝子の正確な染色体位置を知ることで、研究者はCHD7関連の疾患メカニズムの解明や新たな治療法の開発に向けた基礎を築くことができます。

また、8番染色体上にマッピングされた他の遺伝子との関係や相互作用も研究することが可能になり、遺伝子ネットワークやシグナル伝達経路におけるCHD7の役割についての理解を深めることができます。これは、CHD7だけでなく、関連する他の遺伝子や経路にも影響を及ぼす可能性があり、遺伝学および分子生物学の分野におけるさらなる研究に道を開くものです。

CHD7遺伝子は、ATP加水分解活性、ATP依存性クロマチンリモデラー活性、およびクロマチン結合活性を持つタンパク質をコードしています。これらの活性により、CHD7はクロマチンの構造を変化させ、遺伝子のアクセシビリティと転写を調節することができます。CHD7は、顔の発達、神経系の発達、成長ホルモン分泌の制御など、多様な生物学的プロセスに関与しています。このタンパク質は核小体および核形質に存在し、細胞の基本的な機能を支える重要な役割を担っています。

CHD7の機能は、CHARGE症候群や低ゴナドトロピン性性腺機能低下症5などの疾患と密接に関連しています。CHARGE症候群は、顔面の奇形、聴覚障害、心臓病、成長遅延など、多岐にわたる症状を特徴とする複雑な疾患です。CHD7遺伝子の変異は、CHARGE症候群患者の一部で確認されており、この症候群の発生における重要な要因の一つとされています。

CHD7遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする複数の転写産物変異体が存在します。これらのアイソフォームの多様性により、CHD7タンパク質はさまざまな細胞タイプや発達段階で特有の機能を果たすことができると考えられています。この遺伝子の研究は、特定の疾患の分子メカニズムの解明に寄与するだけでなく、クロマチンリモデリングと遺伝子調節の基本的な理解を深めることにも貢献しています。

以下の研究は、遺伝子CHD7とその機能に関する重要な洞察を提供しています。

Bajpaiら（2010年）: CHD7が多能性移動性神経堤の形成に必須であり、CHD7が神経堤転写回路の活性化に関与していることを示しました。神経堤は外胚葉由来であり、頭蓋顔面の骨や軟骨、末梢神経系、色素形成、心臓構造の発達に重要です。この研究は、CHD7が遺伝子発現プログラムの制御において中心的な役割を果たし、CHARGE症候群の発生に関連していることを明らかにしました。

Zentnerら（2010年）: CHD7が活性型rDNAと特異的に結合し、rDNAプロモーターのメチル化と45S pre-rRNAのレベルに影響を与えることを発見しました。これは、CHD7が核内遺伝子と核遺伝子の両方のポジティブレギュレーターとして機能することを示しています。

Engelenら（2011年）: Sox2とCHD7が相互作用し、遺伝子活性化に協力していることを示しました。これは、Chd7がSox2の重要な補因子であることを示唆しています。

Batsukhら（2010年）: CHD7とCHD8の間の相互作用を同定し、CHD7のミスセンス変異がこの相互作用を破壊することがあることを発見しました。これは、CHD7とCHD8の相互作用がCHARGE症候群の疾患メカニズムに関連している可能性があることを示唆しています。

Van Nostrandら（2014年）: p53とCHD7の関係を探り、CHD7がp53の発現を負に制御し、CHD7欠損がp53の活性化を引き起こすことを発見しました。これは、不適切なp53の活性化がCHARGE症候群の発生に寄与する可能性があることを示しています。

これらの研究は、CHD7が発達過程で多岐にわたる機能を持ち、特に神経堤の発達、染色体リモデリング、遺伝子の転写調節、そして特定の疾患の発生において重要な役割を果たしていることを明らかにしています。

CHARGE症候群

CHARGE症候群は、複数の先天性異常を特徴とする複雑な病態であり、その原因は主にCHD7遺伝子の変異によるものです。CHD7遺伝子は、クロマチンリモデリングに関与する重要なタンパク質をコードしており、この遺伝子の変異はCHARGE症候群の発症に直接関連しています。

Vissersら（2004）は、CHARGE症候群の患者2人において、8q12上に2.3 MBのde novo重複微小欠失を同定しました。さらに、微小欠失のないCHARGE症候群患者17人のうち10人においてCHD7遺伝子の変異が確認され、この変異が疾患の主要な原因であることを示しました。

Lalaniら（2006）は、CHARGE症候群の臨床診断を受けた110人の患者におけるCHD7遺伝子の解析を行い、64人（58%）に変異があることを発見しました。これらの変異は主にタンパク質の早期終了を引き起こすものであり、ハプロ不全につながる可能性があります。

Jongmansら（2006）による研究では、CHARGE症候群を示唆する臨床的特徴を有する患者107人のうち69人（65%）にCHD7遺伝子の変異が見つかりましたが、遺伝子型と表現型の相関は明確ではなく、同じ変異を持つ兄弟姉妹間でも臨床像に差があることが報告されました。

これらの研究は、CHD7遺伝子の変異がCHARGE症候群の発症に重要な役割を果たしていることを示しています。また、CHD7変異は、無嗅覚を伴うか伴わない性腺機能低下症5（HH5; 612370）の患者においても同定されており、これらの病態がCHARGE症候群の軽度の対立遺伝子変異である可能性が示唆されています。

さらに、特発性側弯症（IS3, 608765）への感受性とCHD7遺伝子の変異との関連性も示唆されており、CHD7遺伝子の変異が広範な臨床的表現型に影響を及ぼす可能性があります。これらの研究成果は、CHD7遺伝子の変異に関する理解を深め、CHARGE症候群および関連疾患の診断と治療において重要な情報を提供しています。

小細胞肺癌感受性との関連性の可能性

Pleasanceらによる2010年の研究は、小細胞肺癌（SCLC）におけるタバコ喫煙の影響と遺伝子変異の関連性を明らかにしました。この研究では、小細胞肺癌細胞株NCI-H209のゲノム塩基配列を解析し、タバコの煙によって引き起こされる遺伝的変異のパターンを調査しました。合計で22,910個の体細胞置換が同定され、その中の134個がコードエクソン領域に位置していました。これらの変異は、タバコの煙に含まれる多様な発癌物質が特定の塩基配列に及ぼす影響を示しており、転写連鎖修復や一般的な発現連鎖修復経路に対する影響も明らかにしました。

この研究の特筆すべき点は、CHD7遺伝子のエクソン3から8までの範囲でのタンデム重複と、PVT1-CHD7融合遺伝子を持つ2つの細胞系統の同定です。CHD7遺伝子は、先に述べたように、DNAの損傷修復やクロマチンリモデリングに関与する重要なタンパク質をコードしており、その変異や構造的変化は細胞の遺伝子発現パターンに大きな影響を及ぼす可能性があります。PVT1遺伝子は、がんの発生に関連する非コーディングRNAをコードしており、CHD7との融合によって、がん細胞の成長や生存に必要な新しい遺伝子発現パターンが生み出される可能性があります。

これらの発見は、小細胞肺癌の感受性や進行における遺伝的要因の理解を深め、特にタバコ喫煙による遺伝子レベルでの影響を解明する上で重要な意味を持ちます。また、CHD7やPVT1のような遺伝子が関与する分子メカニズムの解明は、小細胞肺癌の診断や治療戦略の開発に寄与する可能性があります。

口唇／口蓋裂との関連の可能性

Felixら（2006年）の研究では、CHARGE症候群に関連するCHD7遺伝子の変異が孤立性口唇裂/口蓋裂（非症候性）との関連について調査されました。9例のCHARGE症例においてCHD7のコード領域を解析し、5つの変異を同定したものの、非症候性口唇裂/口蓋裂の症例では有意な変異は見つかりませんでした。また、アイオワおよびフィリピンの集団における非症候性口唇裂/口蓋裂の症例-両親三人組878人を対象としたCHD7遺伝子の3つのSNPの関連解析でも、有意な過剰伝達は認められませんでした。

これらの結果から、FelixらはCHD7の変異が孤立性口唇裂/口蓋裂に一般的ではなく、CHD7が非症候性口唇裂/口蓋裂の修飾因子として働くという証拠は最小限であると結論づけました。この研究は、CHD7遺伝子と孤立性口唇裂/口蓋裂との間に直接的な関連がないことを示唆していますが、CHARGE症候群とその遺伝子的要因の理解には貢献しています。

確認待ちの関連

D’Alessandroらの2016年の研究は、房室中隔欠損症（AVSD）を有する患者における遺伝的変異の解析を通じて、この心臓疾患と関連する遺伝子の濃縮について明らかにしました。全エクソームシークエンシングにより、AVSDと強く関連する112遺伝子のセットが同定され、これらの遺伝子におけるまれなバリアントおよび損傷バリアントが、対照群と比較して有意に濃縮されていることが示されました。特に、ファロー四徴症を伴わないAVSD患者では、これらのバリアントの濃縮がより顕著であることが見出されました。

この研究では、症候群関連遺伝子であるCHD7を含む6つの遺伝子が希少変異で濃縮されていることが特に注目されます。AVSD患者の約11.1%がCHD7遺伝子に非同義の希少変異を持っていたことが示され、これは対照群の5.0%と比較して有意に高い割合です。これらのミスセンス変異は新規または極めてまれであり、全てが保存されており、損傷を与えると予測されました。

D’Alessandroらは、症候群関連遺伝子を含むAVSDに関連する遺伝子の変異が、孤立性心疾患を有する患者においてもAVSDの発症に寄与する可能性があると結論づけました。この発見は、AVSDの遺伝的背景とその複雑性に新たな光を当て、特にCHD7遺伝子の変異が心臓疾患の発症にどのように関与しているかについての理解を深めるものです。また、この研究は、心臓発生および心臓疾患の分子メカニズムに関するさらなる研究の基盤を提供し、AVSDを含む心臓疾患の診断、治療、および予防戦略の開発に貢献する可能性があります。

アレリック・バリアント（17の選択例）：Clinvarはこちら

.0001チャージ症候群
CHD7, ILE1028VAL
CHARGE症候群(214800)の女性患者において、Vissersら(2004)はCHD7遺伝子のエクソン12にヘテロ接合性の3082A-G転移があり、その結果ile1028-to-val(I1028V)変異が生じたことを報告した。この患者にはコロボーマ、成長発育遅延、三半規管形成不全がみられた。変異はde novoであった。

.0002 チャージ症候群
CHD7, LEU1257ARG
CHARGE症候群(214800)の女性患者において、Vissersら(2004)は、leu1257-to-arg(L1257R)変異を引き起こしたCHD7遺伝子のエクソン15におけるヘテロ接合性の3770T-G転座を報告した。この患者には、コロボーマ、成長発育遅延、生殖器低形成、難聴を含む耳の異常、三半規管無力症がみられた。これはde novo突然変異であることが示された。

.0003 チャージ症候群
CHD7, TYR1806TER
CHARGE症候群(214800)の女性患者において、Vissersら(2004)はCHD7遺伝子のエクソン26に5418C-G転座によるヘテロ接合性のde novo変異、tyr1806-to-ter(Y1806X)を発見した。この患者には心臓奇形と咽頭閉鎖症、成長発育遅延、生殖器低形成、耳の異常がみられたが、コロボーマや口唇口蓋裂はみられなかった。

.0004 チャージ症候群
CHD7, IVS26AS, G-A, -7
CHARGE症候群(214800)の男性患者において、Vissersら(2004)はCHD7遺伝子にde novo heterozygous splice site mutation、IVS26-7G-Aを発見した。この患者には、コロボーマ、心臓奇形、成長発育遅延、生殖器低形成、耳の異常、口唇口蓋裂がみられたが、咽頭閉鎖症はみられなかった。

.0005 チャージ症候群
CHD7, TRP2332TER
CHARGE症候群(214800)の軽症女児において、Lalaniら(2006)はCHD7遺伝子のエクソン33にtrp2332-to-stop(W2332X)変異を発見した。この子供にはCHARGEの合併症で生後6ヵ月で死亡した兄がおり、兄の組織サンプルは入手できなかった。両親は罹患していなかった。両親の生殖細胞系列モザイクが疑われた。

.0006 チャージ症候群
CHD7, ARG2319SER
Lalaniら（2006）は、母娘が軽度のCHARGE症候群（214800）を有し、CHD7遺伝子のエクソン33にarg2319-to-ser（R2319S）変異を有する家族を報告した。

.0007 チャージ症候群
CHD7, GLU1271TER
Lalaniら(2006)は、CHD7遺伝子のエクソン16にglu1271-to-stop(E1271X)変異を持つCHARGE症候群(214800)の一卵性双生児の例を報告している。

.0008 チャージ症候群
CHD7, 1-bp ins, 5752a
一卵性双生児の姉妹において、Jongmansら（2006）はCHD7遺伝子のエクソン29に1-bpの挿入（5752dupA）を同定し、thr1918でフレームシフトを起こすと予測した。兄弟姉妹の1人は、左心低形成症候群と両側咽頭閉鎖症を併発し、生後29時間後に死亡した。彼女には気管食道瘻と典型的なCHARGE耳もあったが、コロボーマはなかった。気管食道瘻と典型的なCHARGE耳もあったが、コロボーマはなかった。もう1人の兄姉は12歳の時に検査されたが、その時、彼女は年齢より4歳遅れており、低身長と不安定な歩行を指摘された。彼女は生まれつき大きな動脈管開存があり、手術が必要で、両側の峡部閉鎖を矯正するために何度も手術が必要であった。6歳まで胃瘻があった。重度の両側難聴、異常外耳、両側脈絡膜コロボーマがあった。

0.0009再分類-意義不明の変異型
CHD7、A-G（rs4738824）
このバリアントは、以前はSCOLIOSIS, IDIOPATHIC, SUSCEPTIBILITY TO, 3と題されていたが、Tilleyら（2013）の知見に基づいて再分類された。

特発性側弯症（IS3, 608765を参照）の感受性の基礎となる遺伝子を探索するために、Gaoら（2007）は52家族のコホートを確認し、ゲノムワイドスキャンによる研究を実施し、8q12遺伝子座との関連で連鎖の証拠を得た（multipoint lod = 2.77; p = 0.0028）。この領域でさらにマッピングを行ったところ、多発性発達異常のCHARGE症候群に関連するCHD7遺伝子のエクソン2から4を中心とする疾患関連ハプロタイプの有意な証拠が示された。特発性側弯症の発端者25名（IS3, 608765参照）と親44名において、Gaoら（2007）は、CHD7遺伝子のイントロン2におけるAからGへの一塩基多型であるSNP rs4738824を同定し、これは馬尾型（cdx）転写因子結合部位を破壊すると予測された。このSNPのAヌクレオチドは脊椎動物9種にわたって完全に保存されているようである。この研究の残りの27家族において、Gaoら（2007）は、尾状型（cdx）転写因子結合部位を破壊すると予測されるG対立遺伝子が、罹患した子孫に有意に過剰伝達されることを発見した（p = 0.005）。

Tilleyら（2013）は、家族性特発性側弯症を有するヨーロッパ系の244家族において、CHD7遺伝子の22の一塩基多型について、モデルに依存しない連鎖解析と関連性の検定を行った。連鎖解析の結果、わずかに有意な結果が3つ同定された。しかし、それらの結果はCHD7遺伝子との関連性の検定では有意ではなかった（pは0.01未満）。さらに、彼らのサンプルとGaoら(2007)のサンプルの関連性検定結果のメタアナリシスでも有意な結果（pは0.01未満）は得られなかった。

.0010 チャージ症候群
CHD7, エクソン8-12の欠損
Udakaら(2007)は、CHARGE症候群(214800)の13歳の日本人女児において、CHD7遺伝子のデノボヘテロ接合性10.4kbの欠失を同定した。この欠失は、エクソン8から12を包含し、イントロン7と12にブレークポイントがあり、機能的に重要なクロモ、SNF2、ヘリカーゼドメインを欠く切断型タンパク質を引き起こすと予測された。著者らは、CHD7のエクソン欠失が証明された最初のCHARGE患者であると述べている。

.0011 チャージ症候群
CHD7, Gly2108ARG
CHARGE症候群(214800)の軽症型である血縁関係のない2家系の罹患者において、Jongmansら(2008)はCHD7遺伝子のエクソン31にヘテロ接合性の6322G-A転移を同定し、その結果、gly2108からarg(G2108R)への置換が生じた。両家とも親から子への遺伝がみられ、常染色体優性遺伝と一致した。1家系では、母親は異形耳、右側難聴、低形成三半規管、正常な認知発達のみであったが、娘には耳の異常、片側難聴、肺動脈狭窄、右側二腎系がみられた。2番目の家族では、母親は片耳の構造異常が軽度であったが、息子は2人とも他の臓器の病変を伴うより重篤な特徴を示した。Jongmansら(2008)は、家族内の表現型が多様であることを指摘し、G2108R変異は正常な生殖能力を有する比較的軽度の表現型を与える、と結論している。

.0012 チャージ症候群
低ゴナドトロピン性性腺機能低下症5、無嗅覚症を伴わない。
CHD7, SER834PHE
Delahayeら(2007)は、非血縁のフランス人の両親から生まれた2人の兄弟（1人は非典型的、もう1人は典型的なCHARGE症候群(214800)）において、CHD7遺伝子のエクソン8における2501C-T転移のヘテロ接合性を同定し、その結果、高度に保存された残基におけるser834-to-phe(S834F)置換を同定した。この変異は母親にも認められ、母親は子供たちの異常が確認された後に調査され、その後非定型CHARGE症候群と診断された。この変異は、罹患していない家族4人、あるいは他の患者や両親の染色体300本では発見されなかった。

正常性低ゴナドトロピン性性腺機能低下症(HH5; 612370)、口唇裂、停留睾丸の男性患者において、Kimら(2008)はCHD7遺伝子のDNA結合クロモドメイン1におけるS834F変異のヘテロ接合を同定した。他に罹患した家族や親戚はいなかった。180人の対照群ではこの変異は認められなかった。

.0013 チャージ症候群
無嗅覚を伴う低ゴナドトロピン性性性腺機能低下症5、以下を含む
CHD7, IVS6, G-C, +5
CHARGE症候群(214800)の「比較的軽症」の2人の兄弟において、Jongmansら(2008)はCHD7遺伝子のIVS6におけるスプライス部位の転座(2442+5G-C)のヘテロ接合を同定した。この男児はそれぞれ7歳と4歳で、軽度の精神発達障害、小陰茎、両側停留睾丸を有し、母親によると嗅覚はなかった。2人とも平衡感覚障害の既往があり、自閉スペクトラム症の検査では陽性であった。年長の男児は重度の両側難聴、年少の男児は右側が高度、左側が軽度の難聴で、両側口唇口蓋裂もあった。母親には変異は見られず、父親は解析不能であった。ハプロタイピングの結果、変異は父親の対立遺伝子に生じたことが示された。両親ともにCHARGE症候群の臨床的特徴はなかった。この変異は600の健常対照対立遺伝子には認められなかった。

軽度の感音性難聴と口唇口蓋裂を有するKallmann症候群(HH5; 612370)のトルコ人女性において、Kimら(2008)はCHD7遺伝子のde novo IVS6+5G-C転座を同定した。RT-PCR解析の結果、この変異はCHD7のクロモドメイン1の66アミノ酸のうち22アミノ酸がインフレームで欠失したもので、進化的に保存された領域であり、ヒストンの尾部と相互作用することが知られている。この変異はトルコ人96人および他の180人の対照群では認められなかった。

.0014 無嗅覚症を伴わない性腺刺激ホルモン分泌不全性性腺機能低下症5
CHD7, IVS8, G-A, +5
正常血性腺刺激ホルモン分泌不全性性腺機能低下症(HH5; 612370)で他の異常のないトルコ人男性において、Kimら(2008)はCHD7遺伝子のスプライス部位転移(IVS8+5G-A)のヘテロ接合を同定し、その結果エクソン8がスキップされ、フレームシフトとそれに続く849残基での早期終止コドンを引き起こした。C末端の70％以上が切断され、第一クロモドメインの約半分と第二クロモドメインのすべてが含まれ、タンパク質は機能しなくなると予測された。他に罹患した家族や親戚はいなかった。96人のトルコ人対照者、180人の他の対照者にも変異は認められなかった。

.0015 無嗅覚を伴う性腺刺激性性腺機能低下症5
CHD7, HIS55ARG
Kallmann症候群(HH5; 612370)で他の異常のない男性患者において、Kimら(2008)はCDH7遺伝子のエクソン2に164A-G転移を同定し、高度に保存された残基でhis55からarg(H55R)への置換をもたらした。他に罹患した家族や親戚はいなかった。この変異は180人の対照群では認められなかった。

.0016 チャージ症候群
CHD7, 1-BP INS, 8682T
CHARGE 症候群(214800)で右側単指症の11ヶ月の男児において、Van de Laar ら(2007)は、CHD7 遺伝子のエクソン38に1-bpの挿入(8682insT)のヘテロ接合性を同定した。右側単指症は尺骨低形成を伴い、小さくて四角い耳介低位、左停留睾丸、小陰茎、二重出口右心室、大出口心室中隔欠損、形成不全三尖弁、肺動脈狭窄、心房中隔欠損II型からなる先天性心奇形を有していた。重度の両側難聴が生後1週間で発見され、脳スキャンで両側三半規管の欠如、左前庭頭蓋神経の低形成、右咽頭閉鎖症、小さな粘膜下口蓋裂が認められた。運動発達は遅れており、生後11ヵ月で支えがないと座ることができなかった。

.0017 チャージ症候群
CHD7, GLN1599TER
フィンランドのCHARGE症候群(214800)の家族3人において、Vuorelaら(2008)は、CHD7遺伝子のエクソン21に4795C-T転移を同定し、gln1599からterへの置換(Q1599X)をもたらした。発端者である男性乳児と2回目の妊娠で生まれた男性胎児は、CHARGE症候群に一致する他の特徴に加えて、嗅球が欠如していた。生後3ヵ月で死亡した男性乳児は、右側の小葉が著しく左右対称で胆嚢が正中線上にあり、肝外胆管閉塞と腸の著しい低位症を伴う肝臓の著明な異形性も有していた。末梢血リンパ球と頬細胞に変異が認められた父親は、左側伝導性難聴、形成不全のカップ状右外耳、わずかに非対称な顔貌、右眼の非特異的な変性網膜病変など、最小限の所見であった。父親の両親と弟はこの突然変異を持たなかったことから、突然変異は父親でde novoに生じたことが示唆され、弟も軽度の非対称性難聴と軽度の形成不全の左外耳を有していた。

www.omim.org/entry/608892