ファンコニ貧血遺伝子検査パネル｜ミネルバクリニック

ATR, BRCA1, BRCA2, BRIP1, CXCR4, ERCC4, ERCC6L2, FANCA, FANCB, FANCC, FANCD2, FANCE, FANCF, FANCG, FANCI, FANCL, FANCM, MAD2L2, PALB2, RAD51, RAD51C, RFWD3, SLX4, UBE2T, XRCC2 ( 25遺伝子 )

各遺伝子の詳細：
・ATR遺伝子：
ATR（Ataxia Telangiectasia and Rad3-related）キナーゼをコードする遺伝子。DNA損傷応答シグナル伝達に重要な役割を果たします。

・BRCA1遺伝子：
乳がん・卵巣がんの原因遺伝子としても知られ、DNA修復、特に相同組換え修復に重要な役割を果たします。ファンコニ貧血の下流修復因子として機能します。

・BRCA2遺伝子：
BRCA1と同様に乳がん・卵巣がんの原因遺伝子としても知られ、RAD51との相互作用を通じて相同組換え修復に関与します。

・BRIP1遺伝子：
BRCA1と相互作用するタンパク質（BRCA1-Interacting Protein 1）をコードし、DNA修復に関与します。

・CXCR4遺伝子：
ケモカイン受容体をコードする遺伝子。FANCBの機能不全症例でWHIM症候群様の表現型を示すことがあります。

・ERCC4遺伝子：
XPF（Xeroderma Pigmentosum group F）タンパク質をコードし、DNA修復酵素として機能します。SLX4と複合体を形成してDNA鎖間架橋の切断に関与します。

・ERCC6L2遺伝子：
ERCC6様タンパク質2をコードし、DNA修復プロセスに関与します。

・FANCA遺伝子：
FAコア複合体の重要な構成要素をコードする遺伝子。欧米では最も頻度が高く（60-70％）、日本でも高頻度に変異が見られます。常染色体劣性遺伝形式をとります。

・FANCB遺伝子：
FAコア複合体の構成要素をコードする遺伝子。X染色体上に存在し、X連鎖遺伝形式をとる唯一のファンコニ貧血原因遺伝子です。

・FANCC遺伝子：
FAコア複合体の構成要素をコードする遺伝子。欧米では頻度が高いですが、日本ではほとんど見られません。常染色体劣性遺伝形式をとります。

・FANCD2遺伝子：
FANCIと共にID複合体を形成するタンパク質をコードする遺伝子。FAコア複合体によってユビキチン化され、DNA修復部位に局在します。常染色体劣性遺伝形式をとります。

・FANCE遺伝子：
FAコア複合体の構成要素をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式をとります。

・FANCF遺伝子：
FAコア複合体の構成要素をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式をとります。

・FANCG遺伝子：
FAコア複合体の構成要素をコードする遺伝子。日本人では一定数見られる重要な原因遺伝子です。常染色体劣性遺伝形式をとります。

・FANCI遺伝子：
FANCD2と共にID複合体を形成するタンパク質をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式をとります。

・FANCL遺伝子：
FAコア複合体のE3ユビキチンリガーゼ活性を持つタンパク質をコードする遺伝子。FANCD2とFANCIのユビキチン化を担います。常染色体劣性遺伝形式をとります。

・FANCM遺伝子：
FAコア複合体の構成要素をコードする遺伝子。DNAトランスロカーゼ活性を持ちます。常染色体劣性遺伝形式をとります。

・MAD2L2遺伝子：
MAD2L2（REV7）タンパク質をコードする遺伝子。DNA損傷バイパス経路に関与します。

・PALB2遺伝子：
BRCA2のパートナータンパク質（Partner and Localizer of BRCA2）をコードする遺伝子。BRCA2を核内に局在させ、相同組換え修復を促進します。常染色体劣性遺伝形式をとります。

・RAD51遺伝子：
相同組換え修復の中心的なタンパク質をコードする遺伝子。DNA二本鎖切断の修復に必須です。常染色体劣性遺伝形式をとります。

・RAD51C遺伝子：
RAD51パラログの一つをコードする遺伝子。相同組換え修復に関与します。常染色体劣性遺伝形式をとります。

・RFWD3遺伝子：
E3ユビキチンリガーゼをコードする遺伝子。相同組換えの制御タンパク質であるRPAおよびRAD51のユビキチン化を介した除去に関与します。常染色体劣性遺伝形式をとります。

・SLX4遺伝子：
複数のDNA修復経路で機能する足場タンパク質をコードする遺伝子。DNA鎖間架橋の切断に関与します。常染色体劣性遺伝形式をとります。

・UBE2T遺伝子：
E2ユビキチン結合酵素をコードする遺伝子。FANCLと共にFANCD2とFANCIのユビキチン化に関与します。常染色体劣性遺伝形式をとります。

・XRCC2遺伝子：
RAD51パラログの一つをコードする遺伝子。相同組換え修復に関与します。常染色体劣性遺伝形式をとります。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※この検査パネルでは、25の原因遺伝子のみを対象としています。約10％のファンコニ貧血症例では、既知の遺伝子に変異が見つかりません。検査で病原性変異が検出されなくても、疾患を完全に否定することはできません。染色体断裂試験などの機能的検査と併せて評価することが重要です。