外胚葉異形成症・関連疾患NGS遺伝子検査パネル｜ミネルバクリニック

ABCA5, ANTXR1, APCDD1, ARID1B, ATP6V1B2, AXIN2, BCS1L, CDH1, CDH3, CDSN, CLDN1, CRYL1, CTSC, CTSK, DLX3, DSG4, DSP, EDA, EDAR, EDARADD, ERCC2, ERCC3, ERCC8, EVC, EVC2, FGF10, FGFR2, FGFR3, GJA1, GJB2, GJB6, GRHL2, GTF2E2, GTF2H5, HOXC13, HR, IFT122, IFT43, IKBKG, INSR, JUP, KANK2, KAT6B, KCTD1, KDF1, KREMEN1, KRT1, KRT14, KRT16, KRT17, KRT25, KRT6A, KRT6B, KRT6C, KRT71, KRT74, KRT83, KRT85, KRT9, LEF1, LIPH, LPAR6, LSS, MBTPS2, MPLKIP, MSX1, NECTIN1, NECTIN4, NFKBIA, ORAI1, PEX1, PIGL, PKP1, POC1A, PORCN, PRKD1, RIN2, RIPK4, RNF113A, ROGDI, RPL21, SETBP1, SLC25A24, SMARCAD1, SMOC2, SNRPE, SOX18, SPINK5, TBC1D24, TBX3, TP63, TRAF6, TRPS1, TRPV3, TSPEAR, TWIST2, UBR1, WNT10A ( 98遺伝子 )

各主要遺伝子の詳細：
・EDA遺伝子：
エクトジスプラシンAをコードする遺伝子。X連鎖劣性遺伝形式で、低汗型外胚葉異形成症の最も頻度の高い原因遺伝子です。汗腺、毛髪、歯の発達に重要な役割を果たします。

・EDAR遺伝子：
エクトジスプラシンA受容体をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で低汗型外胚葉異形成症を引き起こします。EDAシグナル経路の一部です。

・EDARADD遺伝子：
EDAR関連死ドメインタンパク質をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で低汗型外胚葉異形成症を引き起こします。

・TP63遺伝子：
転写因子p63をコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式で、EEC症候群、AEC症候群、ADULT症候群、裂手裂足外胚葉異形成症候群などの原因となります。皮膚、毛髪、歯、爪、四肢の発達に重要です。

・WNT10A遺伝子：
Wntシグナル経路の分子をコードする遺伝子。常染色体優性または劣性遺伝形式で、歯牙形成不全を伴う外胚葉異形成症の原因となります。

・IKBKG遺伝子：
NF-κBシグナル経路の調節因子をコードする遺伝子。X連鎖遺伝形式で、低汗型外胚葉異形成症や色素失調症の原因となります。

・GJA1遺伝子：
コネキシン43をコードする遺伝子。常染色体優性遺伝形式で、皮膚、毛髪、歯の異常を伴う外胚葉異形成症の原因となります。

・FGFR2、FGFR3遺伝子：
線維芽細胞増殖因子受容体をコードする遺伝子。骨格異常を伴う外胚葉異形成症の原因となります。

・EVC、EVC2遺伝子：
繊毛タンパク質をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、軟骨外胚葉異形成症（Ellis-van Creveld症候群）の原因となります。短肢性低身長と外胚葉異形成を特徴とします。

・KRT遺伝子群：
ケラチンをコードする遺伝子群。掌蹠角化症を伴う外胚葉異形成症の原因となります。KRT1、KRT6A、KRT6B、KRT6C、KRT9、KRT14、KRT16、KRT17などが含まれます。

・GRHL2遺伝子：
転写因子をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、難聴を伴う外胚葉異形成症の原因となります。

・MSX1遺伝子：
ホメオボックス転写因子をコードする遺伝子。歯牙形成不全や口唇口蓋裂を伴う外胚葉異形成症の原因となります。

・DLX3遺伝子：
ホメオボックス転写因子をコードする遺伝子。毛髪、歯、骨の発達異常を伴う三叉頭蓋骨外胚葉異形成症の原因となります。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※この検査パネルでは、98の原因遺伝子のみを対象としています。外胚葉異形成症は遺伝学的に非常に多様であり、すべての症例で原因遺伝子が特定されるわけではありません。検査で病原性変異が検出されなくても、疾患を完全に否定することはできません。