嚢胞性肺疾患遺伝子検査（NGSパネル）｜ミネルバクリニック

EFEMP2, ELN, FBLN5, FLCN, LTBP4, SERPINA1, TSC1, TSC2 ( 8遺伝子 )

各遺伝子の詳細：
・EFEMP2遺伝子（fibulin-4）：
フィブリン4（fibulin-4）をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式の皮膚弛緩症1B型（ARCL1B）の原因遺伝子です。弾性線維の形成に重要な役割を果たし、変異により皮膚の弛緩、血管異常、肺気腫、骨折傾向などを引き起こします。

・ELN遺伝子：
エラスチン（elastin）をコードする遺伝子。弾性線維の主要構成成分であり、変異により常染色体優性遺伝形式の皮膚弛緩症や大動脈弁上狭窄症（Williams症候群）を引き起こします。肺気腫や気胸のリスクが高まります。

・FBLN5遺伝子（fibulin-5）：
フィブリン5（fibulin-5）をコードする遺伝子。弾性線維の形成に関与し、変異により常染色体劣性（まれに優性）遺伝形式の皮膚弛緩症1A型（ARCL1A）を引き起こします。皮膚弛緩、血管異常、肺気腫を特徴とします。

・FLCN遺伝子：
フォリクリン（folliculin）をコードする遺伝子。Birt-Hogg-Dubé症候群の原因遺伝子で、常染色体優性遺伝形式をとります。腫瘍抑制遺伝子として機能し、変異により線維毛包腫、肺嚢胞、腎腫瘍を生じます。肺嚢胞は両側性で下肺野・縦隔側優位に分布し、気胸のリスクが非常に高いことが特徴です。

・LTBP4遺伝子：
潜在性TGF-β結合タンパク質4（latent TGF-β binding protein 4）をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式の皮膚弛緩症1C型（ARCL1C）の原因遺伝子です。TGF-βシグナル伝達に関与し、変異により皮膚弛緩、肺気腫、横隔膜ヘルニア、憩室症などを引き起こします。

・SERPINA1遺伝子：
α1アンチトリプシン（alpha-1 antitrypsin）をコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式のα1アンチトリプシン欠損症の原因遺伝子です。プロテアーゼ阻害因子として機能し、変異により肺組織の破壊が進行し、若年性肺気腫（特に下葉優位）や肝疾患を引き起こします。喫煙により症状が著明に悪化します。

・TSC1遺伝子：
ハマルチン（hamartin）をコードする遺伝子。結節性硬化症の原因遺伝子の一つで、常染色体優性遺伝形式をとります。TSC2とともに細胞増殖を制御するmTOR経路を調節します。変異により全身の過誤腫、てんかん、知的障害、顔面血管線維腫、腎血管筋脂肪腫、肺リンパ脈管筋腫症（LAM）などを生じます。

・TSC2遺伝子：
チュベリン（tuberin）をコードする遺伝子。結節性硬化症の原因遺伝子の一つで、常染色体優性遺伝形式をとります。TSC1と複合体を形成してmTOR経路を制御します。TSC2変異はTSC1変異よりも症状が重い傾向があります。変異により全身の過誤腫、神経症状、腎病変、肺病変などを生じます。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※この検査パネルでは、8の原因遺伝子のみを対象としています。嚢胞性肺疾患の原因は多岐にわたり、他の遺伝子や非遺伝性の要因も関与することがあります。検査で病原性変異が検出されなくても、疾患を完全に否定することはできません。