頭蓋骨縫合早期癒合症(狭頭症)NGS遺伝子検査パネル｜ミネルバクリニック

ABCC9, ALPL, ALX1, ALX4, BMP4, CCBE1, CD96, CDC45, CEP120, CHST3, COLEC11, CYP26B1, EFNB1, ERF, ESCO2, FAM20C, FBN1, FGF3, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FREM1, GLI3, GPC3, IFT122, IFT140, IFT43, IGF1R, IHH, IL11RA, IMPAD1, IRX5, JAG1, KAT6A, LMX1B, MASP1, MEGF8, MSX2, OSTM1, P4HB, PHEX, POR, RAB23, RECQL4, RUNX2, SCARF2, SEC24D, SH3PXD2B, SKI, SOX6, SPECC1L, STAT3, TCF12, TCOF1, TGFBR1, TGFBR2, TMCO1, TWIST1, WDR19, WDR35, ZEB2, ZIC1 ( 62遺伝子 )

主要な遺伝子の詳細：

・FGFR1遺伝子：
線維芽細胞増殖因子受容体1をコードする遺伝子。ファイファー症候群、Jackson-Weiss症候群の原因となります。骨・軟骨の発生に重要な役割を果たします。

・FGFR2遺伝子：
線維芽細胞増殖因子受容体2をコードする遺伝子。クルーゾン症候群、アペール症候群、ファイファー症候群、Jackson-Weiss症候群、Beare-Stevenson症候群の原因となります。最も頻度の高い原因遺伝子の一つです。

・FGFR3遺伝子：
線維芽細胞増殖因子受容体3をコードする遺伝子。ミュンケ症候群の原因となります。Pro250Arg変異が最も多く、難聴を伴うことが特徴です。

・TWIST1遺伝子：
塩基性ヘリックス・ループ・ヘリックス（bHLH）転写因子をコードする遺伝子。セーテル・コーツェン症候群の原因となります。頭蓋神経堤細胞の発生に重要な役割を果たします。

・TCF12遺伝子：
転写因子12をコードする遺伝子。冠状縫合早期癒合症の原因となります。神経系と骨格系の発生に関与します。

・ERF遺伝子：
ETS2抑制因子をコードする遺伝子。ERF関連頭蓋縫合早期癒合症の原因となります。非症候群性および症候群性の両方に関連します。

・MSX2遺伝子：
ホメオボックス転写因子をコードする遺伝子。頭蓋骨の発生と骨化に重要な役割を果たします。

・ALX1遺伝子：
ホメオボックス転写因子をコードする遺伝子。前頭鼻形成不全症候群の原因となります。

・ALX4遺伝子：
ホメオボックス転写因子をコードする遺伝子。頭蓋変形に関与します。

・EFNB1遺伝子：
エフリンB1をコードする遺伝子。X連鎖遺伝形式で、頭蓋前鼻骨異形成症の原因となります。

・IHH遺伝子：
インディアンヘッジホッグをコードする遺伝子。軟骨・骨の発生に関与します。

・RUNX2遺伝子：
ランクス関連転写因子2をコードする遺伝子。鎖骨頭蓋異形成症の原因となります。骨芽細胞の分化に必須の転写因子です。
※IL11RAおよびRUNX2遺伝子については、現在の検査方法ではリピート伸長の評価は行いません。

・SKI遺伝子：
Skiがん遺伝子をコードする遺伝子。シュプリンツェン・ゴールドバーグ症候群に関連します。

・ZEB2遺伝子：
ジンクフィンガーE-box結合ホメオボックス2をコードする遺伝子。Mowat-Wilson症候群の原因となります。

・ZIC1遺伝子：
ジンクフィンガー転写因子をコードする遺伝子。頭蓋変形、前頭縫合早期癒合に関与します。

その他、ALPL、BMP4、CCBE1、CDC45、CEP120、CHST3、COLEC11、CYP26B1、ESCO2、FAM20C、FBN1、FGF3、FREM1、GLI3、GPC3、IFT122、IFT140、IFT43、IGF1R、IMPAD1、IRX5、JAG1、KAT6A、LMX1B、MASP1、MEGF8、OSTM1、P4HB、PHEX、POR、RAB23、RECQL4、SCARF2、SEC24D、SH3PXD2B、SOX6、SPECC1L、STAT3、TCOF1、TGFBR1、TGFBR2、TMCO1、WDR19、WDR35など、頭蓋骨・顔面の発生、骨化、軟骨形成、細胞分化などに関与する遺伝子が含まれます。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

遺伝子特有の注意事項：
・IL11RA遺伝子：現在の検査方法では、この遺伝子のリピート伸長の評価は行いません。
・RUNX2遺伝子：現在の検査方法では、この遺伝子の三塩基リピート伸長の評価は行いません。

※この検査パネルでは、62の原因遺伝子のみを対象としています。頭蓋骨縫合早期癒合症の約60～80％は非症候群性で原因不明であり、検査で病原性変異が検出されなくても、疾患を完全に否定することはできません。臨床診断が最も重要です。