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先天性心疾患遺伝子パネル検査

先天性心疾患遺伝子パネル検査

遺伝子パネル検査では、血液などの検体からDNAなどを取り出し、多数の遺伝子のセットに対して検査を行います。この遺伝子たちのセットをパネルと呼びます。

先天性心疾患(congenital heart disease; CHD)とは、心臓の働きに影響を与える、出生時に存在する心臓の構造的な問題です。先天性心疾患先天性疾患の中では最も一般的なもので、軽度から重度まで様々な種類があります。肺動脈閉鎖症や大動脈連鎖症など、一部の疾患は重大で、出生後すぐに治療が必要です。CHDは、超音波検査で出生前に、または出生直後に発見することができます。しかし、これらの検査で陰性であっても、先天性心疾患が存在しないことを意味するわけではありません。症状がに人生の後半に現れることもあるためです。患児に同様の先天性異常家族歴がある場合は、遺伝子検査が強く推奨されます。

先天性心疾患は孤立した所見である場合もあれば、症候群の一部として発生する場合もあります。先天性心疾患遺伝子パネルには、Noonan症候群、Holt-Oram症候群、原発性線毛運動不全症など、非症候性および症候性先天性心疾患に関連する遺伝子が含まれています。

この検査はどのような人に向いていますか?

このパネルは、先天性心疾患の個人歴や家族歴を持つすべての人に適しています。また、家族歴のある方で、お子さんの出産を考えている方は、お子さんのリスクを評価するためにこの検査を受けるとよいでしょう。

患者にとってどのような利点がありますか?

遺伝子検査は、CHDの原因を特定し、家族計画を支援するのに役立ちます。分子診断が確認された場合、他の身体系統のスクリーニングが必要であるかどうかが判断されます。子供が影響を受けるリスクが高いと判断された親は、妊娠前、出生前、出生後のスクリーニングや診断検査の選択肢を検討することができます。

先天性心疾患に関連する疾患の遺伝学的検査では、以下のことが可能です。

  • 適切な診断の確立または確認
  • 関連する症状が追加されるリスクを特定する
  • ファミリープランニングを支援する
  • 食事や運動など、ライフスタイルの変更を支援する
  • よりパーソナライズされた治療と症状管理を実現する
  • 家族に自分の危険因子について知らせる
  • 患者さんを関連するリソースやサポートにつなげる
  • 家族計画の選択肢を提供する

先天性心疾患遺伝子パネル検査の対象となる遺伝子

ACTC1, ACVR2B, AKT3, ALMS1, ARL6, ARMC4, B9D1, B9D2, BBS1, BBS10, BBS12, BBS2, BBS4, BBS5, BBS7, BBS9, BCOR, BRAF, CBL, CC2D2A, CCDC103, CCDC114, CCDC151, CCDC28B, CCDC39, CCDC40, CCDC65, CCNO, CEP290, CFAP298, CFAP53, CHD7, CITED2, CPS1, CRELD1, CYR61, DNAAF1, DNAAF2, DNAAF3, DNAAF4, DNAAF5, DNAH11, DNAH5, DNAH8, DNAI1, DNAI2, DNAL1, DRC1, DTNA, ELN, FLNA, FOXF1, FOXH1, GATA4, GATA6, GDF1, GJA1, GPC3, HAND1, HRAS, INVS, JAG1, KIF7, KRAS, LEFTY2, MAP2K1, MAP2K2, MCIDAS, MED13L, MKKS, MKS1, MMP21, MYH6, NEK8, NKX2-5, NKX2-6, NME8, NODAL, NOTCH1, NPHP3, NR2F2, NRAS, NSD1, NTRK3, OFD1, PIK3CA, PIK3R2, PITX2, PKD1L1, PTPN11, RAF1, RAI1, RBM10, RIT1, RPGRIP1L, SEMA3E, SHOC2, SMAD6, SOS1, SPAG1, TAB2, TBX1, TBX20, TBX5, TCTN2, TLL1, TMEM216, TMEM231, TMEM67, TRIM32, TTC8, WDPCP, ZFPM2, ZIC3, ZMYND10 ( 115遺伝子 )

Sequencing(塩基配列の決定)とDel/Dup(欠失/重複)が検査対象となります。

検査に必要な検体

検査に必要な検体は以下の通りです。

  • 血液
  • 唾液*
  • 口腔粘膜ぬぐい液*

*唾液・口腔ぬぐい液の場合、遠隔地の方でもオンライン診療(ビデオスルーでの診察の事をいいます)で遺伝カウンセリングをしたのち、検体を当院にお送りいただく形で、当院にお越しにならずに検査が可能です。遠方の方でもお受けいただけます。

検査の限界

全ての配列決定技術には限界があります。この検査は次世代シークエンサー(NGS)によって行われ、コード領域とスプライシングジャンクションを調べるためにデザインされています。次世代配列決定技術およびバイオインフォマティクス分析は、偽遺伝子配列または他の高度に相同な配列の寄与を優位に減少させますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において、病原性の対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を妨害する場合があります。サンガー法は、低品質スコアのバリアントを確認し適用範囲の基準を満たすために用いられます。整理されていれば、欠失/重複分析により、1つの全遺伝子(口腔ぬぐい液検体及び全血検体)を含み大きさが2つ以上の連続したエクソン(全血検体のみ)であるゲノム領域の変化を同定できます。この検査で単一エクソンの欠失または重複が時々同定されることがありますが、日常的に検出されるものではありません。同定された推定上の欠失または重複は、直交法(qPCRまたはMLPA)によって確認されます。このアッセイは、限定されるものではありませんが、転座または逆位・反復身長(例:トリヌクレオチドまたはヘキサヌクレオチド)・大部分の調節領域(プロモーター領域)または深部イントロン領域(エクソンから20bpを超える)における変化のような疾患を引き起こし得る特定のタイプのゲノム変化を検出しません。このアッセイは、体細胞モザイク現象または体細胞突然変異の検出のためにデザインまたは妥当性が確認されていません。

カバレッジ

遺伝子パネル検査の場合、カバレッジは96% at 20xとなるよう設計されています。

結果が出るまでの期間

3-5週間

検査費用

275,000円(税込)遺伝カウンセリング料金は別途30分16,500円(税込)かかります。

特記事項

遺伝子 特記事項
PIK3CA PIK3CA病原性変異体の大部分は接合後に発生し、そのためモザイクであるため、複数の組織を検査する必要がある場合があります。PIK3CA病原性変異体が検出されなかったとしても、示唆的な特徴を有する個人におけるPIK3CA関連分節性過成長障害の臨床診断を除外することはできない(PubMed:23946963)。
ZIC3 現在の検査方法では、この遺伝子のトリヌクレオチドリピート拡張は評価されない。

リファレンス

NIH: National Heart, Lung, and Blood Institute: What Are Congenital Heart Defects?

文責:仲田洋美(医師)

プロフィール

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プロフィール

この記事の筆者:仲田洋美(医師)

ミネルバクリニック院長・仲田洋美は、日本内科学会内科専門医、日本臨床腫瘍学会がん薬物療法専門医 、日本人類遺伝学会臨床遺伝専門医として従事し、患者様の心に寄り添った診療を心がけています。

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