先天性糖鎖合成異常症(CDG)・先天性グリコシル化異常症 遺伝子検査｜ミネルバクリニック

ALG1, ALG11, ALG12, ALG13, ALG2, ALG3, ALG6, ALG8, ALG9, ATP6V0A2, B3GLCT, B4GALT1, COG1, COG2, COG4, COG5, COG6, COG7, COG8, DDOST, DHDDS, DOLK, DPAGT1, DPM1, DPM3, GNE, MAGT1, MGAT2, MOGS, MPDU1, MPI, PMM2, RFT1, RPN2, SEC23B, SLC35A1, SLC35C1, SRD5A3, SSR4, TUSC3 ( 40遺伝子 )

各遺伝子の詳細：
・ALG1遺伝子：
マンノシルトランスフェラーゼをコードし、脂質結合オリゴ糖鎖の合成に関与します。ALG1-CDGは重症型が多く、乳児期発症の精神運動発達遅滞、筋緊張低下、てんかんを呈します。

・ALG2遺伝子：
α-1,3-マンノシルトランスフェラーゼをコードします。ALG2-CDGは稀な疾患で、重度の発達遅滞と多臓器症状を呈します。

・ALG3遺伝子：
α-1,3-マンノシルトランスフェラーゼをコードします。ALG3-CDGは重症型で、小頭症、てんかん、視神経萎縮を伴うことがあります。

・ALG6遺伝子：
α-1,3-グルコシルトランスフェラーゼをコードします。ALG6-CDGはPMM2-CDGに次いで頻度が高く、比較的軽症例が多い傾向があります。運動失調、てんかん、内斜視が特徴的です。

・ALG8遺伝子：
α-1,3-グルコシルトランスフェラーゼをコードします。ALG8-CDGは重症型で、肝病変や腎嚢胞を伴うことがあります。

・ALG9遺伝子：
α-1,2-マンノシルトランスフェラーゼをコードします。ALG9-CDGは軽症型から重症型まで幅広く、小頭症や骨格異常を伴うことがあります。

・ALG11遺伝子：
α-1,2-マンノシルトランスフェラーゼをコードします。ALG11-CDGは知的障害と運動失調が主症状です。

・ALG12遺伝子：
α-1,6-マンノシルトランスフェラーゼをコードします。ALG12-CDGは軽症例が多く、軽度の発達遅滞と運動障害を呈します。

・ALG13遺伝子：
UDP-N-アセチルグルコサミントランスフェラーゼサブユニットをコードします。X連鎖遺伝形式をとり、てんかんと知的障害が主症状です。

・ATP6V0A2遺伝子：
液胞型H+-ATPアーゼのサブユニットをコードします。ATP6V0A2-CDGは皮膚弛緩症と筋ジストロフィーを伴うことが特徴です。

・B3GLCT遺伝子：
β-1,3-グルコシルトランスフェラーゼをコードします。B3GLCT-CDGは重度の発達遅滞、低身長、免疫不全を伴います。

・B4GALT1遺伝子：
β-1,4-ガラクトシルトランスフェラーゼをコードします。B4GALT1-CDGは筋ジストロフィー様の症状を呈します。

・COG1-8遺伝子群：
COG（Conserved Oligomeric Golgi）複合体を構成するサブユニットをコードします。ゴルジ体での小胞輸送に関与し、各CDGは多臓器症状を呈します。COG1-CDGは肝病変と血液凝固異常、COG4-CDGは骨格異常、COG5-CDGは心臓異常が特徴的です。

・DDOST遺伝子：
オリゴ糖転移酵素複合体のサブユニットをコードします。DDOST-CDGは知的障害と小頭症が主症状です。

・DHDDS遺伝子：
デヒドロドリコール合成酵素をコードします。DHDDS-CDGは網膜色素変性症を伴うことが特徴です。

・DOLK遺伝子：
ドリコールキナーゼをコードします。DOLK-CDGは筋緊張低下、てんかん、心筋症を呈します。

・DPAGT1遺伝子：
UDP-N-アセチルグルコサミン-ドリコールリン酸GlcNAcトランスフェラーゼをコードします。DPAGT1-CDGは重度の発達遅滞、てんかん、低身長を伴います。

・DPM1遺伝子：
ドリコール-P-マンノース合成酵素をコードします。DPM1-CDGは筋緊張低下と運動失調が主症状です。

・DPM3遺伝子：
ドリコール-P-マンノース合成酵素複合体のサブユニットをコードします。DPM3-CDGは筋ジストロフィー様症状を呈します。

・GNE遺伝子：
UDP-N-アセチルグルコサミン2-エピメラーゼ/N-アセチルマンノサミンキナーゼをコードします。GNE-CDGは遠位型ミオパチーが特徴です。

・MAGT1遺伝子：
マグネシウムトランスポーターをコードします。MAGT1-CDGはX連鎖免疫不全症を呈します。

・MGAT2遺伝子：
N-アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIIをコードします。MGAT2-CDGは重度の発達遅滞、てんかん、顔面異形を伴います。

・MOGS遺伝子：
マンノシル-オリゴ糖グルコシダーゼをコードします。MOGS-CDGは重症型で、乳児期に死亡することもあります。

・MPDU1遺伝子：
マンノース-P-ドリコール利用不全タンパク質1をコードします。MPDU1-CDGは知的障害、てんかん、視覚障害を呈します。

・MPI遺伝子：
ホスホマンノースイソメラーゼをコードします。MPI-CDGは蛋白漏出性胃腸症、低血糖、肝線維症が特徴で、マンノース補充療法が有効な数少ないCDGの一つです。

・PMM2遺伝子：
ホスホマンノムターゼ2をコードします。PMM2-CDGは最も頻度が高く、全CDGの約70％を占めます。精神運動発達遅滞、筋緊張低下、運動失調、特徴的顔貌、眼科異常、皮膚症状、肝機能異常が認められます。

・RFT1遺伝子：
脂質結合オリゴ糖鎖のフリッパーゼをコードします。RFT1-CDGは聴覚障害と視覚障害を伴うことがあります。

・RPN2遺伝子：
オリゴ糖転移酵素複合体のサブユニットをコードします。RPN2-CDGは軽度の知的障害が主症状です。

・SEC23B遺伝子：
COPII小胞のコンポーネントをコードします。SEC23B-CDGは先天性赤血球形成異常性貧血II型を引き起こします。

・SLC35A1遺伝子：
CMP-シアル酸トランスポーターをコードします。SLC35A1-CDGは血小板減少症、免疫不全、出血傾向が特徴です。

・SLC35C1遺伝子：
GDP-フコーストランスポーターをコードします。SLC35C1-CDGは白血球接着不全症II型を引き起こし、反復感染症、精神運動発達遅滞、特徴的顔貌を呈します。

・SRD5A3遺伝子：
ステロイド5α-レダクターゼ3をコードします。SRD5A3-CDGは眼科異常（白内障、緑内障）、小脳萎縮、肝病変を伴います。

・SSR4遺伝子：
シグナル配列受容体δサブユニットをコードします。X連鎖遺伝形式で、知的障害と結合組織異常を呈します。

・TUSC3遺伝子：
オリゴ糖転移酵素複合体の制御因子をコードします。TUSC3-CDGは非症候群性知的障害を引き起こします。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

遺伝子特記事項：
ALG1遺伝子（NM_019109.4）のエキソン6-13は、高度に相同な領域の干渉により、当院の現在の検査方法では変異検出感度が低下する可能性があります。

※この検査パネルでは、40の原因遺伝子のみを対象としています。現在までに130種類以上のCDGが報告されており、検査で病原性変異が検出されなくても、疾患を完全に否定することはできません。また、トランスフェリンアイソフォーム分析などの生化学的検査で糖鎖異常が確認されているにもかかわらず、既知の遺伝子に変異が見つからない場合もあります。