先天性白内障NGS遺伝子検査パネル｜ミネルバクリニック

ABHD12, AGK, BEST1, BFSP1, BFSP2, CAV1, CHMP4B, CLPB, COL18A1, CRYAA, CRYAB, CRYBA1, CRYBA2, CRYBA4, CRYBB1, CRYBB2, CRYBB3, CRYGB, CRYGC, CRYGD, CRYGS, CTDP1, EPHA2, EYA1, FAM126A, FOXE3, FTL, FYCO1, GALK1, GCNT2, GFER, GJA3, GJA8, HSF4, JAM3, LEMD2, LIM2, LSS, MIP, MIR184, MSMO1, NHS, P3H2, PAX6, PITX3, PXDN, RDH11, SIL1, SIPA1L3, SIX6, SLC16A12, SLC33A1, TDRD7, UNC45B, VIM, WFS1 ( 56遺伝子 )

各遺伝子の詳細：
・クリスタリン遺伝子群（最重要）：
CRYAA（αA-クリスタリン）、CRYAB（αB-クリスタリン）、CRYBA1（βA1-クリスタリン）、CRYBA2（βA2-クリスタリン）、CRYBA4（βA4-クリスタリン）、CRYBB1（βB1-クリスタリン）、CRYBB2（βB2-クリスタリン）、CRYBB3（βB3-クリスタリン）、CRYGB（γB-クリスタリン）、CRYGC（γC-クリスタリン）、CRYGD（γD-クリスタリン）、CRYGS（γS-クリスタリン）
水晶体の透明性を維持する主要タンパク質をコードする遺伝子群。単独の先天性白内障の約50％でクリスタリン遺伝子変異が見つかります。核白内障を引き起こすことが多いです。

・水晶体構造タンパク質遺伝子：
BFSP1、BFSP2：水晶体線維タンパク質（ビーディン、ファキニン）をコードし、水晶体の構造維持に重要です。
MIP（別名AQP0）：水チャネルタンパク質をコードし、水晶体の透明性と形態維持に必須です。
LIM2：水晶体膜タンパク質をコードします。
VIM：ビメンチンをコードし、細胞骨格の維持に関与します。

・ギャップジャンクション遺伝子：
GJA3（コネキシン46）：細胞間コミュニケーションに重要で、核白内障や層状白内障を引き起こします。
GJA8（コネキシン50）：変異により重度の小眼球症、角膜強膜、核白内障を引き起こすことがあります。

・転写因子遺伝子：
PAX6：眼球発生に必須の主要調節遺伝子。白内障、虹彩低形成、黄斑形成不全、角膜混濁などを伴います。
PITX3：水晶体発生に重要で、前極白内障や小眼球症を引き起こします。
FOXE3：前眼部形成異常を伴う白内障の原因遺伝子です。
HSF4：熱ショック転写因子をコードし、核白内障や層状白内障を引き起こします。
SIX6：眼球発生に関与し、小眼球症を伴うことがあります。
EYA1：眼球・耳・腎臓の発生に関与し、聴覚障害や腎臓異常を伴うことがあります。

・代謝・ミトコンドリア関連遺伝子：
GALK1：ガラクトキナーゼをコードし、ガラクトース血症により白内障を発症します。新生児マススクリーニングで発見されることがあります。
AGK：センガーズ症候群（先天性白内障、肥大型心筋症、骨格筋ミオパチー、乳酸アシドーシス）の原因遺伝子です。
GFER：ミトコンドリア機能に関与します。
WFS1：ウォルフラム症候群（糖尿病、視神経萎縮、難聴、白内障）の原因遺伝子です。

・X連鎖遺伝子：
NHS：Nance-Horan症候群の原因遺伝子。X連鎖優性遺伝形式で、男性では重度の白内障、歯の異常、知的障害を、女性では軽度の白内障や歯の異常を伴います。

・その他の重要遺伝子：
EPHA2：受容体チロシンキナーゼをコードし、年齢関連白内障のリスク因子でもあります。
BEST1：カルシウム依存性塩化物イオンチャネルをコードし、網膜疾患を伴うことがあります。
COL18A1：コラーゲンをコードし、Knobloch症候群（高度近視、網膜剥離、後頭蓋骨欠損）の原因遺伝子です。
CAV1：カベオリンをコードし、肺線維症を伴うことがあります。
その他多数の遺伝子：ABHD12、CHMP4B、CLPB、CTDP1、FAM126A、FTL、FYCO1、GCNT2、JAM3、LEMD2、LSS、MIR184、MSMO1、P3H2、PXDN、RDH11、SIL1、SIPA1L3、SLC16A12、SLC33A1、TDRD7、UNC45Bなど、様々な細胞機能や代謝に関与する遺伝子が含まれます。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※この検査パネルでは、56の原因遺伝子のみを対象としています。先天性白内障は遺伝学的に非常に多様性が高く、約50〜75％の症例では遺伝的原因が特定されます。検査で病原性変異が検出されなくても、疾患を完全に否定することはできません。また、非遺伝性の先天性白内障（子宮内感染、代謝性疾患など）は本検査では検出されません。