コバラミン・ホモシステイン・メチオニン代謝異常症遺伝子検査｜ミネルバクリニック

ABCD4, ACSF3, ADK, AHCY, ALDH6A1, AMN, CBS, CD320, CTH, CUBN, DHFR, FOLH1, FOLR1, FTCD, GIF, GNMT, HCFC1, HIBCH, LMBRD1, MAT1A, MCEE, MLYCD, MMAA, MMAB, MMACHC, MMADHC, MTHFD1, MTHFR, MTR, MTRR, MUT, NFE2L2, PCCA, PCCB, PRDX1, SLC46A1, SUCLA2, SUCLG1, TCN2 ( 39遺伝子 )

各遺伝子の詳細：

・ABCD4遺伝子：
ペルオキシソームABCトランスポーターをコードする遺伝子。コバラミンのペルオキシソームへの輸送に関与します。

・ACSF3遺伝子：
アシルCoA合成酵素ファミリーメンバー3をコードする遺伝子。ミトコンドリアでのマロニルCoA合成に関与します。

・ADK遺伝子：
アデノシンキナーゼをコードする遺伝子。メチオニン代謝の調節に関与します。

・AHCY遺伝子：
S-アデノシルホモシステインヒドロラーゼをコードする遺伝子。メチオニン代謝における重要な酵素です。

・ALDH6A1遺伝子：
メチルマロン酸セミアルデヒド脱水素酵素をコードする遺伝子。バリン代謝に関与します。

・AMN遺伝子：
アムネスレスタンパク質をコードする遺伝子。内因子-ビタミンB12複合体の腸管吸収に必要です。

・CBS遺伝子：
シスタチオニンβ合成酵素をコードする遺伝子。ホモシスチン尿症I型の原因遺伝子です。ホモシステインをシスタチオニンに変換します。

・CD320遺伝子：
トランスコバラミン受容体をコードする遺伝子。細胞へのビタミンB12取り込みに関与します。

・CTH遺伝子：
シスタチオナーゼをコードする遺伝子。シスタチオニンをシステインに変換します。

・CUBN遺伝子：
キュビリンをコードする遺伝子。腎臓での内因子-ビタミンB12複合体の再吸収に関与します。

・DHFR遺伝子：
ジヒドロ葉酸還元酵素をコードする遺伝子。葉酸代謝に必須の酵素です。

・FOLH1遺伝子：
葉酸加水分解酵素1をコードする遺伝子。葉酸の分解と吸収に関与します。

・FOLR1遺伝子：
葉酸受容体1をコードする遺伝子。細胞への葉酸取り込みに関与します。

・FTCD遺伝子：
ホルミミノトランスフェラーゼシクロデアミナーゼをコードする遺伝子。ヒスチジンと葉酸代謝に関与します。

・GIF遺伝子：
内因子をコードする遺伝子。ビタミンB12の腸管吸収に必須です。欠損により悪性貧血を引き起こします。

・GNMT遺伝子：
グリシンN-メチルトランスフェラーゼをコードする遺伝子。メチオニン代謝の調節に関与します。

・HCFC1遺伝子：
宿主細胞因子C1をコードする遺伝子。X連鎖遺伝のコバラミン代謝異常症cblX型の原因遺伝子です。

・HIBCH遺伝子：
3-ヒドロキシイソブチリルCoAヒドロラーゼをコードする遺伝子。バリン代謝に関与します。

・LMBRD1遺伝子：
LMBR1ドメイン含有1をコードする遺伝子。コバラミン代謝異常症cblF型の原因遺伝子です。

・MAT1A遺伝子：
メチオニンアデノシルトランスフェラーゼIAをコードする遺伝子。メチオニンをS-アデノシルメチオニンに変換します。

・MCEE遺伝子：
メチルマロニルCoAエピメラーゼをコードする遺伝子。プロピオン酸代謝に関与します。

・MLYCD遺伝子：
マロニルCoAデカルボキシラーゼをコードする遺伝子。マロニルCoAの分解に関与します。

・MMAA遺伝子：
メチルマロン酸血症（コバラミン障害）cblAタイプをコードする遺伝子。アデノシルコバラミン合成に関与します。

・MMAB遺伝子：
メチルマロン酸血症（コバラミン障害）cblBタイプをコードする遺伝子。アデノシルコバラミン合成に関与します。

・MMACHC遺伝子：
メチルマロン酸血症とホモシスチン尿症cblCタイプをコードする遺伝子。最も頻度の高いコバラミン代謝異常症の原因遺伝子です。

・MMADHC遺伝子：
メチルマロン酸血症とホモシスチン尿症cblDタイプをコードする遺伝子。コバラミンの細胞内局在の振り分けに関与します。

・MTHFD1遺伝子：
メチレンテトラヒドロ葉酸脱水素酵素1をコードする遺伝子。葉酸代謝における多機能酵素です。

・MTHFR遺伝子：
メチレンテトラヒドロ葉酸還元酵素をコードする遺伝子。ホモシスチン尿症III型の原因遺伝子です。
※MTHFR遺伝子の2つの一般的な多型（c.665C>T（p.Ala222Val）およびc.1286A>C（p.Glu429Ala））は、ACMGの推奨に従い、臨床的有用性が不十分なため報告されません。

・MTR遺伝子：
メチオニン合成酵素をコードする遺伝子。ホモシステインをメチオニンに変換する酵素で、メチルコバラミンを補酵素として必要とします。

・MTRR遺伝子：
メチオニン合成酵素還元酵素をコードする遺伝子。メチオニン合成酵素の再活性化に関与します。

・MUT遺伝子：
メチルマロニルCoAムターゼをコードする遺伝子。メチルマロン酸血症の最も頻度の高い原因遺伝子です。

・NFE2L2遺伝子：
核内因子（赤血球由来2）様2をコードする遺伝子。酸化ストレス応答の調節に関与します。

・PCCA遺伝子：
プロピオニルCoAカルボキシラーゼα鎖をコードする遺伝子。プロピオン酸血症の原因遺伝子です。

・PCCB遺伝子：
プロピオニルCoAカルボキシラーゼβ鎖をコードする遺伝子。プロピオン酸血症の原因遺伝子です。

・PRDX1遺伝子：
ペルオキシレドキシン1をコードする遺伝子。酸化ストレスからの細胞保護に関与します。

・SLC46A1遺伝子：
プロトン共役葉酸トランスポーターをコードする遺伝子。腸管での葉酸吸収に関与します。

・SUCLA2遺伝子：
コハク酸CoAリガーゼADP形成β鎖をコードする遺伝子。ミトコンドリアDNA枯渇症候群の原因となることがあります。

・SUCLG1遺伝子：
コハク酸CoAリガーゼGDP形成α鎖をコードする遺伝子。ミトコンドリアDNA枯渇症候群の原因となることがあります。

・TCN2遺伝子：
トランスコバラミンIIをコードする遺伝子。血液中でのビタミンB12輸送タンパク質です。欠損により重篤な巨赤芽球性貧血を引き起こします。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※この検査パネルでは、39の原因遺伝子を対象としていますが、すべての症例で原因遺伝子が特定できるわけではありません。検査で病原性変異が検出されなくても、疾患を完全に否定することはできません。臨床症状と生化学検査に基づいた診断と管理が引き続き重要です。

※MTHFR遺伝子の2つの一般的な多型（c.665C>T（p.Ala222Val）およびc.1286A>C（p.Glu429Ala））は、ACMGの推奨に従い、臨床的有用性が不十分なため報告されません。