胆汁うっ滞（cholestasis）遺伝子検査｜ミネルバクリニック

ABCB11, ABCB4, ABCC2, ABCG5, ABCG8, AKR1D1, ALDOB, AMACR, ATP8B1, BAAT, CC2D2A, CFTR, CLDN1, CREB3L3, CYP27A1, CYP7A1, CYP7B1, DCDC2, DGUOK, DHCR7, EHHADH, EPHX1, FAH, GBA, GPBAR1, HNF1B, HSD17B4, HSD3B7, INVS, JAG1, LCT, LIPA, LMF1, MKS1, MPV17, MYO5B, NOTCH2, NPC1, NPC2, NPHP1, NPHP3, NPHP4, NR1H4, PEX1, PEX10, PEX11B, PEX12, PEX13, PEX14, PEX16, PEX19, PEX2, PEX26, PEX3, PEX5, PEX6, PEX7, PKHD1, POLG, SCP2, SERPINA1, SLC10A1, SLC10A2, SLC25A13, SLC27A5, SMPD1, TJP2, TMEM216, TRMU, UGT1A1, VIPAS39, VPS33B ( 72遺伝子 )

各遺伝子の詳細：
・ABCB11遺伝子：
PFIC2の原因遺伝子。胆汁酸トランスポーターBSEP（bile salt export pump）をコードし、肝細胞から胆汁酸を毛細胆管腔に分泌させます。

・ABCB4遺伝子：
PFIC3の原因遺伝子。MDR3 P糖タンパク質をコードし、胆汁中へのリン脂質分泌に関与します。

・ABCC2遺伝子：
MRP2タンパク質をコードし、ビリルビンや有機陰イオンの胆汁中への排泄に関与します。Dubin-Johnson症候群の原因遺伝子です。

・ABCG5、ABCG8遺伝子：
植物ステロールの排泄に関与し、シトステロール血症の原因遺伝子です。

・AKR1D1遺伝子：
5β-レダクターゼをコードし、胆汁酸合成に関与します。変異により胆汁酸合成障害を引き起こします。

・ATP8B1遺伝子：
PFIC1の原因遺伝子。FIC1タンパク質をコードし、肝細胞、小腸細胞において胆汁酸代謝に関わる核内受容体FXRの発現調節に関与します。

・BAAT遺伝子：
胆汁酸CoA:アミノ酸N-アシルトランスフェラーゼをコードし、胆汁酸の抱合に関与します。

・CFTR遺伝子：
嚢胞性線維症の原因遺伝子。塩化物イオンチャネルをコードし、胆汁うっ滞を伴うことがあります。

・CYP7A1、CYP7B1、CYP27A1遺伝子：
胆汁酸合成経路の酵素をコードし、変異により胆汁酸合成障害を引き起こします。

・HSD3B7、HSD17B4遺伝子：
胆汁酸合成経路の酵素をコードし、変異により胆汁酸合成障害を引き起こします。

・JAG1遺伝子：
アラジール症候群の主要原因遺伝子（約94％）。Notchシグナル伝達経路のリガンドであるJagged1をコードし、胆管の発達に重要な役割を果たします。

・NOTCH2遺伝子：
アラジール症候群の原因遺伝子（約1％）。Notch受容体をコードし、胆管発達に関与します。

・NR1H4遺伝子：
PFIC5の原因遺伝子。FXR（Farnesoid X receptor）をコードし、胆汁酸代謝の主要な調節因子です。

・TJP2遺伝子：
PFIC4の原因遺伝子。タイトジャンクションタンパク質ZO-2をコードし、毛細胆管の構造維持に関与します。

・MYO5B、VPS33B、VIPAS39遺伝子：
細胞内輸送に関与し、微絨毛封入体病や関節拘縮-腎機能障害-胆汁うっ滞症候群の原因となります。

・SERPINA1遺伝子：
α1-アンチトリプシンをコードし、その欠損症では肝疾患や肺気腫を引き起こします。

・UGT1A1遺伝子：
ビリルビンの抱合に関与し、Gilbert症候群やCrigler-Najjar症候群の原因遺伝子です。

・その他のPEX遺伝子群（PEX1、PEX2、PEX3、PEX5、PEX6、PEX7、PEX10、PEX11B、PEX12、PEX13、PEX14、PEX16、PEX19、PEX26）：
ペルオキシソーム形成障害症の原因遺伝子で、Zellweger症候群などを引き起こし、肝障害を伴うことがあります。

・その他の遺伝子：
代謝異常症（ガラクトース血症、チロシン血症、ミトコンドリア病など）や多臓器疾患に関連する遺伝子も含まれており、胆汁うっ滞を伴う疾患を包括的に評価できます。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※胆汁うっ滞には多様な原因があり、すべての原因遺伝子が同定されているわけではありません。検査で病原性変異が検出されなくても、疾患を完全に否定することはできません。また、薬剤性や感染症など、遺伝子以外の原因による胆汁うっ滞も存在します。