大脳皮質形成異常NGSパネル遺伝子検査｜ミネルバクリニック

ACTB, ACTG1, ADGRG1, ARFGEF2, ARX, ATP6V0A2, B3GALNT2, B3GNT2, DCX, DYNC1H1, ERMARD, FKRP, FKTN, GMPPB, KIF1BP, KIF2A, KIF5C, LAMC3, LARGE1, NDE1, OCLN, PAFAH1B1, POMGNT1, POMK, POMT1, POMT2, RAB18, RAB3GAP1, RAB3GAP2, RELN, RTTN, SNAP29, SRD5A3, TBC1D20, TUBA1A, TUBA8, TUBB2A, TUBB2B, TUBB3, TUBB4A, TUBG1, VLDLR ( 42遺伝子 )

主要な遺伝子の詳細：

・PAFAH1B1（LIS1）遺伝子：
古典的滑脳症の最も主要な原因遺伝子。神経細胞の移動に必須の機能を持つ。Miller-Dieker症候群では、この遺伝子を含む染色体17p13.3の欠失が認められる。重度の無脳回から軽度の厚脳回まで幅広い表現型を呈する。

・DCX遺伝子：
X連鎖性滑脳症の原因遺伝子。Doublecortinというタンパク質をコードし、神経細胞の移動に重要な役割を果たす。男性では重度の滑脳症、女性では皮質下帯状異所性灰白質を呈することが多い。

・TUBA1A遺伝子：
チューブリンαをコードする遺伝子で、神経細胞の移動や軸索伸長に重要。変異により滑脳症、多小脳回、小脳低形成など多様な脳形成異常を引き起こす。

・TUBB2A, TUBB2B, TUBB3, TUBB4A遺伝子：
チューブリンβをコードする遺伝子群。細胞骨格の構成要素として神経細胞の移動や分化に必須。変異により滑脳症、多小脳回、小脳低形成などを引き起こす。

・RELN遺伝子：
Reelinというタンパク質をコードし、大脳皮質の層構造形成に重要な役割を果たす。変異により滑脳症と小脳低形成を呈する。

・DYNC1H1遺伝子：
ダイニン重鎖をコードする遺伝子で、細胞内輸送に重要。変異により滑脳症、小脳低形成を引き起こす。

・ARX遺伝子：
X連鎖性の転写因子をコードする遺伝子。変異により滑脳症、異所性灰白質、知的障害などを引き起こす。

・POMT1, POMT2, POMGNT1, POMK, FKTN, FKRP遺伝子：
糖鎖転移酵素をコードする遺伝子群。ジストログリカン（α-dystroglycan）の糖鎖修飾に関与し、変異により筋ジストロフィーを伴う脳形成異常（筋・眼・脳病）を引き起こす。

・その他の重要遺伝子：
ACTB, ACTG1（アクチン）、KIF2A, KIF5C（キネシン）、NDE1（核分布因子）、VLDLR（VLDL受容体）、ADGRG1（GPR56）など、神経細胞の移動や増殖に関わる多様な遺伝子を含む。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※限局性皮質異形成（FCD）の一部で報告されている体細胞変異（MTOR遺伝子など）は、この検査では検出されません。体細胞変異の検査が必要な場合は、別途脳組織を用いた検査が必要となります。