小脳低形成NGSパネル遺伝子検査｜ミネルバクリニック

CASK, OPHN1, RARS2, SEPSECS, TSEN2, TSEN34, TSEN54, VRK1 ( 8遺伝子 )

各遺伝子の詳細：
・CASK遺伝子：
X連鎖性の遺伝形式をとり、calcium/calmodulin-dependent serine protein kinaseをコードする遺伝子。神経細胞のシナプス形成と機能に重要な役割を果たす。CASK遺伝子の変異は、主に女児に小脳低形成、小頭症、橋低形成、重度の知的障害、てんかんを引き起こす。

・OPHN1遺伝子：
X連鎖性の遺伝形式をとり、oligophrenin-1というRhoGTPase activating proteinをコードする遺伝子。神経細胞の樹状突起形成とシナプス可塑性に関与する。変異により小脳低形成、脳室拡大、てんかん、顔貌異常、知的障害を伴うX連鎖性知的障害症候群を引き起こす。

・RARS2遺伝子：
ミトコンドリアのarginyl-tRNA synthetaseをコードする遺伝子。ミトコンドリア内でのタンパク質合成に必須の酵素で、アルギニンをtRNAに結合させる。この遺伝子の変異により橋小脳低形成症6型（PCH6）を引き起こし、早期発症の脳症、小脳・橋の低形成、酸化的リン酸化障害が特徴的。常染色体劣性遺伝。

・SEPSECS遺伝子：
Sep（O-phosphoserine）tRNA:Sec（selenocysteine）tRNA synthaseをコードする遺伝子。セレノシステインの生合成に関与し、セレノプロテインの産生に必要。変異により橋小脳低形成症を引き起こす。常染色体劣性遺伝。

・TSEN2遺伝子：
tRNA splicing endonucleaseのサブユニットをコードする遺伝子。tRNAの成熟プロセスに必須の酵素で、イントロンを除去する役割を果たす。変異により橋小脳低形成症を引き起こす。常染色体劣性遺伝。

・TSEN34遺伝子：
tRNA splicing endonucleaseの別のサブユニットをコードする遺伝子。TSEN2と同様にtRNAの成熟に関与し、変異により橋小脳低形成症2型（PCH2）などを引き起こす。常染色体劣性遺伝。

・TSEN54遺伝子：
tRNA splicing endonucleaseの主要なサブユニットをコードする遺伝子。橋小脳低形成症の原因として最も頻度が高いTSEN遺伝子群の一つ。変異により橋小脳低形成症2型、4型、5型などを引き起こす。常染色体劣性遺伝。

・VRK1遺伝子：
vaccinia-related kinase 1をコードする遺伝子。セリン・スレオニンタンパク質キナーゼで、細胞周期の調節、ヒストンの修飾、神経細胞の増殖に必須。変異により橋小脳低形成症1A型（PCH1A）を引き起こし、脊髄前角細胞の変性による運動ニューロン機能障害が特徴的。常染色体劣性遺伝。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※この検査パネルでは、主要な8つの原因遺伝子のみを対象としています。これらの遺伝子で病原性変異が検出されなくても、他の稀な原因遺伝子の変異や、まだ同定されていない遺伝子変異の可能性があります。必要に応じて、追加の遺伝子検査について主治医とご相談ください。