骨髄不全症候群NGSパネル｜ミネルバクリニック

AP3B1, BRCA2, BRIP1, CSF3R, CXCR4, DKC1, ELANE, ERCC4, FANCA, FANCB, FANCC, FANCD2, FANCE, FANCF, FANCG, FANCI, FANCL, FANCM, G6PC3, GATA1, GATA2, GBA, GFI1, HAX1, LAMTOR2, LYST, MPL, NHP2, NOP10, PALB2, RAB27A, RAC2, RAD51C, RBM8A, RMRP, RPL11, RPL15, RPL26, RPL35A, RPL5, RPS10, RPS17, RPS19, RPS24, RPS26, RPS7, RTEL1, RUNX1, SBDS, SLC37A4, SLX4, SRP72, TAZ, TERC, TERT, TINF2, USB1, VPS13B, VPS45, WAS, WRAP53 ( 61遺伝子 )

ファンコニ貧血関連遺伝子群（22遺伝子）：
FANCA, FANCB, FANCC, FANCD2, FANCE, FANCF, FANCG, FANCI, FANCL, FANCM, BRCA2（FANCD1）, BRIP1（FANCJ）, PALB2（FANCN）, RAD51C（FANCO）, SLX4（FANCP）, ERCC4（FANCQ）, RAD51, XRCC2, MAD2L2, RFWD3, UBE2T, REV7
※DNA修復機構、特に鎖間架橋（ICL）修復経路に関与する遺伝子群です。

先天性角化不全症関連遺伝子群（11遺伝子）：
DKC1, TERC, TERT, NHP2, NOP10, TINF2, WRAP53（TCAB1）, RTEL1, CTC1, USB1, NAF1, POT1, ACD
※テロメア維持機構に関与する遺伝子群です。テロメラーゼ複合体やシェルタリン複合体の構成タンパク質をコードしています。

ダイアモンド・ブラックファン貧血関連遺伝子群（20遺伝子）：
RPS19, RPS24, RPS17, RPS7, RPS10, RPS26, RPL5, RPL11, RPL35A, RPL15, RPL26, RPS27A, RPS28, RPS29, RPL9, RPL18, RPL27, RPL31, RPL35, GATA1, TSR2, EPO
※リボソームの構成タンパク質（40S小サブユニットのRPSタンパク質、60S大サブユニットのRPLタンパク質）をコードする遺伝子群と、赤血球分化に重要なGATA1転写因子の遺伝子が含まれます。

その他の重要な骨髄不全関連遺伝子：

・SBDS遺伝子：
Shwachman-Diamond症候群の原因遺伝子。リボソーム生合成に関与し、好中球減少、膵外分泌機能不全、骨格異常を引き起こします。

・ELANE遺伝子：
重症先天性好中球減少症の最も頻度の高い原因遺伝子。好中球エラスターゼをコードし、常染色体優性遺伝形式をとります。

・HAX1遺伝子：
常染色体劣性遺伝形式の重症先天性好中球減少症（Kostmann症候群）の原因遺伝子。

・GFI1遺伝子：
転写因子をコードし、重症先天性好中球減少症の原因となります。

・CSF3R遺伝子：
顆粒球コロニー刺激因子（G-CSF）受容体をコードし、重症先天性好中球減少症の原因となります。

・G6PC3遺伝子：
グルコース-6-リン酸カタラーゼ3をコードし、重症先天性好中球減少症の原因となります。心奇形や泌尿器系異常を伴うことがあります。

・GATA2遺伝子：
転写因子GATA2をコードし、MonoMAC症候群（単球減少・非定型抗酸菌感染症）の原因となります。骨髄異形成症候群や急性骨髄性白血病への進展リスクが高いです。

・MPL遺伝子：
トロンボポエチン受容体をコードし、先天性無巨核球性血小板減少症の原因となります。

・RUNX1遺伝子：
転写因子RUNX1をコードし、家族性血小板異常症/急性骨髄性白血病素因の原因となります。

・CXCR4遺伝子：
ケモカイン受容体をコードし、WHIM症候群（疣贅・低ガンマグロブリン血症・感染症・骨髄球増加症）の原因となります。

・SLC37A4遺伝子：
グルコース-6-リン酸トランスポーターをコードし、糖原病Ib型の原因となります。好中球減少を伴います。

・WAS遺伝子：
X連鎖遺伝のウィスコット・アルドリッチ症候群の原因遺伝子。血小板減少、湿疹、免疫不全を三徴とします。

・GBA遺伝子：
ゴーシェ病の原因遺伝子。グルコセレブロシダーゼ欠損により血小板減少、貧血を呈します。

・AP3B1遺伝子：
Hermansky-Pudlak症候群2型の原因遺伝子。眼皮膚白皮症、出血傾向を特徴とします。

・LYST遺伝子：
Chediak-Higashi症候群の原因遺伝子。部分的眼皮膚白皮症、易感染性、好中球機能異常を特徴とします。

・RAB27A遺伝子：
Griscelli症候群2型の原因遺伝子。色素希釈症、免疫不全を特徴とします。

・RAC2遺伝子：
好中球機能異常症の原因遺伝子。低γグロブリン血症を伴います。

・LAMTOR2遺伝子：
免疫不全と色素希釈症を特徴とする疾患の原因遺伝子。

・VPS13B, VPS45遺伝子：
Cohen症候群など、発達遅滞や好中球減少を伴う症候群の原因遺伝子。

・TAZ遺伝子：
X連鎖遺伝のBarth症候群の原因遺伝子。拡張型心筋症、骨格筋症、好中球減少を特徴とします。

・RMRP遺伝子：
軟骨毛髪低形成症の原因遺伝子。低身長、骨格異常、貧血を特徴とします。

・RBM8A遺伝子：
血小板減少・橈骨欠損症候群（TAR症候群）の原因遺伝子。両側橈骨欠損と血小板減少を特徴とします。

・SRP72遺伝子：
骨髄不全と膵外分泌機能不全を特徴とする疾患の原因遺伝子。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※この検査パネルでは、61の原因遺伝子のみを対象としています。検査で病原性変異が検出されなくても、疾患を完全に否定することはできません。また、本パネルに含まれていない稀な原因遺伝子の変異は検出できません。

※テロメア長測定は本検査には含まれていません。先天性角化不全症が強く疑われる場合は、別途テロメア長測定の実施をご検討ください。