バーター症候群NGS遺伝子パネル検査｜ミネルバクリニック

AP2S1, ATP6V1B1, BSND, CA2, CASR, CLCNKA, CLCNKB, CLDN16, CLDN19, FXYD2, GNA11, HNF1B, HSD11B2, KCNJ1, KCNJ10, KLHL3, MAGED2, NR3C2, SCNN1A, SCNN1B, SCNN1G, SLC12A1, SLC12A2, SLC12A3, SLC26A3, SLC4A1, SLC4A4, WNK1, WNK4 ( 29遺伝子 )

各遺伝子の詳細：
・SLC12A1遺伝子：
Na-K-2Cl共輸送体（NKCC2）をコードする遺伝子。バーター症候群1型の原因。ヘンレ係蹄の太い上行脚で発現し、NaCl再吸収に重要な役割を果たします。

・KCNJ1遺伝子：
腎外髄カリウムチャネル（ROMK）をコードする遺伝子。バーター症候群2型の原因。カリウムの分泌に関与します。

・CLCNKB遺伝子：
塩素イオンチャネル（ClC-Kb）をコードする遺伝子。バーター症候群3型の原因。ヘンレ係蹄の太い上行脚と遠位尿細管に発現します。

・BSND遺伝子：
バーチンをコードする遺伝子。バーター症候群4型の原因。ClC-KaおよびClC-Kbチャネルの機能発現に必要で、変異により感音性難聴を必発で伴います。

・CLCNKA遺伝子：
塩素イオンチャネル（ClC-Ka）をコードする遺伝子。CLCNKB遺伝子と同時に変異がある場合、バーター症候群4b型（5型）となります。

・CASR遺伝子：
カルシウム感知受容体をコードする遺伝子。低カルシウム血症を伴うバーター症候群の原因となります。

・SLC12A3遺伝子：
Na-Cl共輸送体（NCCT）をコードする遺伝子。ギッテルマン症候群の原因。遠位尿細管でのNaCl再吸収に関与します。

・ATP6V1B1遺伝子：
H⁺-ATPaseのサブユニットをコードする遺伝子。遠位尿細管での酸分泌に関与し、難聴を伴うことがあります。

・SCNN1A, SCNN1B, SCNN1G遺伝子：
上皮性ナトリウムチャネル（ENaC）のサブユニットをコードする遺伝子。偽性低アルドステロン症1型（PHA1）の原因となります。

・NR3C2遺伝子：
ミネラルコルチコイド受容体をコードする遺伝子。偽性低アルドステロン症1型の原因となります。

・WNK1, WNK4遺伝子：
WNKキナーゼファミリーをコードする遺伝子。偽性低アルドステロン症2型（Gordon症候群）やバーター症候群類似の病態の原因となります。

・KLHL3遺伝子：
Kelch様タンパク質3をコードする遺伝子。偽性低アルドステロン症2型の原因となります。

・HSD11B2遺伝子：
11β-ヒドロキシステロイドデヒドロゲナーゼ2型をコードする遺伝子。見かけのミネラルコルチコイド過剰症候群（AME）の原因となります。

・CLDN16, CLDN19遺伝子：
クローディンをコードする遺伝子。家族性低マグネシウム血症の原因となり、バーター症候群類似の症状を呈します。

・FXYD2遺伝子：
Na-K-ATPaseの制御サブユニットをコードする遺伝子。低マグネシウム血症を伴う尿細管異常の原因となります。

・KCNJ10遺伝子：
内向き整流性カリウムチャネルをコードする遺伝子。EAST/SeSAME症候群の原因となります。

・CA2遺伝子：
炭酸脱水酵素IIをコードする遺伝子。骨硬化症と尿細管性アシドーシスを伴う症候群の原因となります。

・SLC4A1遺伝子：
陰イオン交換体1（AE1）をコードする遺伝子。遠位尿細管性アシドーシスの原因となります。

・SLC4A4遺伝子：
ナトリウム-重炭酸イオン共輸送体をコードする遺伝子。近位尿細管性アシドーシスの原因となります。

・SLC26A3遺伝子：
塩素/重炭酸イオン交換体をコードする遺伝子。先天性塩素性下痢症の原因となります。

・HNF1B遺伝子：
肝細胞核因子1βをコードする遺伝子。腎嚢胞・糖尿病症候群（RCAD）の原因となり、電解質異常を伴うことがあります。

・GNA11遺伝子：
Gタンパク質α11サブユニットをコードする遺伝子。低カルシウム血症と関連します。

・MAGED2遺伝子：
MAGE family member D2をコードする遺伝子。X連鎖性の電解質異常の原因となります。

・AP2S1遺伝子：
アダプタータンパク質複合体2のσ1サブユニットをコードする遺伝子。家族性高カルシウム血症性低カルシウム尿症3型の原因となります。

・SLC12A2遺伝子：
Na-K-2Cl共輸送体（NKCC1）をコードする遺伝子。難聴などの症状と関連します。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※この検査パネルでは、29の原因遺伝子のみを対象としています。検査で病原性変異が検出されなくても、疾患を完全に否定することはできません。また、二次的要因や他の先天性尿細管異常症に伴う偽性バーター症候群、偽性ギッテルマン症候群の可能性も考慮する必要があります。