B細胞陽性重症複合免疫不全症NGS遺伝子パネル検査｜ミネルバクリニック

ATM, CD247, CD3D, CD3E, CD8A, CHD7, CIITA, CORO1A, DOCK8, FOXN1, IL2RA, IL2RG, IL7R, JAK3, ORAI1, PNP, PTPRC, RFX5, RFXANK, RFXAP, RMRP, SP110, STAT5B, STIM1, TBX1, ZAP70 ( 26遺伝子 )

各遺伝子の詳細：
・ATM遺伝子：
毛細血管拡張性運動失調症の原因遺伝子。DNA修復に関与し、免疫不全を伴うことがあります。

・CD247遺伝子（CD3ζ）：
T細胞受容体複合体の構成成分であるCD3ζ鎖をコードします。常染色体劣性遺伝形式で、T-B+NK+ SCIDの原因となります。

・CD3D遺伝子（CD3δ）：
T細胞受容体複合体の構成成分であるCD3δ鎖をコードします。常染色体劣性遺伝形式で、T-B+NK+ SCIDの原因となります。

・CD3E遺伝子（CD3ε）：
T細胞受容体複合体の構成成分であるCD3ε鎖をコードします。常染色体劣性遺伝形式で、T-B+NK+ SCIDの原因となります。

・CD8A遺伝子：
CD8α鎖をコードし、細胞傷害性T細胞の機能に重要です。

・CHD7遺伝子：
CHARGE症候群の原因遺伝子で、免疫不全を合併することがあります。

・CIITA遺伝子：
MHCクラスII転写調節因子をコードし、MHCクラスII欠損症（bare lymphocyte syndrome）の原因となります。

・CORO1A遺伝子：
コロニン1Aをコードし、免疫細胞の機能に関与します。

・DOCK8遺伝子：
DOCK8欠損症の原因遺伝子で、複合免疫不全症を引き起こします。

・FOXN1遺伝子：
胸腺の発達に必須の転写因子をコードします。FOXN1欠損症では胸腺が形成されず、T細胞が欠損します。

・IL2RA遺伝子：
IL-2受容体α鎖（CD25）をコードします。欠損すると免疫調節障害を引き起こします。

・IL2RG遺伝子：
IL-2受容体共通γ鎖をコードする、X連鎖型SCIDの原因遺伝子です。IL-2、IL-4、IL-7、IL-9、IL-15、IL-21受容体の構成成分であり、最も頻度の高いSCID原因遺伝子です。表現型はT-B+NK-です。

・IL7R遺伝子：
IL-7受容体α鎖をコードします。常染色体劣性遺伝形式で、T細胞の発達と生存に必須です。表現型はT-B+NK+です。

・JAK3遺伝子：
ヤヌスキナーゼ3をコードし、共通γ鎖のシグナル伝達に必須の酵素です。常染色体劣性遺伝形式で、X-SCIDと同一の表現型（T-B+NK-）を示しますが、男女ともに発症します。

・ORAI1遺伝子：
カルシウムチャネルをコードし、免疫細胞の活性化に重要です。

・PNP遺伝子：
プリンヌクレオシドホスホリラーゼをコードし、その欠損はT細胞選択的な免疫不全を引き起こします。

・PTPRC遺伝子（CD45）：
タンパク質チロシンホスファターゼ受容体C型（CD45）をコードします。常染色体劣性遺伝形式で、リンパ球のシグナル伝達に重要です。表現型はT-B+NK+です。

・RFX5遺伝子：
MHCクラスII遺伝子の転写調節因子をコードし、MHCクラスII欠損症の原因となります。

・RFXANK遺伝子：
MHCクラスII遺伝子の転写調節に関与し、MHCクラスII欠損症の原因となります。

・RFXAP遺伝子：
MHCクラスII遺伝子の転写調節に関与し、MHCクラスII欠損症の原因となります。

・RMRP遺伝子：
軟骨毛髪低形成症の原因遺伝子で、免疫不全を合併します。

・SP110遺伝子：
核内タンパク質をコードし、免疫機能に関与します。

・STAT5B遺伝子：
シグナル伝達兼転写活性化因子5Bをコードし、成長ホルモンシグナルと免疫機能に重要です。

・STIM1遺伝子：
ストローマ相互作用分子1をコードし、カルシウムシグナルに関与します。

・TBX1遺伝子：
DiGeorge症候群（22q11.2欠失症候群）に関連し、胸腺低形成を伴う免疫不全を引き起こします。

・ZAP70遺伝子：
ゼータ鎖関連タンパク質キナーゼ70をコードし、T細胞のシグナル伝達に必須です。常染色体劣性遺伝形式で、CD8陽性T細胞が選択的に欠損します。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※この検査パネルでは、26の関連遺伝子のみを対象としています。B細胞陽性重症複合免疫不全症の全ての原因遺伝子をカバーしているわけではありません。検査で病原性変異が検出されなくても、疾患を完全に否定することはできません。臨床症状と免疫学的検査に基づいた診断と管理が引き続き重要です。